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Use of species and specimen data … or advantages in sharing data Dora Canhos

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Apresentação em tema: "Use of species and specimen data … or advantages in sharing data Dora Canhos"— Transcrição da apresentação:

1 Use of species and specimen data … or advantages in sharing data Dora Canhos (dora@cria.org.br)

2 Some assumptions... Scientific progress depends on open access to data and information Information and communication technology are provoking an evolution on scientific thinking and organization

3 Data sharing data Analysis / Synthesis Publications

4 What happens to the data? data Analysis / Synthesis Publication Time

5 The data pathway... data Publications Reports Thesis Web Pages Storage

6 Scientific publications Are vital for scientific progress They reflect the vision of the authors Facts interpreted at a certain time If the data is to be reinterpreted by the author or by future generations it has to be available

7 data Internet Interface A Interface B

8 More beliefs... Data and information that is freely and openly accessible promotes a greater return of the public investment, stimulates innovation and informed decisions The integration of data from different disciplines, geographic spaces, analyzed by researchers also from different fields of knowledge and of different cultural origin, opens the way to new questions and to innovation

9 Building the knowlege base on biodiversity Collective, multi and inter-disciplinary Requires an environment for global cooperation Depends on a comparative base of data and knowledge

10 How to promote data sharing? Cultural barriers (internet, informatics, …) Technological limitations (interoperability, archiving, …) Legal impediments (biosafety, access to biodiversity, …) It doesnt only depend on the will to share data.... Must be organized: data models, standards, protocols... Must be feasible (doable) Must be planned: adequate resources, expertise, infrastructure

11 Use of data Indicators: use, content Identifying data / information gaps Data cleaning Analysis


13 BIOTA/FAPESP The Biodiversity Virtual Institute Overall aim: inventory and characterize the biodiversity of the State of São Paulo, and define the mechanisms for its conservation and sustainable use. http://www.biota.org.br


15 Atlas SinBiota




19 The main goal of speciesLink was to build a distributed system integrating several biological collections and making their primary data available on the Internet. speciesLink Distributed Information System for Biological Collections http://splink.cria.org.br

20 DiGIR Portal virtual catalog users queries Collections (data providers) HTTP / XML SOAP DiGIR Provider DiGIR Provider DiGIR Provider HTTP / XML Regional Server DiGIR Provider




















40 occurrence data temperature rainfall …. Potential distribution modeling

41 Byrsonima subterranea Brad. & Mark. (Malpighiaceae) Espécie considerada extinta pela lista da flora ameaçada de extinção no estado de São Paulo (SMA-SP 1997)

42 Byrsonima subterranea Somente um registro de ocorrência Inclusão na lista de espécies ameaçadas do Estado de São Paulo Novo registro de ocorrência na Estação Ecológica de Assis Uso da modelagem para auxiliar na localização da espécie

43 Modelagem de nicho fundamental para espécies com distribuição restrita ou com poucos pontos de amostragem Estação Ecológica de Assis – SP Dra Giselda Durigan Cerrado e Floresta Estacional

44 Precipitação Média Anual Temperatura Média Anual Ponto original da espécie Ponto próximo ao ponto original Medida da distância no espaço ambiental Tomar a medida da distância ambiental (D) para todos os pontos da região de estudo Ponto de orígem: Floresta Estadual de Asssis – IF São Paulo Modelagem de nicho fundamental para espécies com distribuição restrita ou com poucos pontos de amostragem Espécie considerada provavelmente extinta - lista da flora ameaçada de exitnção no estado de São Paulo (SMA-SP 1997) Byrsonima subterranea Brad. & Mark. (Malpighiaceae)

45 Área cinza = baixa similaridade ambiental Área azul = alta similaridade ambiental Fragmentos de Cerrado

46 Corte do Modelo utilizando dados de solo Facilitar o trabalho de campo diminuindo a área de busca Registro de mais quatro ocorrência da espécie

47 Possíveis Projeções Geografia Ecologia Pontos de Ocorrência Algoritmo Precipitação Temperatura Modelo do Nicho Ecológico Previsão da Distribuição Nativa Projeção sobre Clima Modificado Projeção sobre clima alterado Previsão de Invasão Projeção sobre outra região

48 Distribuição potencial no presente no 1% aumento anual de CO 2 0.5% aumento anual de CO 2 Modelagem para espécies arbóreas do cerrado: presente e 2 cenários futuros considerando mudanças climáticas hotspot

49 Crotalaria pallida (FABACEAE) Região Nativa

50 Crotalaria pallida (FABACEAE) Área de Invasão

51 Scenario involving the use of standards and protocols descriptive data nomenclature taxonomy modeling Data quality maps primary data education research Decision making Biological collection

52 Building data infrastructure Is a collective effort.....

53 Obrigada Dora Ann Lange Canhos (dora@cria.org.br) http://splink.cria.org.br http://www.cria.org.br

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