Encontro Ciência 2010 FIL, Lisboa 05-07-2010 Transcriptómica e Genómica do Sobreiro: quais as vantagens do seu conhecimento? José Matos INRB/L-INIA (Grupo.

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1 Encontro Ciência 2010 FIL, Lisboa 05-07-2010 Transcriptómica e Genómica do Sobreiro: quais as vantagens do seu conhecimento? José Matos INRB/L-INIA (Grupo de Biologia Molecular)

2 Genética Molecular

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4 Transcriptómica Análise da expressão de todos os activos num dado tecido, num dado momento

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6 Consórcio Nacional 12 projectos (SOBREIRO/00##/2009) (Financiado pela FCT) 14 – Stress biótico: resposta radicular à infecção por P. cinnamomi 25 – Germinação das bolotas 15 - Análise transcriptómica da qualidade da cortiça e da diferenciação cambial em Quercus suber 33 – Stress abiótico: seca, stress salino e oxidativo 19 – Desenvolvimento dos gametófitos masculino e feminino 36 – Detecção e validação de polimorfismos 39 – Desenvolvimento foliar e abrolhamento 35 – Stress abiótico: stress térmico (calor e frio) 29 – Desenvolvimento do fruto e embrião 30 – Plataforma de Bioinformática 34 – Simbiose com micorrizas 17 – Produção da cortiça 38 – Qualidade da cortiça Total598,129 €

7 Parâmetros de Qualidade Melhoramento

8 Centro de Botânica Aplicada à Agricultura IICT Instituições envolvidas no consórcio

9 SOBREIRO/0014/2009 Universidade do Algarve Alfredo Jaime Morais Cravador Ana Cristina Hurtado de Matos Coelho Marília do Rosário Gonçalves Horta CEBAL Sónia Gonçalves Raquel Folgado Casado SOBREIRO/0014/2009 Universidade do Algarve Alfredo Jaime Morais Cravador Ana Cristina Hurtado de Matos Coelho Marília do Rosário Gonçalves Horta CEBAL Sónia Gonçalves Raquel Folgado Casado SOBREIRO/0019/2009 ISA-CBAA Maria Leonor Mota Morais Margarida Maria Pedro Rocheta UP- Centro de Geologia, Univ. Porto Maria Isabel de Pinho Pessoa de Amorim Plant Functional Biology - UM- Biofig Maria Manuela Ribeiro Costa SOBREIRO/0019/2009 ISA-CBAA Maria Leonor Mota Morais Margarida Maria Pedro Rocheta UP- Centro de Geologia, Univ. Porto Maria Isabel de Pinho Pessoa de Amorim Plant Functional Biology - UM- Biofig Maria Manuela Ribeiro Costa SOBREIRO/0029/2009 IBET Célia Miguel Margarida Oliveira Andreia Miguel Liliana Marum INRB Carolina Varela UALG José Leitão Mário Farinhó Cláudia Alabaça Jorge Carlier SOBREIRO/0029/2009 IBET Célia Miguel Margarida Oliveira Andreia Miguel Liliana Marum INRB Carolina Varela UALG José Leitão Mário Farinhó Cláudia Alabaça Jorge Carlier Equipas de investigação no consórcio

10 SOBREIRO/0038/2009 CEBAL Sónia Gonçalves, Tânia Almeida INRB Filomena Nóbrega, Rita Costa, Isabel Carrasquinho FFC/FC/UL Ana Margarida Fortes ISA Rita Teixeira SOBREIRO/0038/2009 CEBAL Sónia Gonçalves, Tânia Almeida INRB Filomena Nóbrega, Rita Costa, Isabel Carrasquinho FFC/FC/UL Ana Margarida Fortes ISA Rita Teixeira SOBREIRO/0017/2009 INRB Filomena Nóbrega, Rita Costa, Isabel Carrasquinho, Carolina Varela FFC/FC/UL Ana Margarida Fortes ISA Rita Teixeira CEBAL Sónia Gonçalves, Tânia Almeida SOBREIRO/0017/2009 INRB Filomena Nóbrega, Rita Costa, Isabel Carrasquinho, Carolina Varela FFC/FC/UL Ana Margarida Fortes ISA Rita Teixeira CEBAL Sónia Gonçalves, Tânia Almeida SOBREIRO/0034/2009 Plant Systems Biology Lab (FCUL) Mónica Sebastiana Maria Salomé Pais Molecular Cell Physiology Lab (UM) Teresa Lino Neto Rui Tavares SOBREIRO/0034/2009 Plant Systems Biology Lab (FCUL) Mónica Sebastiana Maria Salomé Pais Molecular Cell Physiology Lab (UM) Teresa Lino Neto Rui Tavares Equipas de investigação no consórcio

