Ferramentas para extração de dados e análises funcionais

Apresentação em tema: "Ferramentas para extração de dados e análises funcionais"— Transcrição da apresentação:

1 Ferramentas para extração de dados e análises funcionais
Bioinformática Ferramentas para extração de dados e análises funcionais Tiago Henrique 1

2 Bioinformática

3 Bioinformática

4 Bioinformática Ciências da Química Computação Bioinformática
Engenharia Bioquímica Matemática Biologia Estatística 4 4

5 Bioinformática Sequenciamento de Nova Geração 5 5

6 Bioinformática Sequenciamento de Nova Geração 6 6

7 Bioinformática Microarranjos 7 7

8 Bioinformática 8 8

9 Bioinformática Sistemas Biológicos 9 9

10 Bioinformática Sistemas Biológicos 10 10

11 Bioinformática DAVID – Database for Annotation, Visualization and Intregated Discovery

12 Bioinformática DAVID – Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery Functional Annotation Gene Functional Classification Gene ID Conversion Gene Name Batch Viewer

13 Bioinformática DAVID – Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery > citations ~ 800 unique researchers > research institutes world-wide

14 Bioinformática

15 Bioinformática

16 Bioinformática

17 Bioinformática

18 Bioinformática

19 Bioinformática

20 Bioinformática MetaboAnalyst 3.0

21 Bioinformática

22 Bioinformática

23 Bioinformática

24 Bioinformática

25 Bioinformática MetaboAnalyst 3.0 Processamento dos dados
Análise dos dados – oito módulos funcionais

26 Bioinformática MetaboAnalyst 3.0 Processamento dos dados
Converter diferentes tipos de dados em matrizes Controle de qualidade Busca por inconsistencias Identifica missing values Remover ruídos

27 Bioinformática MetaboAnalyst 3.0 Normalização dos dados
Remover variações sistemáticas entre as condições experimentais Tornar as variáveis comparáveis

28 Bioinformática MetaboAnalyst 3.0 Transformação em log Scaling
Autoscaling Range scaling Pareto scaling

29 Bioinformática MetaboAnalyst 3.0 Análise dos dados

30 Bioinformática MetaboAnalyst 3.0
Testes estatísticos univariados (Teste T, ANOVA e análise de variância) Testes estatísticos multivariados (PCA, PLS-DA) Machine Learning (random forest e support vector machine classification)

31 Bioinformática MetaboAnalyst 3.0 Dados experimentais
Targeted – Análise quantitativa de um determinado substrato Non Targeted – Análise global de metaólitos detectados por uma determinada técnica

32 Bioinformática

33 Bioinformática

34 Bioinformática

35 Bioinformática

36 Bioinformática

37 Bioinformática

38 Bioinformática

39 Bioinformática

40 Bioinformática

41 Bioinformática Obrigado! 41