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CENTRO DE GENOMICA E FITOMELHORAMENTO Introdução à Bioinformática

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Apresentação em tema: "CENTRO DE GENOMICA E FITOMELHORAMENTO Introdução à Bioinformática"— Transcrição da apresentação:

1 CENTRO DE GENOMICA E FITOMELHORAMENTO Introdução à Bioinformática
Universidade Federal de Pelotas Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel Programa de Pós-Graduação em Agronomia CENTRO DE GENOMICA E FITOMELHORAMENTO Introdução à Bioinformática Luciano C. da Maia Engenheiro Agrônomo Professor Dep. de Fitotecnia FAEM/UFPel

2 Inferências evolutivas intra-específicas: genealogias
Interpretar as informações... Inferências evolutivas intra-específicas: genealogias genética de populações frequencias alélicas estatísticas Gamma e F Varias distancias - Inferências evolutivas interespecíficas: filogenias         - critérios quantitativos     -distancia Euclidiana, Mahalanobis, etc...     - critérios qualitativos     FENÉTICOS - BASEADOS EM DISTANCIAS         varios métodos de distancia...     CLADISTICOS -BASEADOS NAS VÁRIAS ARVORES/CAMINHOS POSSIVEIS - máxima parcimônia         -BASEADOS EM MODELOS PROBABILISTICOS - máxima verossimilhança Bayesano

3 FENÉTICOS - baseados em distância entre os dados:
    distância média [UPGMA"] (Sokal & Michener, 1958; Sneath & Sokal, 1973);     distância transformada [DT] (Farris, 1977);     método de Fitch e Margoliash (1967);     evolução mínima [EM] (Cavalli-Sforza & Edwards, 1967; Saitou & Imanishi, 1989);     "neighborliness" [ST] (Sattah & Tversky, 1977; Fitch, 1981);     "neighbor-joining" [NJ] (Saitou & Nei, 1987); Distância p Jukes & Cantor (1969) Kimura 2-parâmetros (Kimura 1980) Tajima e Nei (1984) Tamura 3-parâmetros (Tamura 1992) Tamura e Nei (1993) B) CLADISTICOS - baseados em otimização dos dados;    b.1) baseado nas diferentes topologias   - máxima parcimônia [MP] (Fitch, 1971);     b.2) baseado em probabilidades     - máxima verossimilhança [MV] (Felsenstein, 1981). -bayeseana

4 Interpretar as informações...


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