S IGNALINK D ATABASE Ana Raquel Nunes24392 Ricardo Fradique24566 Elisabete Alves25983.

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1 S IGNALINK D ATABASE Ana Raquel Nunes24392 Ricardo Fradique24566 Elisabete Alves25983

2 M ENTORES DA S IGNALINK D ATABASE Projecto desenvolvido por professores e estudantes das seguintes instituições: Eötvös University Semmelweis University Hungarian Academy of Sciences

3 F UNDAMENTOS PARA A CRIAÇÃO DA S IGNALINK Inicialmente… - Vias de transdução de sinal independentes. Actualmente… - Grandes interações entre vias de sinalização; - Necessidade de novas experiências, técnicas de modelação, e formas de armazenamento.

4 F UNDAMENTOS PARA A CRIAÇÃO DA S IGNALINK Fonte (seed) – proteínas e interações a partir de um pequeno grupo de artigos de revisão; Pesquisa semi-automática da literatura para aprofundar as proteínas e interações; Com critérios de arquivação manuais foram selecionadas proteínas e interações dos resultados e adicionados às “sementes”.

5 O BJECTIVO DA S IGNALINK D ATABASE 5 Permitir análises sistemáticas utilizando uma rede das principais vias de sinalização intracelulares Map of the JAK/STAT pathway in H. sapiens

6 C ARACTERÍSTICAS DA S IGNALINK D ATABASE

7 C RITÉRIOS USADOS PARA DEFINIR E INCLUIR A INFORMAÇÃO 1) Pesquisa de informação: Artigos de revisão; Bases de dados especificas : WormBase, FlyBase e UniProt;WormBaseFlyBaseUniProt Resultados de pesquisa do IHOP, ChiliBot, e PubMed.IHOPChiliBotPubMed 2) Seleção De interações que tiveram evidência direta e indireta a nível experimental. 3) Detalhes técnicos: Cada interação inserida teve de ser dirigida; Os artigos analisados que descrevem as interações estavam eram os mais atuais. Para todos os trabalhos de revisão e cerca de 70% dos artigos foi examinado não só o seu resumo como também o texto principal. Duas interações de sinalização entre as mesmas duas proteínas em direções opostas são listadas separadamente na base de dados.

8 F INALIDADE DA S IGNALINK D ATABASE Procurar vias de sinalização Fazer downloads de artigos e informações sobre espécies e as suas vias específicas Prever funções de proteínas Observar modelos de tecidos ou doenças por processos de sinalização

9 D EMONSTRAÇÃO www.signalink.org