IF803 - Introdução à Biologia Molecular Computacional

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Transcrição da apresentação:

IF803 - Introdução à Biologia Molecular Computacional Katia Guimarães

Estrutura do DNA DNA é um polímero em forma de hélice dupla. out/2007

Estrutura do DNA A unidade de construção dos ácidos nucléicos são os nucleotídeos, que consistem de um fosfato, uma pentose e de uma amina. out/2007

DNA Backbone A hélice tem uma espinha dorsal (backbone) formada por uma seqüência alternada de fosfato e ribose (açúcar) à qual se ligam bases nitrogenadas. out/2007

Estrutura do DNA PURINAS PIRIMIDINAS As bases nitrogenadas podem ser de quatro tipos: Adenina Timina PURINAS PIRIMIDINAS Guanina Citosina out/2007

Estrutura do DNA As bases nitrogenadas ligam-se ao açúcar. out/2007

Tipos de Bases: PURINAS Adenina (A) e Guanina (G) out/2007

Tipos de Bases: PIRIMIDINAS Timina (T) e Citosina (C) out/2007

Backbone DNA 5´ (CGAAT) out/2007

Dupla Hélice do DNA As bases são hidrofóbicas, e a molécula de DNA é constituída de duas hélices “costuradas”. Duas cadeias polinucleotídicas ligam-se por forças termodinâmicas (fracas), formando uma molécula de DNA. out/2007

Dupla Hélice do DNA out/2007

Dupla Hélice do DNA out/2007

Pares de Base Pares de Base são formados por dois tipos de ligação: Ligação A-T, formada por duas pontes de Hidrogênio. out/2007

Pares de Base Pares de Base são formados por dois tipos de ligação: Ligação C-G, formada por três pontes de Hidrogênio. out/2007

DNA Fita Dupla out/2007

Cadeias Anti-paralelas Analisando o conteúdo de uma das fitas de DNA, é possível conhecer o conteúdo da outra, de forma que a representação é feita apenas com uma delas. ATGTC // GACAT out/2007

Dogma Central da Biologia Como o DNA se relaciona com as proteínas? - É feita uma cópia (negativa) de um trecho de DNA (transcrição) - mRNA é traduzido em resíduos (tradução) out/2007

RNA Polimerases RNA polimerases são proteínas que se ligam ao DNA e “processam” o DNA da região upstream para a região downstream, gerando o mRNA. out/2007

Transcrição Tem três passos básicos: Initiation :O ribossomo se liga ao sítio de iniciação específico no mRNA, enquanto o tRNA iniciador é ligado ao códon iniciador e ligado ao ribossomo. Elongation : Aminoácidos são adicionados à cadeia polipeptídica, de acordo com a seqüência especificada. Os mesmos passos são repetidos até que o STOP códon sinaliza o final. Termination : A proteína é desligada do ribossomo. out/2007

Transcrição out/2007

Tradução O mRNA migra do núcleo para o citoplasma, onde estão os ribossomos. Os ribossomos são compostos de duas unidades, uma pequena e uma grande, que cercam o mRNA e – para cada códon (seqüência de três nucleotídeos) – agregam um tRNA com o aminoácido correspondente. out/2007

Tradução out/2007

Tradução Códon: GCU GAC CUA GCG Anticd: CGA CUG GAU CGC AminoAc: Ala Asp Leu Ala out/2007

Tradução via tRNA out/2007

Um Exemplo: Hemoglo- bina out/2007

Imagem real de um Ribossomo out/2007

Aminoácidos, resíduos e proteínas Os aminoácidos são os blocos construtores das proteínas. As proteínas são formadas por aminoácidos que são ligados via ligações peptídicas formando uma cadeia de resíduos. A seqüência de resíduos é chamada a estrutura primária da proteína, e é única. out/2007

Estrutura Primária de uma proteína Note o amino terminal ou "N-terminal" (NH3+) em um extremo, e o carboxyl terminal ("C-terminal") (COO-) no outro. out/2007

Resíduos Cada resíduo contém um grupo amino (NH3) e um grupo carboxílico (COOH) (em preto). Os resíduos variam no aminoácido que constitui a cadeia lateral (em azul). out/2007

Composição dos Resíduos Cada resíduo contém um grupo amino (NH3) e um grupo carboxílico (COOH) (em preto). Os resíduos variam no aminoácido que constitui a cadeia lateral (em azul). out/2007

Estrutura Secundária de uma proteína out/2007