Abstract Introduction Huntington disease (HD) is an autosomal dominant progressive neurodegenerative disorder which causes a progressive and selective neural cell loss and atrophy in the caudate and putamen, leading to: ● Chorea (abnormal involuntary movement disorder) ● Dystonia (neurological movement disorder) ● Loss of coordination ● Cognitive Decline ● Behavioral difficulties Currently, there is no treatment able to stop the course of the Huntington's disease events. However, it may be possible to prevent the death of brain cells. In fact, Borrell-Pages et al. (2006) found that treatment with cystamine, a transglutaminase inhibitor, increased levels of BDNF (and levels of Hsj1b) in mouse neuronal cells (in a mouse with HD) and showed a neuroprotective effect. Treatment of rodent and primate models of HD with cystamine and cysteamine resulted in a transient increase in peripheral blood levels of BDNF in these animals. Therefore, it is important to identify, study and characterize the BDNF gene in order to fully understand its importance. Results 3.1 Gene De acordo com a informação da base dados Genecards verificamos que este localiza-se no cromossoma 7: 27,676, ,743,605, que é composto por 11 ortólogos e 3 paralógos. Já no Emsembl verificamos que o número de ortólogos sobe para Variabilidade genética Através da base dados GeneCards, verificamos que o gene BRAF é composto por 883 mutações (SNPs). Dado que praticamente todos os SNIP’s estão incluídos no grupo dos intrões, estes não vão fazer diferença para a tradução da proteína. Após a pesquisa dos SNIP’s na base dados GeneCards, decidimos pesquisar mais sobre um deles que é do tipo missense, na base dados dbSNP, com a referência rs Com base na figura retirada da base dados dbSNP, podemos ver que ouve uma troca de uma citosina (C) para uma timina (T), o que fez com que houvesse nos aminoácidos de uma Treonina [Thr] para uma Isoleucina [Ile]. Isto faz com o funcionamento da proteína possa ser comprometido Gene / transcritos – sequências O gene tem 20 transcriptos Estrutura do gene (intrões/exões) 3.2 Proteina, nº de identificação (UniProt) – isoform/domínios (…) Nº de identificação UniProt: P23560 Isoformas: 5 References 1. Borrell-Pages, M., Canals, J. M., Cordelieres, F. P., Parker, J. A., Pineda, J. R., Grange, G., Bryson, E. A., Guillermier, M., Hirsch, E., Hantraye, P., Cheetham, M. E., Neri, C., Alberch, J., Brouillet, E., Saudou, F., Humbert, S. Cystamine and cysteamine increase brain levels of BDNF in Huntington disease via HSJ1b and transglutaminase. J. Clin. Invest. 116: , R. PRIMACK, “Essentials of Conservation Biology,” 4th Edition, Methods 2.1 Gene Para conhecer melhor o gene utilizou-se o GeneCards com base no nome do gene BDNF e Emsembl com acession number ENSG Nestes podemos identificar a localização, os transcripts e as mutações entre outras informações Variabilidade genética A variabilidade genética mede a tendência dos diferentes alelos de um mesmo gene variarem entre si, numa dada população. Para podermos analisar essas variabilidades do gene, podemos usar a base de dados do GeneCards no tópico “Genomic Variants”. Para poder ver mais detalhadamente sobre cada um dos SNIP’s, usamos a ferramenta dbSNP do NCBI, pois a partir desta podemos ver as alterações que ocorreram nos alelos e as posições onde elas ocorrem Gene / transcritos – sequências Seguindo o link para a base de dados Esembl Estrutura do gene (intrões/exões) 2.2 Protéina Pronº de identificação (UniProt) – isoform/domínios (…) Conclusions & Perspectives Huntington Disease André Silva, João Ferrinho, Pedro Matos