Diversidade microbiana

Apresentação em tema: "Diversidade microbiana"— Transcrição da apresentação:

1 Diversidade microbiana

2 Maior diversidade da vida é microbiana
Microrganismos vem se diversificando há cerca de 3,8 bilhões de anos, ao contrário dos macro-organismos que se diversificam há apenas 600 milhões anos. “A maior parte da diversidade microbiana ainda está para ser descoberta” Atlas e Bartha,1998

3 Diversidade bacteriana em placa dental humana.
Microbiana Diversidade bacteriana em placa dental humana. Estimativa da diversidade total na cavidade oral é de aproximadamente 500. Baseado no 16S DNA ribossômico (rDNA) J. Bacteriol. 2001;183(12):

4 O que é diversidade? É a variabilidade entre microrganismos em nível de genes, entre espécies e nos ecossistemas. (Convenção biológica da Biodiversidade, 1992, ECO-92). Esta definição unifica os três níveis tradicionais de diversidade entre seres vivos: diversidade genética - diversidade dos genes em uma espécie. diversidade de espécies - diversidade entre espécies. diversidade de ecossistemas - diversidade em um nível mais alto de organização, incluindo os outros níveis de variação.

5 Componentes da diversidade
Hierarquias Diversidade de ecossistemas Diversidade entre espécies Diversidade genética Populações Nichos Habitat Ecossistemas Paisagem Biomas Biosfera Indivíduo Espécie População Gênero Família Filo Reino Nucleotídeos Genes Cromossomos Indivíduos Populações ...

6 Quantificação da diversidade: efeitos de escala Whittaker, 1972
Diversidade alfa Dentro de uma comunidade ou de um habitat (local) Número de espécies (riqueza) em uma área delimitada e uniforme. Diversidade gama Número de espécies presentes em todos os habitats em uma região geográfica. Diversidade beta Ao longo de um gradiente, de um habitat para outro Relação entre a diversidade gama e alfa

7 Quantificação da diversidade: efeitos de escala
Exemplo: Imaginemos que queremos estudar adiversidade de fungos nas raízes de pínus. Selecionamos 3 exemplares de pínus e isolamos 5 fungos para cada exemplar de pínus: Pínus 1: espécies A, B, C, D, E Pínus 2: espécies A, C, G, I, S Pínus 3: espécies A, B, C H, T Temos assim uma diversidade alfa média de 5 espécies. No entanto, o número total de espécies de fungos é de 10 (A, B, C, D ; E, G, I, H, S, T): diversidade gama. Como se pode observar, em cada exemplar de pínus surgem novas espécies de fungos. A variação da composição de espécies numa região é a diversidade beta. É usada como uma medida de heterogeneidade.

8 Como se quantifica a diversidade beta?
Uma modificação da medida originalmente proposta por Whittaker (1972) é: beta = (gama / alfa ) – 1 Vejamos o exemplo anterior: beta = (10 / 5 ) – 1 = 1 Se tivermos uma situação de baixa heterogeneidade espacial, com as mesmas espécies ocorrendo em todos os locais: Pínus 1: espécies A, B, C, D, E Pínus 2: espécies A, B, C, D, E Pínus 3: espécies A, B, C, D, E Temos, alfa = 5; gama = 5 e, beta = (5 / 5 ) – 1 = 0 ou seja, é necessária uma substituição local de espécies ao longo de um gradiente regional para que tenhamos elevada diversidade beta e consequentemente uma elevada diversidade regional.

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10 Importância da diversidade microbiana
- Na produtividade dos ecossistemas É possível avaliar a produtividade de um solo avaliando a sua diversidade microbiana A diversidade microbiana aumenta a diversidade das plantas - Na sustentabilidade dos ecossistemas A diversidade tem um enorme impacto na dinâmica do ecossistema e na conservação do solo (evita erosão)

11 Dificuldades na avaliação
1. Amplitude da diversidade Áreas de mega diversidade - “hot spots” Carência de metodologias A diversidade microbiana é pouco conhecida, mas é maior do que a das plantas e animais Hot spot é uma área prioritária para conservação, de alta biodiversidade e ameaçada no mais alto grau. No Brasil são a Mata Atlântica e o Cerrado.

12 Cursos de água Exemplos Solo COMPLEXIDADE
Solo (rizosférico): 109 /g Cursos de água Doce: /mL Oceanos: /mL Solo COMPLEXIDADE diferentes genomas do tamanho de E. coli por grama

13 Número de espécies (x1.000) descritas e estimadas da riqueza específica para alguns grupos de organismos vivos Hawksworth & Kalin-Arroyo, 1995 organismo Espécie descrita Número estimado Precisão superior inferior trabalho Vírus 4 1000 50 400 Fraca Bactérias 3000 Fungos 72 2700 200 1500 Moderada Protozoários 40 60 Algas 150 Plantas 270 500 300 320 Boa Insetos 950 100000 2000 8000

14 Amplitude (cont.) < 5% das espécies foram isoladas em cultura pura (baseada em análises de DNA do ecossistema).

15 2. Questões taxonômicas Dificuldades
Conceito de espécie em bactérias? Discrepâncias entre espécies antigas e atuais Falta de taxonomistas particularmente em países com elevada diversidade. Países tropicais cobrem apenas 6 % da área do globo e incluem 50 % das espécies

16 Conceitos de espécie Espécie biológica - grupo de populações naturais que trocam material genético Espécie evolucionária - linhagem de populações que tem uma relação específica com antecessor e que dispõem de tendências evolutivas e históricas próprias. Espécie filogenética - menor grupo que dispõe do mesmo padrão de descendência e ancestralidade. Espécie de reconhecimento - menor grupo que se reconhece entre si para finalidade de cruzamento e fertilização. Morfológica, Coesão....

