PROJETOS GENOMA E PROTEOMA HUMANOS Haline Reis de Oliveira 07/33091 Nathália de Vargas Haar 07/50751 Genética Básica

“É o conjunto de todo material genético que define um ser vivo” O que é genoma? “É o conjunto de todo material genético que define um ser vivo”

MÉTODO DE SANGER – técnica de seqüenciamento por terminação de cadeia Como seqüenciar o DNA Subdivisão em fragmentos menores Amplificação- clonagem MÉTODO DE SANGER – técnica de seqüenciamento por terminação de cadeia

Projeto Genoma Humano Participantes: Alemanha, Austrália, Brasil, Canadá, China, Coréia, Dinamarca, Estados Unidos, França, Holanda, Israel, Itália, Japão, México, Reino Unido, Rússia, Suécia, União Européia e grandes centros de seqüenciamento Objetivos: 3 bilhões de pares de bases 100.000 genes bancos de dados. melhorar as ferramentas de análise de dados. tecnologia para o setor privado questões éticas, legais e sociais

PGH x Celera Departamento de Energia dos Estados Unidos Celera Genomics Corporation National Institute of Health (NIH) Investimento privado US$300 milhões Investimento governamental Robotização- menor custo US$ 3 bilhões Indústria farmacêutica Interesse acadêmico Royalties

Método Projeto Genoma Humano Seqüenciamento direcionado 4 5 2 1 6 3 2 4 6 1 1 3 5

Método Celera Shotgun 1 2 3 4 5 6 7 8 9 9 6 1 3 7 1 2 3 4 5 6 7 8 9 2 5 8 4

Marcos: 1990: início do projeto em um esforço conjunto do Depto de Energia e do Instituto Nacional de Saúde dos EUA. Junho de 2000: término do rascunho de todo o genoma humano. Abril de 2003: o seqüenciamento de todo o genoma humano é completado e o projeto é declarado finalizado dois anos antes da data prevista

O que o PGH nos informa? O genoma humano contém cerca de 3 bilhões de pares de nucleotídios. O tamanho médio médio de um gene é cerca de 3.000 pares de nucleotídios, mas a variação é muito grande; o maior gene humano é o da distrofina, com 2,4 milhões de pares de nucleotídios. O número de genes no genoma humano está entre 20.000 e 25.000. A seqüência de nucleotídios é muito semelhante (99,9%) entre todas as pessoas.

A função de 50% dos genes humanos descobertos é totalmente desconhecida. Menos do que 2% do genoma humano codifica proteínas. Seqüências repetitivas que não codificam proteínas (DNA lixo) constituem pelo menos 50% do genoma humano. As seqüências repetitivas parecem não desempenhar nenhuma função direta, mas elas podem ter papel na dinâmica estrutural dos cromossomos. De tempos em tempos, essas seqüências possibilitam rearranjos do genoma, criando genes novos e modificando outros.

O genoma humano possui regiões onde se concentram genes e regiões muito pobres em genes As regiões onde se concentram os genes possuem blocos ricos nas bases C e G, enquanto as regiões pobres em genes possuem blocos ricos nas bases A e T. A região rica em genes parecem se concentrar aleatoriamente no genoma, separados por longas seqüências de DNA não-codificante. O cromossomo 1 é o que contém o maior número de genes (2.968), e o cromossomo Y, o menor (231).

O que ainda não sabemos... O número de genes, suas localizações exatas e suas funções Como os genes são regulados Detalhes da estrutura dos cromossomos e da organização dos genes Os tipos de DNA não-codificante, sua quantidade, sua distribuição, se contêm algum tipo de informação e suas funções Como as células coordenam a expressão dos genes, a síntese das proteínas e os eventos pós-tradução A interação das proteínas nas complexas maquinarias celulares Explicar a conservação evolutiva entre as espécies O proteoma, ou seja, o conjunto total de proteínas e suas funções A correlação entre as diferenças genéticas entre as pessoas com a saúde e com as doenças Predizer a susceptibilidade a doenças com base na variação da seqüência gênica Os genes envolvidos em traços complexos e doenças multigênicas O controle genético do desenvolvimento

Projeto Genoma no Brasil Projeto Xylella - 1°patógeno de planta seqüenciado Projeto Genoma da cana-de-açúcar Bactéria Xilella fastidiosa Projeto Genoma da bactéria Xanthomonas citri Projeto Genoma do Câncer Humano Xanthomonas citri

Fim!