11 SOBREIRO/0033/2009 Plant Functional Biology UM Rui Tavares Teresa Lino Neto Herlânder Azevedo INRB Carolina Varela UALG José Leitão Mário Farinhó Cláudia Alabaça Jorge Carlier SOBREIRO/0033/2009 Plant Functional Biology UM Rui Tavares Teresa Lino Neto Herlânder Azevedo INRB Carolina Varela UALG José Leitão Mário Farinhó Cláudia Alabaça Jorge Carlier SOBREIRO/0035/2009 IBET Cândido Pinto Ricardo Margarida Oliveira Inês Chaves Isabel Abreu Nelson Saibo IICT José Cochicho Ramalho Ana Fortunato Ana Ribeiro SOBREIRO/0035/2009 IBET Cândido Pinto Ricardo Margarida Oliveira Inês Chaves Isabel Abreu Nelson Saibo IICT José Cochicho Ramalho Ana Fortunato Ana Ribeiro SOBREIRO/0030/2009 ITQB - Systems Biodynamics Andreas Bohn Aleix Badia IGC – Bioinformatics unit José Leal Isabel Neves Paulo Almeida SOBREIRO/0030/2009 ITQB - Systems Biodynamics Andreas Bohn Aleix Badia IGC – Bioinformatics unit José Leal Isabel Neves Paulo Almeida Equipas de investigação no consórcio

12 SOBREIRO/0036/2009 FCUL Octávio Paulo Dora Batista SOBREIRO/0036/2009 FCUL Octávio Paulo Dora Batista SOBREIRO/0039/2009 INRB/L-INIA José António Matos Fernanda Simões Diogo Mendonça Paula Sá Pereira IBET Jorge Paiva Maria João Gaspar ISA Helena Almeida Ana Isabel Rodrigues SOBREIRO/0039/2009 INRB/L-INIA José António Matos Fernanda Simões Diogo Mendonça Paula Sá Pereira IBET Jorge Paiva Maria João Gaspar ISA Helena Almeida Ana Isabel Rodrigues Equipas de investigação no consórcio SOBREIRO/0015/2009 IBET/IICT/ISA/FJLF Jorge Paiva José Carlos Rodrigues Pedro Fevereiro José Graça Susana Araújo Pedro Marques INRA-BIOGECO Christophe Plomion Gregoire Le Provost SOBREIRO/0015/2009 IBET/IICT/ISA/FJLF Jorge Paiva José Carlos Rodrigues Pedro Fevereiro José Graça Susana Araújo Pedro Marques INRA-BIOGECO Christophe Plomion Gregoire Le Provost

13 Microarrays, DNA chips

14 E o resto?

15 mtDNA

16 cpDNA

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21 Biodiversidade Fonte: Grupo Lobo. Foto: Sara Duarte

22 Biodiversidade jose.matos@inrb.pt Agradecimentos: Margarida Oliveira (slides do consórcio) Octávio Paulo (site do projecto ESTs) Todos os colegas do consórcio ESTs Grupo Lobo/CRLI/Sara Duarte (foto do lobo)

23 In the end we will conserve only what we love; we will love only what we understand; and we will understand only what we are taught. (Baba Dioum, Envyronmentalist in 1968.)