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PublicouJoão Victor Sacramento Bicalho Alterado mais de 5 anos atrás
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INTRODUÇÃO AO R E ESTATÍSTICA BÁSICA:
3 PRÁTICO: TESTE T E ANOVA LUIS ANUNCIAÇÃO (PUC-RIO) anovabr.com
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AGENDA/OBJETIVOS Teste T ANOVA Post-hoc Tamanho do efeito
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Teste T: Motivação / Pressupostos
Verificar se a média de uma característica é diferente entre dois grupos (de indivíduos) Dados aleatórios independentes e identicamente distribuídos (iid) VD contínua que segue uma distribuição normal VI fator com até dois grupos Variância homogênea (homocedasticidade)
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Família GLM Regressão VI contínua ou não ANOVA 3 ou + grupos TESTE T
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Tipos de Teste T Para 2 amostras independentes (independent sample / between samples) Verificar a diferença na pontuação de uma escala de Alteração na percepção corporal em função do sexo Para amostras pareadas (paired sample) Verificar a eficácia de um determinado tratamento em um mesmo grupo e em dois momentos diferentes Para uma única amostra (one sample) Verificar se uma determinada pessoa tem a inteligência (medida em QI) diferente do esperado (μ = 100)
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Concepção matemática 𝑇= 𝑥 1 − 𝑥 2 𝑆𝑝 1 𝑛1 + 1 𝑛 𝑆𝑝= 𝑛1−1 𝑆 𝑛2−1 𝑆 2 2 𝑛1+𝑛2 −2 df: n-2 2 amostras 𝑇= 𝑑 𝑆𝐷 𝑛 :: 𝑑 = 𝑖=1 𝑛 𝑋1−𝑋2 𝑛 :: 𝑆 2 = 𝑖=1 𝑛 𝑑 𝑖 − 𝑑 2 𝑛− df: n-1 Amostras pareadas 𝑇= 𝑥 − 𝜇 0 𝑠 𝑛 df: n-1 1 amostra / média
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Teste T H0: μ1 = μ2=0 Ha: μ1 ≠ μ2 ↓ valor de |T| ↑ valor de P T = 0.43
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Teste T H0: μ1 = μ2=0 Ha: μ1 ≠ μ2 ↑ valor de |T| ↓ valor de P T = 156
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Tamanho do efeito Nome dado a família de índices que mensuram a magnitude ou importância da diferença ou do efeito de um determinado tratamento de forma (mais) independente do tamanho amostral. Família d de Cohen D r r e R2 g de Hedges η2 e ω 2 Δ de Glass
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Tamanho do efeito Pequeno 0.2 0.1 Médio 0.5 0.3 Grande 0.8 0.5
𝑇= 𝑥 1 − 𝑥 2 𝑆𝑝 1 𝑛1 + 1 𝑛 𝑆𝑝= 𝑛1−1 𝑆 𝑛2−1 𝑆 2 2 𝑛1+𝑛2 −2 df: n-2
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DPLYR dados_brasil %>% group_by(mulheres) %>%
summarise_at(vars(bsq_soma),funs(mean, sd))
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GGPLOT2 ggplot(dados_brasil, ) x=as.factor(mulheres)
aes( , ) ggplot(dados_brasil, ) x=as.factor(mulheres) y=bsq_soma, fill=as.factor(mulheres) + geom_boxplot()
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t.test e cohen.d t.test( , ) bsq_soma ~ mulheres
alternative = c("two.sided"), data=dados_brasil ~ VI binária , VI numérica (sem agrupamento) library("effsize") cohen.d ( , ) bsq_soma ~ factor(mulheres) data=dados_brasil
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ANOVA: Motivação / Pressupostos
Verificar se a média de uma característica entre mais do que dois grupos (de indivíduos) é diferente Dados aleatórios independentes e identicamente distribuídos (iid) VD contínua que segue uma distribuição normal VI fator com grupos > 2 Variância homogênea (homocedasticidade)
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Múltiplas comparações
Normalmente, a pergunta que fazemos não é “Será que uma das médias é diferente?!”; mas sim, Qual grupo difere de qual grupo!? VD VI Depressão Jovens Adultos Idosos 1x2 1x3 2x3
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Múltiplas comparações
Leve Moderada Grave VD VI Depressão Jovens Adultos Idosos 1x2 1x3 2x3
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Múltiplas comparações
Poder computacional Family-Wise Error Rate (FWER) – Erro do tipo 1 1-(1-α)c 𝑐= 𝐾(𝐾−1) 2
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Múltiplas comparações
Family-Wise Error Rate (FWER) – Erro do tipo 1 1-(1-α)c 𝑐= 𝐾(𝐾−1) 2 Grupos α
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Múltiplas comparações
Normalmente, a pergunta que fazemos não é “Será que uma das médias é diferente?!”; mas sim, Qual grupo difere de qual grupo!? Antigamente, a ANOVA era uma requisito antes de se realizar as múltiplas comparações. Se ela fosse significativa, procedíamos às múltiplas comparações (chamadas de Post-hoc). Se não fosse significativa, pararíamos. Ou seja, ANOVA é um teste exploratório. Porém, desde que se ajuste os resultados das comparações, é possível fazer isso independente de uma ANOVA. Em outras palavras, os Post-hoc e a ANOVA não são necessariamente associados/dependentes.
