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Laboratório de Bioinformática LABINFO - LNCC Claudia Barros Monteiro-Vitorello.

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Apresentação em tema: "Laboratório de Bioinformática LABINFO - LNCC Claudia Barros Monteiro-Vitorello."— Transcrição da apresentação:

1 Laboratório de Bioinformática LABINFO - LNCC Claudia Barros Monteiro-Vitorello

2 Bioinformática emprega métodos computacionais, matemáticos e estatísticos para analizar dados biológicos Informática Estatística Química Matemática Física Biologia

3 DNA Nucleotídeos Cromossomos Genes

4 AnoFato 1871Descoberta dos ácidos nucléicos 1930Introdução da palavra genoma 1944DNA material genético em todos os seres vivos 1953Dupla hélice do DNA 1960sElucidação do código genético 1977Seqüenciamento do DNA 1986Seqüenciamento do DNA automatizado 1995Primeiro genoma de bactéria seqüenciado (Haemophilus influenza) 1999Primeiro cromossomo humano seqüenciado (cromossomo 22) 2000Genomas Drosophia / Arabidopsis / Xylella 2000Criação do LABINFO 2001Genomas humano e camundongo

5 Seqüenciamento de genomas completos Crescimento do GenBank Pares de bases de DNA (bilhões) Seqüências (milhões) 36,553,368,485 30,968,418 Revisão: May 4, 2004.

6 Banco de dados automatizados para: Armazenar e Organizar Desenvolvimento de metodologias estatísticas e computacionais para análise dos dados : Visualizar e Analisar

7 PesquisaDesenvolvimento de metodologias matemáticas e computacionais para as áreas da genômica e pós-genômica.Pesquisa : Desenvolvimento de metodologias matemáticas e computacionais para as áreas da genômica e pós-genômica. Projetos: Desenvolvimento de um ambiente computacional dentro de projetos genomas.Projetos : Desenvolvimento de um ambiente computacional dentro de projetos genomas. Recursos Humanos: Treinamento de pessoal especializado na área de bioinformática.Recursos Humanos: Treinamento de pessoal especializado na área de bioinformática. LABINFO

8 Chromobacterium violaceum Chromobacterium violaceum (CV) bacterium frequently found in the soil and water of subtropical regions. The most notable characteristic of CV is the production of a purple pigment, known as violacein, that exhibits trypanocidal and antibiotic activity. The CV is one of the few microorganisms that has the capacity to synthesise the 3-hydroxyvalerate homopolymer (polyhydroxyvalerate), as well as other short-chain polyhydroxyalkanoates (PHAs). PHAs represent an excellent alternative to plastics derived from petrochemicals. It has been studying the physiology and metabolism of CV since 1990 with the aim of optimising culture conditions for the production of metabolites of pharmacological or biotechnological interest. Projeto CNPq: Edital Genoma

9 INPA UAM UFPA UFC UFRN UFRPE UFAL UFGO UCB UNB EMBRAPA UFMG UESC LNCC UFRJ INCA Ludwig FAT USP FCAV UFPR PUC EMBRAPA UFSC PUC UFRGS LNCC


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