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Estrutura e Replicação de DNA Estrutura do DNA: polidesoxiribonucleotídeo com ligações 3-5 fosfodiéster. Maioria de fita dupla antiparalelas em dupla hélice.

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1 Estrutura e Replicação de DNA Estrutura do DNA: polidesoxiribonucleotídeo com ligações 3-5 fosfodiéster. Maioria de fita dupla antiparalelas em dupla hélice Associado a nucleoproteínas, o complexo DNA e proteína está no nucleóide. DNA no cromossômico, mitocondrial (cloroplastos) Plasmídeos: DNA de organismos procariotas que é extracromossômico que replica independente ou não do DNA cromossômico.

2 Dupla hélice: pode separar por aquecimento, pH, etc. As ligações fosfodiéster não se rompem. Estrutura mais comum de DNA é a forma B com hélice voltada para direita com 10 resíduos de DNA por volta de 360º e planos das bases perpendiculares ao eixo helical. Forma A: mais desidratada e tem hélice para direita com 11 resíduos por volta e bases em ângulo de 20º ao eixo Forma Z ocorre hélice para esquerda com 12 pares/volta e ocorre quando há seqüências d purina e pirimidinas alternadas como poli CG.

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4 Síntese de DNA procarioto Processo semiconservador: Separação das fitas antiparalelas e cada uma serve como molde para o novo DNA. Enzimas envolvidas são polimerases dirigidas por moldes. Separação das fitas complementares: Separação das fitas complementares: Há necessidade de separação de certa parte hélice, pois polimerase usa fita simples. Há necessidade de separação de certa parte hélice, pois polimerase usa fita simples. Em eucariotos é a seqüência curta de AT (de consenso). Existem vários pontos no DNA, criando vários pontos de replicação. Em eucariotos é a seqüência curta de AT (de consenso). Existem vários pontos no DNA, criando vários pontos de replicação. A medida que duas fitas se separam ocorre a síntese ativa. Esta região é denominada zona de replicação (replication fork). Ela se move nas duas direções do DNA

5 Requeridas proteínas para a formação (pré-formação ou pré priming) 1.DnaA: Liga-se seqüências ricas em AT fazendo com que a fita dupla se desfaça (requer ATP) 2.Proteínas de ligação do DNA de fita simples (SSB): desestabilizadoras da hélice. Ligam só a fita simples, fornecendo assim o molde de fita simples. 3.DNA helicases: Ligam-se na região de replicação e movem-se para forçar a separação. Requerem ATP. Uma vez que as fitas são separadas, as SSB ligam-se a elas.

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7 Origem replicação. DnaA liga-se a seqüências ricas em bases AT. Origem replicação

8 Superdobramento: resolvido pelas topoisomerases I e II: Cortam o DNA para relaxar o superdobramento e depois ligam novamente

9 Síntese molde RNA (10 nucleotídeos) Síntese DNA 5-3. Exonuclease 3-5

10 Fonte:dTTP,dATP, dCTP e dGTP

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13 importante prevenir câncer e outras mutações: importante prevenir câncer e outras mutações: 1.DNA polimerase III confere a base recém colocada 2.DNA polimerase I: liga DNA recém sintetizado ao primer de RNA na fita secundária.liga DNA recém sintetizado ao primer de RNA na fita secundária. Remove nucleotídeos RNA à frente(exonuclease 5-3)Remove nucleotídeos RNA à frente(exonuclease 5-3) Substitui por desoxinucleotídeo correspondente, sintetizando o DNASubstitui por desoxinucleotídeo correspondente, sintetizando o DNA Corrige (exonuclease) direção 3-5.Corrige (exonuclease) direção 3-5. Pode atuar em desoxi ou nucleotídeos e pode retirar de 1 a 10 nucleotídeos de cada vez.Pode atuar em desoxi ou nucleotídeos e pode retirar de 1 a 10 nucleotídeos de cada vez. CORREÇÃO DO DNA RECÉM SINTETIZADO CORREÇÃO DO DNA RECÉM SINTETIZADO

14 ORGANIZAÇÃO DO DNA EUCARIOTA 1.46 cromossomos e 1 metro de DNA. 2.Diferenças com procariotas: a.Múltiplas regiões de replicação. b.5 classes de polimerases: Pol a: primase e sintetiza primer RNAPol a: primase e sintetiza primer RNA Pol B: elongar fita liderPol B: elongar fita lider Pol E elongar fita secundáriaPol E elongar fita secundária Pol Beta: DNA polimerase IPol Beta: DNA polimerase I Pol Y: replica DNA mitocondrialPol Y: replica DNA mitocondrial 3.Associado à proteínas básicas ricas em lisina e arginina (histonas), que depois formam o nucleossomo.

