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Elementos Genéticos em Bactérias
Agradecimentos: Profa. Dra. Aline Maria da Silva Instituto de Química- USP Bibliografia: Genes VII - Benjamin Lewin Biologia Molecular Básica-Arnaldo Zaha Lenhinger Principles of Biochemistry (3a. Ed.)
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Elementos Genéticos Cromossomo: Longo, usualmente circular, dupla- fita Plasmídio: pequeno, usualmente circular, dupla-fita Elemento transponível: DNA dupla-fita, inserido no cromossomo ou no plasmídio e que pode se transferir de lugar Bacteriófago: DNA fita simples ou dupla-fita
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Cromossomo de E.coli 4,6 x 106 pares de bases Circular
Uma origem de replicação (Ori C) Totalmente sequenciado
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Cromossomo E.coli
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Plasmídios Elementos genéticos móveis extracromossomais
Capacidade de se auto-replicar Tamanho variado: 1000 a pares de bases Multicópia ou cópia única Confere vantagens adaptativas
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Transposons Seqüências de DNA que codificam a enzima transposase
Capacidade de se transferir (transposição): cópia idêntica é inserida em outro sítio genômico Transposons simples (Sequências de Inserção): codificam apenas a transposase Transposons complexos: transposase + outros genes (ex: resistência a antibióticos)
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Bacteriófagos Ciclo Lítico Ciclo Lisogênico (Prófago)
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Ciclo lítico Ciclo lisogênico
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Ciclo lítico
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Transferência do material genético em bactérias
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Transformação
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Transformação
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Transformação
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Transformação
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Transdução
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Conjugação: transferência de plasmídeo
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Cromossomos Eucarióticos: Compactação do Material Genético
Agradecimentos: Profa. Dra. Aline Maria da Silva Instituto de Química- USP Bibliografia: Genes VII - Benjamin Lewin Biologia Molecular Básica-Arnaldo Zaha Lenhinger Principles of Biochemistry (3a. Ed.)
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Compactação do Material Genético
Organismo / Compartimento Forma Dimensões Tamanho do DNA Número de bases Fago T4 iscosaedro 0,065x0,10um 55um E.coli cilindro 1,7 x 0,65 um 1,3 mm 4,6 x 106 Mitocondria Humana esferóide 3 x 0,5um 50um 10 dsDNA 16 000 Núcleo Humano 6um diametro 1,8m 46 cromossomos 6 x 109 (diplóide)
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Número normal de cromossomos em alguns organismos
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Empacotamento do DNA do bacteriófago lambda
Pré- Capsídeos Vazios Partícula Madura
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Dupla hélice de DNA: Watson-Crick, 1953 Sulco menor Sulco maior
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enrolado superenrolado
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Conformação tridimensional do DNA circular fechado
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DNA circular superespiralado DNA circular relaxado
Quebra em uma das cadeias da dupla-fita
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Superenrolamento para anular a tensão criada pela abertura da hélice
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Superenrolamento crescente
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Superenrolamento positivo Superenrolamento negativo
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Introdução de superhélice negativa pela DNA girase: uma topoisomerase de E.coli.
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Brometo de Etídio
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Eletroforese de DNA em gel de agarose
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Eletroforese de DNA em gel de agarose corado com EtBr
DNA relaxado Diferentes graus de superenrolamento após tratamento com topoisomerase DNA totalmente superenrolado
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Compactação de Genomas Procarióticos
O material genético apresenta-se organizado de forma compacta ocupando 1/3 do volume total da célula bacteriana Nucleóide Densidade do DNA na célula bacteriana é alta: 10mg /ml !!!!
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Nucleóide expelido de um célula bacteriana lisada:
Alças de uma fibra Nucleóide da Bactéria
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Empacotamento do genoma bacteriano
Proteínas com caráter básico estão envolvidas na organização da fibra compacta e na formação das alças do nucleóide
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Compactação de Genomas Eucarióticos
Proteínas nucleares específicas + DNA Cromatina Eucromatina Heterocromatina menos compactada mais compactada Cromossomos Estado mais condensado na Mitose ou Meiose
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Corte de um núcleo corado com Feulgen
Heterocromatina Citoplasma Nucléolo Corte de um núcleo corado com Feulgen
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Cromossomo mitótico Telômero Centrômero Cromátides irmãs Telômero
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Cromossomo Artificial de Levedura (YAC)
Centrômero Telômero Sequencia para Replicação Autônoma
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Replicação dos Telômeros
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Cromossomos desprovidos de histonas: arcabouço de proteínas no qual as alças do DNA estão ancoradas
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Níveis de Compactação da Cromatina
Fibra de 30nm Razão de compactação ~ Razão de compactação ~7000
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Cerne de histonas do nucleossomo
DNA de ligação dos nucleossomos
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Enrolamento helicoidal da fibra de 30nm: 6 nucleossomos por volta organizados radialmente
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Estrutura Molecular da Cromatina:Nucleossomos
Eletroforese em gel de agarose
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Estrutura Molecular da Cromatina:Nucleossomos
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Nucleossomo: DNA organizado em duas voltas
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Geração da partícula central do Nucleossomo através da digestão completa com nuclease
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Histonas: Proteínas com caráter básico (carga +) que interagem com o DNA (carga -) Nucleossomo
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Organização das histonas no nucleossomo
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Não replicado Replicado
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Mecanismo de Montagem dos Nuclessomos na Replicação
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No nucleossomo segmentos do DNA podem ser aproximados
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As caudas N-terminais das histonas podem ser modificadas covalentemente de modo reversível:
Fosforilação, acetilação, metilação ou ubiquitinação Alteração funcional do octâmero de histonas levando a mudançãs estruturais da cromatina na transcrição e na replicação
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Acetilação ou metilação da lisina ou fosforilação da serina reduz a carga líquida das histonas
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Modelo para Transcrição na Presença de Nucleossomos
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