A apresentação está carregando. Por favor, espere

A apresentação está carregando. Por favor, espere

BCM13042 Fundamentos de Análises de Proteínas Docentes –Célia R Carlini –Charley C. Staats –Diogo R Demartini –Hugo Verli Súmula –Aminoácidos e peptídeos:

Apresentações semelhantes


Apresentação em tema: "BCM13042 Fundamentos de Análises de Proteínas Docentes –Célia R Carlini –Charley C. Staats –Diogo R Demartini –Hugo Verli Súmula –Aminoácidos e peptídeos:"— Transcrição da apresentação:

1 BCM13042 Fundamentos de Análises de Proteínas Docentes –Célia R Carlini –Charley C. Staats –Diogo R Demartini –Hugo Verli Súmula –Aminoácidos e peptídeos: estrutura; estereoquímica; propriedades físico-químicas; curva de titulação; ponto isoelétrico; ligação peptídica –Proteínas: arquitetura de proteínas; tipos de estrutura secundária; enovelamento; modificações pós-traducionais; mobilidade eletroforética; flexibilidade; catálise –Métodos para determinação da estrutura de proteínas: RMN; cristalografia de raios-X; Dicroísmo circular –Espectometria de massas: metodologias de ionização; metodologias de análise. –Métodos para determinação da quantidade de proteínas: gravimétrico; absorbância; fluorescência; ninhidrina; biureto; lowry; azul de comassie; acido bicinchônico. –Métodos de separação, purificação se sequenciamento de proteínas, peptídeos e aminoácidos: precipitação; salting in; salting out; eletroforese; cromatografia liquida, ultracentrifugação; química de Edman; métodos de separação de aminoácidos.

2 BCM13042 Fundamentos de Análises de Proteínas 22/11 Aminoácidos e peptídeos: Charley 23/11 Estrutura e determinação da estrutura de proteínas: Hugo 24/11 Métodos de quantificação, análise e purificação de proteínas: Célia 25/11 Espectrometria de massas e proteômica 29/11 – 02/12 Seminários –1 tópico por dia –5 grupos por tópico

3 Tópico 1 – Métodos de Análise e Caracterização de Peptídeos 1.Papéis Biológicos de D-Aminoácidos 2.Determinação de sequencia de aminoácidos/peptídeos (Edman, MS-MS, Dansylação) 3.Assinalamento de padrões (bioinformática) 4.Modificações pós-traducionais: tipos, funções e impactos em análises 5.Síntese de peptídeos para avaliação biológica Tópico 2 – Métodos de Análise e Caracterização de Peptídeos 6.Eletroforeses (1D, 2D, nativa, zimogramas) 7.Cromatografia (troca iônica, hidrofóbica, fase reversa, afinidade) 8.Metodologias de quantificação de proteínas 9.Precipitação fracionada 10.Métodos Imunoquímicos Tópico 3 – Espectrometria de massas e proteômica 11.MudPit / GELC – MS 12.Proteômica quantitativa comparativa 13.Metaloproteômica 14.Fosfoproteômica 15.Interatoma Tópico 4 – Determinação de estrutura 16.RMN 17.Dicroísmo circular 18.Fluorometria 19.Cristalografia – Raios X 20.Determinação de motivos estruturais

4 BCM13042 Fundamentos de Análises de Proteínas Avaliação Apresentação de 1 item referente a cada tópico Respostas aos questionários aplicados pelos colegas Cada aluno deverá formular 1 questão sobre o item apresentado Os demais alunos deverão escolher 2 questões referentes a cada tópico para responder As questões devem ser embasadas em um artigo científico. Espera-se que a questão seja formulada a partir de um gráfico ou tabela presente no artigo científico. O autor da questão será responsável pela correção. Aulas serão disponibilizadas junto ao endereço

5 Sorteio

6 Amino-Ácidos

7 Estrutura geral dos Aminoácidos

8 Quantos aminoácidos existem em sistemas biológicos?

9 20 aminoácidos definidos por seu códon no mRNA Grupo R 5 grupos distintos 2 aminoácidos não usuais Inserção depende de um elemento cis no mRNA

10

11

12

13

14

15 Apolar - lipídico Polar - aquoso

16 Selenocystein Pyrrolysine

17

18 Hypothetical scheme for the cotranslational insertion of pyrrolysine in response to a context- dependent UAG codon. Ibba M, Söll D Genes Dev. 2004;18: ©2004 by Cold Spring Harbor Laboratory Press

19

20 Formação de pontes de enxofre

21

22 carbon is a chiral center carbon is a chiral center Two stereoisomers are called enantiomers. The solid wedge-shaped bonds project out of the plane of paper, the dashed bonds behind it. The horizontal bonds project out of the plane of paper, the vertical bonds behind. Estereoisomeros

23 The Stereochemistry of Amino Acids

24 D-aminoácidos existem e são metabolizados

25

26

27

28 Serine-racemase

29

30

31 D-amino ácidos em proteínas?

32 Características físico-químicas dos aminoácidos

33 Absorbância na região UV de aminoácidos aromáticos

34 Changes in low density lipoprotein receptor intrinsic tryptophan fluorescence upon calcium addition. Dirlam-Schatz K A, Attie A D J. Lipid Res. 1998;39: ©1998 by American Society for Biochemistry and Molecular Biology Estudos conformacionais – Try fluorescence

35 Zwitterion = íon híbrido

36 Voet Biochemistry 3e © 2004 John Wiley & Sons, Inc.

37 Efeito sobre o pKa do ambiente químico

38 Protonated formUnprotonated form (conjugate base) Henderson/Hasselbach equation and pK a HA H + + A - K a = [H + ] [A - ] / [HA] [H + ] = K a [HA]/ [A - ] -log [H + ] = -log (K a [HA]/ [A - ]) -log [H + ] = -log K a -log ([HA]/ [A - ]) pH = p K a - log ([HA]/ [A - ])

39 Titulação de um aminoácido

40 Curva de titulação Glutamato

41 Curva de titulação> Histidina Anel indólico

42 Peptídeos

43 Formação da ligação peptídica

44 Níveis estruturais das proteínas

45 Como se definem estruturas secundárias?

46

47 Ligação peptídica tem 50% de carácter de dupla ligação rígida e coplanar Ressonância eletrônica Distâncias interatômicas na ligação peptídicas são menores que as de uma ligação amida comum

48 Cadeias laterais Ângulos de rotação da cadeia polipeptítica em torno de um carbono alfa

49 ABCD E F Gráfico de Ramachandran AB C D E F

50 O que é um domínio protéico?

51 Procura de domínios conservados

52

53

54

55

56

57

58 Localização da proteína pode trazer informações sobre a sua função

59

60

61

62

63

64

65


Carregar ppt "BCM13042 Fundamentos de Análises de Proteínas Docentes –Célia R Carlini –Charley C. Staats –Diogo R Demartini –Hugo Verli Súmula –Aminoácidos e peptídeos:"

Apresentações semelhantes


Anúncios Google