17 3. Questões metodológicas
Dificuldades 3. Questões metodológicas Uso de técnicas clássicas de cultura pura *Culturabilidade *Viáveis mas não cultiváveis Distribuição não homogênea no ambiente. Amostragem

18 Culturabilidade Ambiente Culturabilidade (%) Oceanos e mares 0,001-0,1
Águas continentais ,25 Lagos mesotróficos ,1-1 Estuários ,1-3 Lodos ativados Sedimentos ,25 Solo ,3

19 Salinas, vulcões e fontes termais
Culturabilidade PCR Archaea ocorrem em ambientes extremos Técnicas moleculares indicam sua presença em águas marinhas e doces Salinas, vulcões e fontes termais Não tendo ainda sido isoladas

20 4. A diversidade envolve dois componentes:
Dificuldades 4. A diversidade envolve dois componentes: Variedade Abundância relativa Quem são? Quantos são? O que acontece? Assim, nem sempre o número de espécies em uma comunidade é adequado para descrever diversidade. Portanto, as espécies não contribuem de maneira igual na estimativa de diversidade total.

21 5. Erosão da própria diversidade
Dificuldades 5. Erosão da própria diversidade A biodiversidade não é estática. É um sistema em constante evolução das espécies. A meia-vida média de uma espécie é de um milhão de anos: - 99% das espécies que já viveram na Terra estão hoje extintas.

22 Documentação Manual de Bergey Bactérias www.tolweb.org
Cada grupo tem uma referência que inclui todas as espécies isoladas em cultura pura. Cada espécie tem um tipo que determina o padrão. A maioria das espécies tem variabilidade (estirpes) Ex: Escherichia coli Manual de Bergey Bactérias

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24 Diversidade eucariontes
Protozoários Nematóides Algas Fungos Micro artrópodes

25 Protozoários ~ espécies?

26 Nematóides ~ espécies?

27 Algas ~ espécies?

28 Fungos ~ espécies?

29 Inesperada diversidade recentemente descoberta do picoplâncton (< 2µm) nos oceanos.
Elevou de forma surpreendente as estimativas de diversidade entre os eucariontes.

30 Teorias sobre diversidade
Especiação Fatores que controlam a diversidade Balanço entre: Taxas de extinção Como a abundância afeta este balanço? Diversidade genética elevada resulta da presença de populações elevadas que tem capacidade de sofrer elevadas taxas de mutações.

31 Solos/sedimentos versus marinhos/aquáticos
Outros fatores Competição por recursos limitados (C, N, P): “apenas melhores competidores persistem” Solos/sedimentos versus marinhos/aquáticos Parasitismo e predação reduzem a diversidade: “a medida que os melhores competidores aumentam suas populações, são mais afetados pelos predadores e parasitas” Protozoários e vírus

32 (Heterogeneidade de habitats)
Teoria dos nichos (Heterogeneidade de habitats) Duas espécies não podem coexistir se ocupam o mesmo nicho. O melhor competidor levará o pior à extinção. Habitats heterogêneos tem maior número de nichos do que habitats homogêneos.

33 Importância da diversidade nos ecossistemas
Para entender o papel da diversidade no funcionamento dos ecossistemas, realizaram-se experimentos mantendo os fatores abióticos constantes, manipulando-se apenas as espécies utilizadas. Os efeitos positivos da diversidade foram revelados na: Produtividade Decomposição Respiração total da comunidade Ciclagem, absorção e fluxo de nutrientes Resistência à invasão biológica Previsibilidade Estabilidade

34 Os experimentos demonstram uma variedade complexa de relações.
Surgiram várias hipóteses sobre os padrões observados.

35 Hipótese rebite: Certas espécies são críticas para a integridade de um ecossistema. Hipótese redundante (diversidade funcional) Existem espécies extras no ecossistema para épocas de estresse, proporcionando estabilidade. Uma mesma função é executada por diferentes espécies –resultado da diversidade genética.

36 Catalogamos e contamos os planetas que existem no Universo mas
não conseguimos ainda saber quantos seres vivos existem na Terra.

37 Apenas há poucos anos percebemos a importância dos microrganismos nos ecossistemas.
“Os microrganismos tem um papel ecológico muito mais importante no ambiente natural do que seus tamanhos pequenos sugerem” (Brock et al., 1988)

38 Microrganismos Elevado número de espécies
Os seres mais antigos no planeta 3,5 bilhões de anos de evolução Elevado número de nichos ocupados Elevada taxa de dispersão (cosmopolitas) Baixas taxas de extinção Transferência lateral

39 Ampla diversidade morfológica

40 Ampla diversidade genética

41 Ampla diversidade metabólica

42 Microrganismos são eficientes produtores primários

43 Microrganismos são pequenos ....
Mas ....

44 ... podemos contar ou detectar seus efeitos,

45 ... podemos vê-los a 800 Km de distância

46 Salinas Santa Pola - Espanha

47 Minas Rio Tinto - Espanha

48 Microrganismos Compreender a distribuição e ecologia básica de um dos grupos mais abundantes e diversos de organismos na Terra é ainda um item crucial e não resolvido na pesquisa ambiental.

49 Diversidade microbiana é a menos estudada
Maior parte dos trabalhos provem de estudos com insetos, plantas e aves (seres terrestres)

50 Importância da diversidade para o homem
Valor utilitário Uso direto Alimentos e medicinais Agentes de controle biológico Insumos industriais Ecoturismo Uso indireto Regulação atmosférica Regulação climática Ciclagem dos nutrientes Fotossíntese Formação e conservação do solo Valor não utilitário Manutenção para o futuro Valor intrínseco – questão de ética

51 Avaliação da diversidade
Não existe uma única forma, porém diversas medidas com diferentes facetas Próxima aula