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PublicouTalita Paredes Alterado mais de 10 anos atrás
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Quimotripsina
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COMPLEMENTARIDADE ENTRE
DIIDROFOLATO REDUTASE ES SEUS SUBSTRATOS Amarelo: tetraidrofolato Vermelho: NADP+
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“BASTÃO-ASE” DGM contribuido pelas interações entra e enzima e o estado de transição
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Cinêtica Enzimática Michaelis-Menten
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k1 kcat E + S ES E + P k-1 V = kcat[ES] Assumir que: d[ES]/dt = 0
k1[E][S] – k-1[ES] – kcat[ES] = 0 [E]tot = [E] + [ES] Vmax = kcat x [E]tot KM = k-1/k1
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Vo = Vmax[S] = kcatx[E]totx[S]
Km+[S] Km+[S]
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Diagrama Lineweaver-Burk (Duplo-reciprocal)
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INIBIÇÃO COMPETITIVO:
substrato e inibidor competem para o mesmo sítio Km kcat Vo = Vmax[S]/(aKm + [S]) a = 1 + [I]/KI
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a’ = 1 + [I]/K’I Vo = Vmax[S]/(Km + a’[S]) Quando [S]>>Km, Vo = Vmax/a’ INIBIÇÃO NÃO-COMPETITIVO: substrato e inibidor competem para sítios diferentes; inibidor somente liga ao complexo ES
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Vo = Vmax[S]/(aKm + a’[S])
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Diagrama Lineweaver-Burk para inibição competitiva
a = 1 + [I]/KI
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Diagrama Lineweaver-Burk para inibição não-competitiva
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Diagrama Lineweaver-Burk para inibição mista
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ativa inativa EH+ E + H+ pKa = 3,5
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inativa ativa inativa EH22+ EH+ + H+ E + 2H+ pKa = 6, pKa = 9,0
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Quimotripsina
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Quimotripsina vermelha: ser195, asp 102, his57
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Quimotripsina vermelha: ser195, asp 102, his57
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Sítio ativo de quimotripsina
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HEXOQUINASE Sem glicose Com glicose
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Inibição “Feedback”
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Alosteria: curva sigmoidal de uma enzima homotrópica:
o substrato age como uma moduladora positiva
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Alosteria: curvas sigmais de uma enzima em que
moduladoras positivas e negativas modificam K0.5 sem modificar Vmax.
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Alosteria: curvas sigmoidais de uma enzima em que
moduladoras positivas e negativas modificam Vmax Sem modificar K0.5 (menos comum).
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Estrutura da mioglobina (153 aminoácidos, MW = 16700 Da)
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Estrutura básica das Porfirinas 4 anels de pirrole conectados por pontes de =C-
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HEME = Prorporfirina IX
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HEME
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His próximal
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P + L PL Ka = [PL]/[P][L] = 1/Kd q = [PL]/{[PL]+[P]}
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P + L PL Ka = [PL]/[P][L] = 1/Kd q = [PL]/{[PL]+[P]}
Ka = constante de associação, Kd = constante de dissociação = 1/Ka Fração de sítios ocupados = q q = [PL]/{[PL]+[P]} q = Ka[P][L]/{Ka[P][L]+[P]} q = Ka[L]/{Ka[L]+1} q = [L]/{[L]+1/Ka} q = [L]/{[L]+Kd]} equação tipo x = y/(y+z) descreve uma hipérbola Quando [L]=Kd=1/Ka, q = 0,5 (50% dos sítios ocupados)
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Curva de ligação de oxigênio a mioglobina P50 = 0,26 kPa
= fração dos sítios ocupados com ligantes = [L]/{[L]+Kd]} = [02]/{[02]+ [02] 50} =p02/{p02+P50}
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Ligação de oxigênio a heme
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Ligação de monôxido de carbono a heme
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Aminoácidos chaves de mioglobina que interagem com heme e O2
His distal His proximal
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Conservado em todas as globinas Conservado nas três estruturas
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Interações entre subunidades em hemoglobina
Contatos a1-b1 mudam pouco quando O2 liga Contatos a1-b2
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Contatos a1-b2 no estado T
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INTERAÇÕES IÔNICAS NO ESTADO T da Hb
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Ligação de oxigênio a hemoglobina
Curva hiperbólica de Ligação de baixa afinidade Curva sigmoidal de Ligação cooperativa Curva hiperbólica de Ligação de baixa afinidade
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Dois modelos moleculares para explicar ligação cooperativa
Modelo MWC Monod, Wyman Changeux (“simultânea”) Modelo “sequencial”
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Efeito Bohr (Christian, pai e médico; não Niels, filho e físico)
Hb + O2 HbO2 HHb+ + O2 HbO2 + H+ Logo nos tecidos internos onde [H+] é alto, H+ liga a Hb e causa a dissociação de O2. H+ e O2 ligam em sítios diferentes: -O2 liga no Fe do grupo heme -H+ liga em vários grupos de aminoácidos que estabilizam o estado T (baixa afinidade para O2) ie: His146(+) Asp94(-) Sangue no pulmão Sangue nos tecidos internos
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CO2 + H2N----(a-amino da cadeia)
H+ + -O2C-NH---- terminal “carbamino” Contribui para o efeito Bohr [BPG] alta em hemácias HbO2 + BPG HbBPG + O2
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HbO2 + BPG HbBPG + O2 No nível de mar, a diferença entre
pO2 nos pulmões e nos tecidos permite o sangue soltar ~40% da sua capacidade de O2 nos tecidos. Em altitudes altas, o forneciemnto de O2 diminuiria para 30% de capacidade sanguina.... Para compensar, a [BPG]aumenta e a afinidade da Hb para O2 cai, resultando no aumento de fornecimeno de O2 para os tecidos até ~40% de sua capacidade.
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O estado T da Hb tem um sítio para BPG (cargas positivos em azul)
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O estado R da Hb perdeu seu sítio para BPG
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Hemácias normais
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Variação de formas de hemácias em anemia falsiforme
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Anemia falsiforme: uma doença molecular
Glu6 Val na cadeia beta
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Glu6 Val na cadeia beta resulta num superfície hidrofóbico que promove associação entre moléculas para formar filamentos e fibras
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