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Integração e disseminação de dados sobre espécies e espécimes: a experiência da Rede speciesLink Conferência Científica Internacional Amazônia em Perspectiva.

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1 Integração e disseminação de dados sobre espécies e espécimes: a experiência da Rede speciesLink Conferência Científica Internacional Amazônia em Perspectiva Manaus, 18 Novembro de 2008 Redes de Coleções Biológicas

2 Bioinformática, informática para biodiversidade, ecoinformática e coleções biológicas

3 Padrões e protocolos interoperabilidade entre sistemas de informação Acesso dinâmico e transparente à dados distribuídos sobre biodiversidade Global Biodiversity Information Facility (GBIF) 160 mihões de registros de > 200 provedores de dados > coleções biológicas Rede speciesLink (Brasil) 2.9 milhões de registros 150 coleções/sub-coleções Informação integrada sobre espécies, linhagens, genomas e ecologia

4 A importância e uso dos dados de coleções biológicas dados descritivos nomenclatura taxonomia modelagem qualidade de dados mapas dados primários educação Pesquisa tomada de decisão coleção biológica

5 Rede speciesLink

6 Protocolos para buscas em sistemas distribuidos Col 1 Col 2 Col 3 Col 4 Col 5 program search interface Win2000 Brahms Linux MySQL Win98 Access Win98 biota FreeeBSD PostgreSQL ? ? ? ? ? protocol X

7 Col 1 Col 2 Col 3 Col 4 Col 5 program search interface Win2000 Brahms Linux MySQL Win98 Access Win98 biota FreeeBSD PostgreSQL protocolo X + DarwinCore mapping Solução para interoperabilidade:

8 Solução para integração de dados distribuídos Protocolo DiGIR Aplicativos DiGIR (Portal and Providor) Modelo de dados DarwinCore 2.0 spLinker Aplicativos para exportar dados Independente da plataforma Independente do banco de dados

9 Solução: conectividade internet Centralized Search Centralized Search site speciesLink Presentation layer site speciesLink Presentation layer Perl Network not availablel 24 hoursNetwork available 24 hours Postgres PHP Provider SOAP Server SQL Mirror or cache node Data PHP Provider Collection Management System SQL Collection ACollection B Data spLi nker Collection Management system SQL Data repository Postgres PHP Provider SOAP Server SQL Indicators/DCdatabase Collection C Data spLi nker Collectione Management system SQL Data repository Advanced search & inventory Advanced search & inventory

10 Banco de dados das coleções: Campos de um registro Dados enviados ao servidor regional a serem disponibilizados on-line Filtro para dados sensíveis Mapeamento dos campos Modelo DarwinCore + Dado bloqueado

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16 Integrando dados e sistemas Exemplo: Tabebuia

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28 Ferramentas para a limpesa e correção de dados Rede speciesLink

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31 Ampliação do conhecimento sobre biodiversidade Quais espécies? Indicadoras Invasoras Ameaçadas Endêmicas Dados? Catálogos taxonômicos e listas de espécies Dados de ocorrência Amostras em coleções científicas Qualidade? Nomenclatura, georeferenciamento Esforço coletivo e processo contínuo

32 Coleções Biológicas da Rede INPA Novembro 2008

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39 Total de registros visualizados por coleção desde agosto/2007 SinBiota Herbário JBRJ NYBG_Br RPSP Herbário INPA ESA MOBOT_Br

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41 Georeferenciamento original: INPA-Hymenoptera

42 Georeferenciamento original + automático: INPA-Hymenoptera

43 INPA - Peixes Novembro 2008

44 Perfil do acervo

45 Total do acervo: Total on-line: Total georeferenciado: 0

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47 Obrigado.... Vanderlei Canhos


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