Proteômica A

Proteômica e Aplicações Gustavo Bueno Marcelo Medina Max Mota Paues Peres Profa. Dra. Flávia Cristina Rodrigues Lisoni

Genômica É o conhecimento da seqüência completa dos genes Esse conhecimento não é suficiente para saber quais proteínas estão sendo expressas

Proteômica Campo de estudo e tecnologia que propõe analisar de forma global o conjunto de proteínas numa célula ou tecido, o proteoma.

Proteômica DNA 5‘ ATG CAC GGG AGA // TTG AAC CCA AAA TCC 3‘ 3‘ TAC GTG CCC TCT // AAC TTG GGT TTT AGG 5‘ (TRANSCRIÇãO) RNAm 5‘ AUG CAC GGG AGA // UUG AAC CCA AAA UCC 3‘ (TRADUÇãO) Proteína Met His Gly Arg // Leu Asn Pro Lys Ser (ENOVELAMENTO )

Proteômica Proteína enovelada

Proteômica Genoma Proteoma Bioinformática Compreensão

Aplicações

Estudo sobre o mecanismo de ligação da lectina de Helix pomatia (Saint-Guiron et al., 2007) Usada na identificação metástase Identificação da proteínas (glicoconjugados na membrana plasmática) ligadas a lectina. O uso da proteína lectina por si só não é usada para diagnosticar a metastase.

SW 480 HT 29

Possíveis biomarcadores para doença Alzheimer (German et al., 2007) Análise de soro - observamos três picos espectrais comum a ambos os conjuntos de dados. A identificação desses picos pode permitir o desenvolvimento de um novo conjunto de biomarcadores. Azul – parkison, Verm – Alzheimer, Preto - Controle

Possíveis biomarcadores para tumores (Poon et al., 2001). Marcadores devem ser altamente específicos para um único tipo de tumor; Mesmo procedimento do alzheimer.

Pesquisas de moléculas bioativas em produtos naturais de animais peçonhentos (Pimenta et al., 2001) Identificou as proteínas presentes no veneno, e as regiões que atuam nos canais Na+ dependentes; frações resultantes II e III, que respondem por 90 e 10%. A massa molecular da fração II foram predominantemente entre 6500 e 7500 Da. Isso corresponde a cadeia longa toxinas que atuam principalmente sobre canais Na+ dependentes de voltagem . Fração III é mais complexa e predominantemente contidos moléculas com massas entre 2500 e 5000 Da. Isso corresponde à família de toxinas de cadeia curta, a maioria dos que atuam sobre K (+) canais, e outros peptídeos desconhecido. (figuras: fração 2 (2 especrtos) e fração 3).

Estudo de proteínas produzidas por patógenos de plantas (Smolka et al Expressão de diferentes proteínas para adesão nos hospedeiros X. fastidiosa coloniza plantas e insetos ( proteínas diferentes para adesão nos hospedeiros) Figura: varias proteínas (centenas) no gel de agarose que foram estudas X. fastidiosa tem o genoma seqüenciado.

Estudo de ecologia bacteriana Estudos ecológicos com foco na adaptação natural das bactérias aos seus ambientes (LACERDA e REARDON, 2009) Mecanismos de adaptação para condições extremas de temperatura fonte termal no parque Yellowstone