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PublicouGabrielle Troia Alterado mais de 10 anos atrás
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Elisa: quantificação de proteínas e moléculas
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Elisa: quantificação de proteínas e moléculas
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Sistema Duplo-Híbrido de Levedura
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Sistema Híbrido-Simples: identificar proteínas que ligam ao DNA
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Sistema Híbrido-Simples
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Sistema Híbrido-Simples
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Sistema Híbrido-Simples
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1. Reagents interacting with DNA*
(a) Alkylating agents: Dimethyl sulphate, Mitomycin C, Nitrogen and sulphur mustards (b) Intercalating agents: Acridine dyes, Actinomycins, Adriamycin, Anthracenes Benzpyrene, Ethidium bromide, Propidium diiodide (c) Intertwining agents Distamycin, Netropsin 2. Analogues of bases, Acyclovir ,Adenine /3‑1‑D‑arabinoside, Amethopterin Aminopterin, 2‑aminopurine, Aphidicolin, 8‑azaguanine, Azaserine 6‑azauracil, 2'azido‑2'‑deoxynucleosides, 5‑bromodeoxycytidine Cytosine /3‑1‑D‑arabinoside, Diazooxynorleucine, Dideoxynucleosides 5‑fluorodeoxycytidine, 5‑fluorodeoxyuridine, 5‑fluorouracil, Hydroxyurea 6‑mercaptopurine 3. Inhibitors of topoisomerases: Coumericin, Nalidixic acid, Novobiocin, Oxolinic acid 4. Inhibitors of cell division: Colcemid, Colchicine, Vinblastine , Vincristine 2nd messengers/inhibitors dibut cA/GMP: [active] 1mM, Sigma B1381 Ca ionophore: [active] 5mM, Sigma 7272 PMA: [active] 10mM, Froskolin: [active] 10mM, Protein synthesis inhibitors cycloheximide: [active] 20mM, Boe chloramphenicol: [active] 100mM, Sigma anisomycin: [active] 60mM, Sigma A9789
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GFP: green fluorescent protein
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Microscopia confocal: estudo das células vivas
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Actina F nas células da pele do bulbo da cebola: transformação transiente utilizando
A actina fundida a proteína gfp Ela está presente nas invaginações e envolta do núcleo
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Invaginações e dinâmica do núcleo
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Reconstrução tridimensional da topologia do retículo endoplasmático
Nas plantas transgênicas expressando gfp
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Luciferinas
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Luciferinas
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Luciferinas
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Luciferinas
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Luciferinas
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para fluorescencia:::
Planta transgênica Promotor da GA20 ox fundido ao gene da luciferina Pulverização com luciferina Câmera CCD para fluorescencia::: superimposição de imagens
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Luciferinas: uso simultâneo de diferentes
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Luciferinas: Uso
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Luciferinas: Uso
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Luciferinas: Uso
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Aequoporina: Estudo das alterações na Concentração de cálcio
In vivo e em tempo real, Por um método não-destrutivo
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Frio: “manchas” de aumento de calcio
em resposta a baixas temperaturas
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Fluoróforos utilizados para medir a [Ca2+] intracelular
Tempo após redução do Ca2+ do meio e o citosólico e fechamento do estômato Fluoróforo indo-1 Fura2:::gradiente de Ca2+ citosólico:::abundância canais de calcio na extremidade Fluoróforos utilizados para medir a [Ca2+] intracelular Efeito Luz vermelha:::protoplasto de folha de trigo:::Fluro-3:::tempo após adição do fluoróforo Efeito do GA e do ABA nos níveis de Ca2+ em protoplastos da camada de aleurona da cevada Tipos: 1) Fuoróforos monovalentes (single-wavelenghth dyes): continuam a ter a fluorescência no mesmo comprimento de onda Fluorescência dependente da [fluoróforo]: determinação semi-quantititiva do Ca2+: Ex: fura-3 e “calcio-verde”:semi-quantitativos, precisam de luz de menor intensidade (menos dano) 2) Fuoróforos polivalentes (ratio dyes): mudam o comprimento de onda da fluorescência quanto excitados Fluorescência independente da [fluoróforo]: precisão na determinação do Ca2+: Ex: fura-2 e indo 1 (polivalentes):precisão na determinação do Ca2+: precisam maior intensidade luminosa (maior dano;experimentos mais curtos)
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Confecção de Bibliotecas
Estudo da expressão diferencial dos genes: Confecção de Bibliotecas de Subtração
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Checando a eficiência da subtração
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Confirmando a presença de uma proteína em um compartimento citosólico
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Hibridização in situ: FISH (Fluorescent In Situ Hybridization)
Mapeamento de genes Estudo da estrutura do cromossoma Estudos citogenéticos: translocação, recombinação, etc.
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Manipulação de substâncias ativas “enjauladas” (caged)
Efeito da liberação do ABA “enjaulado” após microinjeção em células-guarda Manipulação de substâncias ativas “enjauladas” (caged) Manipulação de cálcio Enjaulado: calcio controla a orientação de crescimento do tubo polínico (crescimento só no ápice) Nucleotídeos Queladores Mensageiros secundários Peptídeos Canais de Ca2+ que Respondem ao IP3 no estômato, pólem, etc.
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Formas de enjaular um peptídeo ou proteína
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Outros sistemas modelos opcionais à Arabidopsis
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Phiscomitrella
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Phiscomitrella
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Phiscomitrella
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Phiscomitrella GFP-talina
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Estudo da Estrutura de um promotor
1) Análise por deleção
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Estudo da Estrutura de um promotor
2) Análise por mutagênese
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Estudo da Estrutura de um promotor
3) Análise por transativação
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