15 ORGANIZAÇÃO ESTRUTURAL DNA EUCARIOTA Histonas H1, H2A, H2B, H3 e H4 ligam-se devido à carga positiva ao DNA, carregado negativamente. Histonas H1, H2A, H2B, H3 e H4 ligam-se devido à carga positiva ao DNA, carregado negativamente. Formam-se nucleossomos (8 histonas, 2 de cada tipo) onde o DNA se enrola, torcendo-se quase 2 vezes. Formam-se nucleossomos (8 histonas, 2 de cada tipo) onde o DNA se enrola, torcendo-se quase 2 vezes. DNA ligante (50 nucleotídeos) une nucleossomos e é sustentado pela H1. DNA ligante (50 nucleotídeos) une nucleossomos e é sustentado pela H1.

16 ESTRUTURAS DOS RNAs Necessário RNA mensageiro: transcrição do DNA RNA ribossomo para a tradução (síntese da proteína) RNA transportador (ou transferência) importante para transferir aminoácidos para a síntese.

17 - RNA mensageiro cerca de 5% do RNA celular. - Transporta a mensagem genética para o citosol. - Características: longa cauda de adenina (poli A) no 3 terminal e uma cabeça de 7 metilguanosina ligada por uma ligação trifosfato. Aqui Poli A Aqui 7Gppp

18 RNAt são os menores de todos (75 a 95 resíduos). RNAt são os menores de todos (75 a 95 resíduos). Existe pelo menos 1 tipo para cada Aa codificado. Existe pelo menos 1 tipo para cada Aa codificado. Perfazem 15% do RNA celular. Perfazem 15% do RNA celular. Possuem bases incomuns e pareamento intracadeia. Possuem bases incomuns e pareamento intracadeia. Levam o Aa para o sítio de síntese e lá reconhecem o código da cadeia polipeptídica Levam o Aa para o sítio de síntese e lá reconhecem o código da cadeia polipeptídica

19 RNA RIBOSSÔMICO: RNA RIBOSSÔMICO: Encontrado em associação com proteínas diferentes, componentes do ribossomo que são os sítios de síntese protéica. Tipos: 28S, 18S,5.8S e 5S no citosol de eucariotas 23S, 16S e 5S em procariotas e mitocôndria de eucariotas (S é unidade Svedberg, relaciona com PM)

20 –Enzima Central: 4 subunidades (2 e. Responsáveis pela atividade polimerase 5-3. –Holoenzima: Considera também a subunidade O ou fator sigma permite a polimerase reconhecer regiões promotoras do DNA. A enzima central + sub O = holoenzima Região promotora serve para iniciar a transcrição e é formada por seqüência de nucleotídeos reconhecidos: –TATAAT e seqüência -35 (GGCCAATC) em procariotas –TATA box e CAAT em procariotas Seqüências de reforço (enhancers) aumentam a velocidade de iniciação e transcrição da RNA polimerase RNA POLIMERASE PROCARIOTA : RNA POLIMERASE PROCARIOTA :

21 Etapas na síntese: Iniciação pela ligação da RNA pol na região promotora. Elongação liberada a subunidade O e começa a síntese. Não requer primer como a DNA polimerase e não possui atividade de endo ou exonuclease Utiliza nucleotídeo trifosfato para a síntese. Superdobramentos resolvidos por girases. Terminação ocorre pelo reconhecimento do fator rô (p) da bactéria da sequencia de terminação

22 RNA POLIMERASE DE EUCARIOTAS –Necessita de inúmeros fatores de transcrição associados a RNA pol. –A terminação não é totalmente entendida. –RNA polimerase I: sintetiza precursor do RNA ribossômico no nucléolo. –RNA polimerase II: sintetiza precursores do RNAm e pequenos RNA nucleares –RNA polimerase III: RNA pequenos, incluindo RNAt, o ribossômico 5S e outros nucleares –RNA polimerase mitocondrial: lembra a bacteriana

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25 60S eucariota 50 prot + 5S; 5.8S e 28S RNA 40S eucariota 30 prot + 18S RNA 32 prot + 5S e 23S RNA 21 prot + 16S RNA

26 CÓDIGO GENÉTICO

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28 Gasta 2 GTP 1 para fixar o RNAt no sítio A e outro para translocação Gasta 2 ATP, 1 para ligar Aa ao RNAt (aminoacil RNAt sintetase) e outro para quebrar o PPi.

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30 SÍNTESE PROTEÍNA

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