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ANOVA H0: μ1 = μ2 = μ3 , ... , = μi Ha: Pelo menos uma é diferente
↓ valor de F ↑ valor de P F = 0.54 P = 0.6
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ANOVA H0: μ1 = μ2 = μ3 , ... , = μi Ha: Pelo menos uma é diferente
↑ valor de F ↓ valor de P F = 156 P =
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ANOVA – Post hoc
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DPLYR dados_brasil <- dados_brasil %>%
mutate(imc_classificacao = if_else( imc < 18.5,"Abaixo", if_else(imc >= 18.5 & imc <= 24.9, "Normal", Acima")))
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aov.test aov(bsq_soma ~ imc_classificacao, data=dados_brasil, na.action=na.omit) %>% summary() pairwise.t.test( , ) dados_brasil$bsq_soma,dados_brasil$imc_classificacao p.adj = "bonf"
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GGPLOT2 dados_brasil %>% filter(!is.na(imc_classificacao)) %>%
aes(x=imc_classificacao, y=bsq_soma)) + geom_boxplot()
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LAB
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REVISÃO
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Revisão Teste T e ANOVA trabalham em função da média
ANOVA é um teste exploratório Comparações pareadas devem ser feitas ajustando os resultados Enquanto a significância tem decisões “binárias”, o tamanho do efeito é contínuo
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SINTAXE
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REVISÃO # Estatistica no R - Aula 3 (Teste T e ANOVA) # Luis Anunciacao (Psicometria, PUC-Rio/University of Oregon) # library("tidyverse") #carregar pacote library("effsize") #Verificar medias dados_brasil %>% group_by(mulheres) %>% summarise_at(vars(bsq_soma),funs(mean, sd)) ggplot(dados_brasil, aes(x=as.factor(mulheres), y=bsq_soma, fill=as.factor(mulheres))) + geom_boxplot() + labs(title="Resultado do BSQ em função do sexo", x="Sexo", fill="Mulheres?") #Teste T #Ambiente R-Base t.test(bsq_soma ~ mulheres, alternative = c("two.sided"), data=dados_brasil) #Tamanho do efeito cohen.d(bsq_soma ~ factor(mulheres), data=dados_brasil) #ANOVA #adicionar classificação do imc dados_brasil <- dados_brasil %>% mutate(imc_classificacao = if_else(imc < 18.5,"Abaixo", if_else(imc >= 18.5 & imc <= 24.9, "Normal","Acima"))) #Realizar ANOVA (one way, 1 VI) aov(bsq_soma ~ imc_classificacao, data=dados_brasil, na.action=na.omit) %>% summary() pairwise.t.test(dados_brasil$bsq_soma,dados_brasil$imc_classificacao, p.adj = "bonf") #ajuste bonferroni pairwise.t.test(dados_brasil$bsq_soma,dados_brasil$imc_classificacao, p.adj = "none") #sem ajuste dados_brasil %>% filter(!is.na(imc_classificacao)) %>% ggplot(., aes(x=imc_classificacao, y=bsq_soma)) + geom_boxplot() # Luis Anunciacao, 2017 # This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License. #
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