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Introdução aos Scratchpads: Aproveitando melhor seus dados Laurence Livermore Natural History Museum, London Brazil November, 2012.

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1 Introdução aos Scratchpads: Aproveitando melhor seus dados Laurence Livermore Natural History Museum, London Brazil November, 2012

2 O que é Scratchpads? Sítios prontos para dados de biodiversidade, com apoio institucional Plataforma virtual para pesquisa e publicação Acesso livre, fonte livre Modular e flexível

3 O que Scratchpads não é! Um banco de dados unitário de biodiversidade Restringido por tema, geografia ou táxon Uma ferramenta excluisiva aos taxonomistas

4 De onde vêm os recursos financeiros? ViBRANT Virtual Biodiversity Research &

5 Exemplos de utilização: Taxa (Classificações, pérfis de táxons, espécimes, literatura, imagens, mapas, conjuntos de dados do fenótipo, genótipo, de morfometria, chaves, filogenias) Projetos Conservação RegiõesSociedades

6 Quem usa Scratchpads? No. total de sítios: 400+ No. total de usuários: 7,000+ Usários ativos: 5,500+ (273 w / 759 m) Contéudo : 430,000+ (nodos) Sites Users ViBRANT SP 2 Pesquisadores profissionais Naturalistas amadores Cientistas cidadão Indivídos, grupos e sociedades

7 eMonocot Scratchpads 15 sítios e crescendo 40+ usuários internacionais Scratchpads / eMonocot Portal online! Listagem dos sítios:

8 Por que Scratchpads? A Ciência é global Precisa de padronização global Workflows globais Cooperação de institutos e organizações de grande porte

9 Por que Scratchpads? Ciência é realizada locally Por cientistas do local Em colaboração com infraestruturas locais Com apoio financeiro do local

10 Por que Scratchpads? Isso resulta em : Uma paisagem complexa, fragmentada e de navegação difícil Fontes dispersas de dados Dificuldades em coletar informações para pesquisa

11 Porque precisa mudar? Problemas com dados publicados pela maneira tradicional: Maioria de descrições sob controle de reprodução (~1923) Acesso Livre limitado Ausência de mecanismo para atualização e correção Ausência (quase) de integração de dados (exceto citações) Ausência de mecanismos para engajar a comunidade

12 Porque precisa mudar? Resultado: Grandes quantidades de conhecimento taxonômico não publicado Conhecimento não publicado não pode ser mobilisado para fins úteis Impact científico baixo (mas longa meia-vida)

13 O Conceito Scratchpad Um Scratchpad é sítio que abriga dados para voce e sua comunidade Seus dados Dados externos e serviços

14 O que pode fazer Scratchpads? Páginas de taxon (geradas a partir de conteúdo etiquetado) Mapas de distribuição (a partir de espécimes e regiões TDWG - Brummitt, 2001) Registros de espécimes Matrizes de caracteres

15 Example Taxon Page

16 Example regional distribution

17 O que pode fazer Scratchpads? Gerência de bibliografia Imagens, video e som (importação em massa) Importação de planilhas Excel

18 Example Literature

19 O que pode fazer Scratchpads? Editação de dados em tabela Conteúdo específico ao pedido de usuário Gerenciamento dos usuários Formulários (planilhas) específico ao pedido de usuário Medidas analíticas do uso do sítio.

20 Medidas analíticas

21 O que pode fazer Scratchpads? Exportação de Darwin Core Archive (links a eMonocot Portal e EOL) Importação de dados de EOL (taxonomia, informação sobre espécies) Integração de mapas da GBIF

22 Importação e exportação de dados de Scratchpads

23 Quais novas funções vêm logo? Chaves baseadas em matrizes (usando projeto de caracteres) Ferramenta para publicação- submeter manuscritos pelo seu site para Phytokeys ou Biodiversity Data Journal (NOVO) Checklists, apoio para linguagens múltiplas, outros!

24 Amostras do protótipo: ferramenta de publicação ID Key preview Multi-figure platesPlate layout ID Key builder Manuscript preview

25 Apoio In-site Support -One click help within your site Wiki -Training manuals, videos & glossary Training Courses (12 in 2012) -UK (6), Sweden, (2) Greece (1), Bulgaria (1), South Africa (1), Brazil (1) Ambassadors Programme -Enthusiastic experienced users -Local support Embedded Issues Queue -Bug reports -Feature requests Sandbox Site -http://sandbox.scratchpad.euhttp://sandbox.scratchpad.eu

26 Scratchpad technical development -Simon Rycroft, Ben Scott, Ed Baker, Alice Heaton & Katherine Boulton Scratchpad outreach -Irina Brake & Dimitris Koureas E-Monocot -Paul Wilkin & the Kew team, Charles Godfray & the Oxford team ViBRANT -Vince Smith, Dave Roberts & Lucy Reeve Our 7,000+ users Agradecimentos


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