EVOLUÇÃO unesp Disciplina: Prof. : Mario Luiz Teixeira de Moraes

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1 EVOLUÇÃO unesp Disciplina: Prof. : Mario Luiz Teixeira de Moraes
Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira Departamento de Fitotecnia, Tecnologia de Alimentos e Sócio-Economia Agronomia unesp Disciplina: EVOLUÇÃO Prof. : Mario Luiz Teixeira de Moraes COLABORADORES: Alexandre Marques da Silva Marcela Aparecida de Moraes Selma Maria Bozzite Moraes Ilha Solteira, SP 2º Semestre/2010

2 Aula: 29/10/2009 DISTÂNCIAS GENÉTICAS

3 FATORES EVOLUTIVOS DERIVA BASE GENÉTICA POPULAÇÃO FLUXO GÊNICO SELEÇÃO MUTAÇÃO

4 ATRIBUTOS DA DISTÂNCIA GENÉTICA
ser métrica; utilizar frequências alélicas para seu cálculo; refletir predomínio dos fatores de NATUREZA GENÉTICA sobre os fatores ambientais que estão sendo avaliados.

5 ATRIBUTOS DA DISTÂNCIA GENÉTICA
Medida de distância calculada a partir de dados fenotípicos pode ser de NATUREZA GENÉTICA Magnitude dos coeficientes de herdabilidade ou repetibilidade poderá ser utilizada para inferir sobre a NATUREZA GENÉTICA ou não da medida de distância empregada

6 ATRIBUTOS DA DISTÂNCIA GENÉTICA Natureza Genética depende:
Do tipo de dado empregado em seu cálculo (se fenotípico, isoenzimático ou de DNA); Do modo como foram gerados esses dados (Distância Generalizada de Mahalanobis).

7 DISTÂNCIAS GENÉTICAS LOCO: LAP ALELOS POP N 1 2 A 33 0,47 0,53 = ? B
42 0,78 0,22 75 GST = DST/HT em que: em que: em que:

8

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14 DISTÂNCIA GENÉTICA de Nei, 1973 (GST = DST/HT)

15 DISTÂNCIA GENÉTICA de Hedrick, 2005

16 DISTÂNCIA GENÉTICA de Nei, 1972
(D = -lnI) LOCO: LAP ALELOS POP N 1 2 A 33 0,47 0,53 B 42 0,78 0,22 75 em que:

17 DISTÂNCIA GENÉTICA de Nei, 1972 (D = -lnI)
_____________________ ALELOS POP N A , ,53 B , ,22 75

18 PROBABILIDADE DE ESCOLHA DE DOIS GENES IDÊNTICOS EM UMA POPULAÇÃO

19 DISTÂNCIA GENÉTICA de Nei, 1972 (D = -lnI)
JA = (0,47)2 + (0,53)2  JA = 0,5018 JB = (0,78)2 + (0,22)2  JB = 0,6568 JAB = (0,47).(0,78) + (0,53).(0,22)  JAB = 0,4832 I = JAB/√(JA.JB)  I = 0,8417 D = -ln 0,8417  D = -(-0,1724)  D = 0,1724

20 DISTÂNCIAS GENÉTICAS LOCO: LAP ALELOS POP N 1 2 A 33 0,47 0,53 = ? B
42 0,78 0,22 75 em que: em que:

21 DISTÂNCIA GENÉTICA de Wright, 1978
em que:

22 Média Ponderada do quadrado da frequência alélica
_______________ ALELOS POP N A , ,53 B , ,22 75

23 Média Ponderada do quadrado da frequência alélica
_______________ ALELOS POP N A , ,53 B , ,22 75

24 Variância de cada alelo entre as populações

25 Variância de cada alelo entre as populações

26 Soma das Variâncias de todos os alelos

27 Cálculo de

28 DISTÂNCIA GENÉTICA de Wright, 1978

29 DISTÂNCIA GENÉTICA WEIR (1990) - ANOVA
AA = 26 Aa = 14 aa = 2 AA = 5 Aa = 21 aa= 7 Pop A Pop B

30 DISTÂNCIA GENÉTICA WEIR (1990) - ANOVA
FV QM E(QM) POPULAÇÕES (POP) Q1 FAMÍLIAS(FAM)/POP Q2 INDIVÍDUOS(IND)/FAM/POP Q3 GEN/IND/FAM/POP Q4

31 DISTÂNCIA GENÉTICA WEIR (1990) - ANOVA

32 DISTÂNCIA GENÉTICA WEIR (1990) - ANOVA

33 REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS
CRUZ, C.D.; VIANA, J.M.S.; CARNEIRO, P.C.S. Genética Volume II GBOL – Software para ensino e aprendizagem de genética. Viçosa: UFV, p. DIAS, L.A.S. Análises multidimensionais. In: ALFENAS, A.C. Eletroforese de isoenzimas e proteínas afins: fundamentos e aplicações em plantas e microrganismos. Viçosa: UFV, p , 1998. DIAS, L.A.S. Variância de freqüências alélicas. In: ALFENAS, A.C. Eletroforese de isoenzimas e proteínas afins: fundamentos e aplicações em plantas e microrganismos. Viçosa: UFV, p , 1998. FREIRE-MAIA, N. Genética de populações humanas. São Paulo: Editora da Universidade de São Paulo, p. FUTUYMA, D.J. Biologia evolutiva. Trad. VIVO, M. e Coord. SENE, F.M. Sociedade Brasileira de Genética/CNPq, Ribeirão Preto, p. HAMRICK, J.L. The distribution of genetic variation within and among natural plant populations. In: SCHONEWALD-COX, C.M.; CHAMBERS, S.M.; MACBRYDE, B.; THOMAS, W.L. (Ed.) Genetic and conservation. Menlo Park, The Benjamin/Cummings, p HEDRICK, P.W. A standardized genetic differentiation measure. Evolution, Lancaster, v.59, n.8, p , 2005. LYNCH, M. & WALSH, B. Genetics and analysis of quantitative traits. Sunderland: Sinauer Associates, Inc. Publishers, p. HARTL, D.L. & CLARK, A.G. Principles of population genetics. Sunderland: Sinauer Associates p. MORAES, M.L.T. Variabilidade genética por isoenzimas e caracteres quantitativos em duas populações naturais de aroeira Myracrodruon urundeuva F.F. & M.F. Allemão – Anacardiaceae (Syn: Astronium urundeuva (Fr. Allemão) Engler). Piracicaba, p. (Doutorado – ESALQ/USP). NEI, M. Analysis of gene diversity in subdivided populations. PROCEEDING OF THE NATIONAL ACADEMIC OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, Washington, 70: , 1973. NEI, M. Genetic distance between populations. American Naturalist, Lancaster, 106:283-92, 1972. VENCOVSKY, R. Análise da avariância de frequências alélicas. In: CONGRESSO LATINO AMERICANO DE GENÉTICA, 10 Rio de Janeiro, Proceedings, Revista Brasileira de Genética. Suplemento 1; Ribeirão Preto, v.15, n.1, p.53-60, 1992. WEIR, B.S. Genetic data analysis: Methods for discrete population genetic data. Sunderland, Sinauer Associates, Inc. Publishers, p. WRIGHT, S. Variability within and among natural populations. Chicago, University of Chicago Press, v.4, 579p. (Evolution and genetics of populations).