Felipe Dias Maria Fernanda

Apresentação em tema: "Felipe Dias Maria Fernanda"— Transcrição da apresentação:

1 Felipe Dias Maria Fernanda
Gene Ontology (GO) Felipe Dias Maria Fernanda

2 Objetivos Trabalho colaborativo para atender à necessidade de descrições consistentes de produtos de gene. Reunir três bancos de dados distintos (1998) FlyBase (Drosophila) Saccharomyces Genome Database (SGD) Mouse Genome Database (MGD)

3 Atualmente Inclui diversos tipos de repositório de genomas:
Animais Plantas Micróbios Reúne diversos outros bancos de dados, entre eles: GeneDB (do Wellcome Trust Sanger Institute) The Institute for Genomic Research (TIGR)

4 Projeto GO Desenvolveu três ontologias baseadas em:
Processos biológicos Componentes celulares Funções moleculares Ontologias independentes de espécies.

5 Projeto GO Aspectos do projeto:
Desenvolvimento e manutenção das ontologias. Anotação dos produtos de genes. Desenvolvimento de ferramentas para facilitar a manutenção, criação e uso das ontologias.

6 As Ontologias Componentes celulares Processos biológicos
O componente de uma célula com a restrição de ser parte de uma estrutura maior. Processos biológicos Série de eventos realizados por uma ou mais configurações de processos biológicos. Funções moleculares Descreve atividades à nível molecular.

7 Áreas não cobertas Produtos de genes.
Processos, funções e componentes exclusivos de mutações ou doenças. Interações proteína – proteína. Propriedades anatômicas ou histológicas acima do nível de componente celular.

8 Outras ontologias da OBO
OBO: Open Biomedical Ontologies Biological imaging methods Ontologia de preparação de amostras, visualização e métodos gráficos utilizados em pesquisa biomédica. Drosophila gross anatomy Ontologia da anatomia da Drosophila Melanogaster.

9 Bibliografia Gene ontology: http://www.geneontology.org
Ontologias da OBO: Outras informações: