Oeiras, 11 de setembro de 2015 Prof. Orientador: Dr. Daniel Sobral Trabalho realizado por: Alexandra Forte Ana Paula Rodrigues Maria João Varela Sílvia.

Apresentação em tema: "Oeiras, 11 de setembro de 2015 Prof. Orientador: Dr. Daniel Sobral Trabalho realizado por: Alexandra Forte Ana Paula Rodrigues Maria João Varela Sílvia."— Transcrição da apresentação:

1 Oeiras, 11 de setembro de 2015 Prof. Orientador: Dr. Daniel Sobral Trabalho realizado por: Alexandra Forte Ana Paula Rodrigues Maria João Varela Sílvia Dias

2 Mini Projeto: Descoberta das Ilhas de CpG

3 Os conceitos O Problema As abordagens Um estudo nos crom. 21 e 22 Sala de Aula

4 Recordando… O ADN é composto por 2 cadeias complementares de nucleótidos: A, C, G e T ligadas por fosfatos A apenas se liga a T e C apenas se liga a G No núcleo das células o ADN está distribuído por 23 pares de cromossomas

5 Recordando… Algumas seções do ADN contêm a codificação de genes (cerca de 2% do total) Outras seções não codificam genes e o seu papel ainda não é totalmente conhecido

6 CpG CpG significa a ligação entre um C seguido de um G, na mesma cadeia do ADN Certas zonas do ADN são particularmente ricas em CpG, pelo que se denominam Ilhas de CpG

7 Porque é que as Ilhas de CpG são importantes?

8 Estão próximas de genes que estão permanentemente expressos em todas as células Parecem garantir uma maior rigidez e estabilidade ao ADN de modo a assegurar a correta expressão desses genes, essenciais para o funcionamento da maioria das células

9 Definição de Ilha de CpG Um possível critério: (Gardiner-Garden e Frommer, 1987) Pelo menos 50% C+G 200 bp no mínimo CpG Obs/ CpG Esp >=0,6

10 QUESTÕES: 1. Qual a probabilidade de uma janela aleatória de 200 bp ser uma Ilha de CpG: A. Admitindo que os 4 nucleótidos são equiprováveis B. Considerando que existe cerca de 40% de C e G no genoma C. Considerando que, na realidade, existem 1% de CpG no genoma

11 A) Se A, T, C e G equip.

12 A) Se A, T, C e G equip.

13 B) Se 40% C e G

14 B) Se 40% de C e G

15 C) Como só existem 1% de CpG

16 Mais QUESTÕES

17 Se modificarmos as condições da def. de Ilha de CpG

18

19 Proposta de Trabalho À descoberta das ilhas de CpG.

20 http://www.genetics.edu.au/Publications- and-Resources/Genetics-Fact-Sheets/FS1 http://www.genetics.edu.au/Publications- and-Resources/Genetics-Fact-Sheets/FS1 Comprehensive analysis of CpG in human choromossomes 21 and 22. Daiya Takai and Peter Jones, 2002