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Princípios de Genética Microbiana
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INTRODUÇÃO Estudo das semelhanças e diferenças entre os seres vivos:
hereditariedade variabilidade
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INTRODUÇÃO Descoberta da estrutura do DNA (dupla fita em helix – Watson & Crick 1953 ou 1957?) Transferência da hereditariedade Necessidade de fidelização do processo Etapas do processo: Replicação Transcrição Tradução
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DNA: Ø 2 nm (1/1,000,000,000 = 10-9) A = T C ≡ G
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INTRODUÇÃO Descoberta dupla fita (em helix) do DNA
Transferência da hereditariedade Importância da fidelização do processo Etapas do processo: Replicação Transcrição Tradução
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DNA de bactéria: 45,000,000 de nucleotídeos
Superenovelamento positivo ou negativo
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Eucariotos: superenovelamento estabilizado pelas histonas
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ENZIMAS ENVOLVIDAS NA REPLICAÇÃO
Topoisomerases: relaxa o DNA (DNA girase) Helicases: ssDNA DNA polimerases: nucleotídeos acoplados via ligações fosfodiester à fita de DNA Necessidade de primer (primases) Só ligam nucleotídeos na posição 3’-OH da fita DNA ligase (fragmentos de Okazaki) DNA metilases
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Natureza semiconservativa da replicação
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5’ 3’
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Garfo de replicação (eucariotos)
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filme
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Replicação de DNA nos procariontes
Termino de replicação Replicação de DNA nos procariontes
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ENZIMAS ENVOLVIDAS NA REPLICAÇÃO
Topoisomerases: relaxa o DNA (DNA girase) Helicases: ssDNA DNA polimerases: nucleotídeos acoplados via ligações fosfodiester a fita de DNA Necessidade de primer (primases) Só ligam nucleotídeos na posição 3’-OH da fita DNA ligase (fragmentos de Okazaki) DNA metilases
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TRANSCRIÇÃO (DNA RNA) Uma fita do DNA serve de molde (sense strand)
Tem Uracil (U) no lugar de Timina (T) RNA fita simples Três tipos de RNA com diferentes funções: mRNA (RNA mensageiro): especifica a sequência de aa tRNA (RNA de transferência): usa a informação contida no mRNA e traduz essa informação em uma sequência de aa rRNA (RNA ribossômico): forma os ribossomos responsáveis pela tradução do RNA em proteínas
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TRADUÇÃO (DNA PROTEÍNAS)
Participação do: mRNA e tRNA códon anticódon Aminoácidos Proteínas
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2a base U C A G 1a base UUU (Phe/F) Fenilalanina UUC (Phe/F) Fenilalanina UUA (Leu/L) Leucina UUG (Leu/L) Leucina UCU (Ser/S) Serina UCC (Ser/S) Serina UCA (Ser/S) Serina UCG (Ser/S) Serina UAU (Tyr/Y) Tirosina UAC (Tyr/Y) Tirosina UAA "Ocre" (Stop) UAG "Âmbar" (Stop) UGU (Cys/C) Cisteína UGC (Cys/C) Cisteína UGA "Opala" (Stop) UGG (Trp/W) Triptofano CUU (Leu/L) Leucina CUC (Leu/L) Leucina CUA (Leu/L) Leucina CUG (Leu/L) Leucina CCU (Pro/P) Prolina CCC (Pro/P) Prolina CCA (Pro/P) Prolina CCG (Pro/P) Prolina CAU (His/H) Histidina CAC (His/H) Histidina CAA (Gln/Q) Glutamina CAG (Gln/Q) Glutamina CGU (Arg/R) Arginina CGC (Arg/R) Arginina CGA (Arg/R) Arginina CGG (Arg/R) Arginina AUU (Ile/I) Isoleucina AUC (Ile/I) Isoleucina AUA (Ile/I) Isoleucina AUG (Met/M) Metionina, Start ACU (Thr/T)Treonina ACC (Thr/T)Treonina ACA (Thr/T)Treonina ACG (Thr/T)Treonina AAU (Asn/N) Asparagina AAC (Asn/N) Asparagina AAA (Lys/K) Lisina AAG (Lys/K) Lisina AGU (Ser/S) Serina AGC (Ser/S) Serina AGA (Arg/R) Arginina AGG (Arg/R) Arginina GUU (Val/V) Valina GUC (Val/V) Valina GUA (Val/V) Valina GUG (Val/V) Valina GCU (Ala/A) Alanina GCC (Ala/A) Alanina GCA (Ala/A) Alanina GCG (Ala/A) Alanina GAU (Asp/D) Ácido aspártico GAC (Asp/D) Ácido aspártico GAA (Glu/E) Ácido glutâmico GAG (Glu/E) Ácido glutâmico GGU (Gly/G) Glicina GGC (Gly/G) Glicina GGA (Gly/G) Glicina GGG (Gly/G) Glicina
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Sitio E: estrutural Sitio P: peptídico Sitio A: aminoacil
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filme
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Variabilidade em microrganismos
Associada a duas propriedades: Genótipo: potencial total herdado Procariotos: cromossomo + qualquer DNA presente (p. ex. plasmídios) Eucariotos: cromossomo + DNA organelas Fenótipo: porção expressa do genótipo ex. Azomonas spp. meio com sacarose: colônias mucosas meio sem sacarose: colônicas secas
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VARIAÇÕES GENOTÍPICAS
Ocorre graças a dois mecanismos: Mutações Recombinação genética
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VARIAÇÕES GENOTÍPICAS
Mutações Mudanças hereditárias na sequência de nucleotídeos de um gene Diferentes tipos Substituição de bases Mutações de remoção Adição ou perda de bases (proteínas não funcionais) Mutações sem sentido (término da cadeia de aa) Mutações silenciosas Mutações de supressão (corrigem mutações)
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VARIAÇÕES GENOTÍPICAS
ALI VAI RUI COM LIA XXX Substituição ALI VAI RUI COM BIA XXX Remoção ALI AIR UIC OML IAX XX Inserção ALT IVA IRU ICO MLI AXX
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Substituição de uma base (pontual)
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COMO DETECTAR MUTAÇÕES
Serratia marcescens: vermelho normal, cinza mutantes
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COMO DETECTAR MUTAÇÕES
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AGENTES MUTAGÊNICOS Agentes químicos: análogos de base
Radiações: raios-X, luz ultra-violeta Transposons
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AGENTES MUTAGÊNICOS Agentes químicos: análogos de base
Radiações: raios-X, luz ultra-violeta Transposons
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Agentes mutagênicos e seu modo de ação
Agente Ação Resultado Análogos de base 5-bromouracil Substitui T, mas pareia Troca de AT por GC com G 2-aminopurina Substitui A, mas pareia Troca de AT por GC com C Químicos que reagem com o DNA Ácido nitroso (HNO2) Desamina A e C Troca de AT por GC Troca de GC por AT Hidroxilamina (NH2OH) Reage com C Troca de GC por AT Agentes alquilantes Monofuncional (ex. sulfonato de Metilação de G, que passa Troca de GC por AT etil metano) a parear com T Bifuncionais (ex. gás mostarda, Ligação cruzada das fitas de Mutação pontual e nitrosoguanidina) DNA, a região é cortada deleção pela DNA polimerase Corantes intercaladores Acridinas, brometo de etídio Inserem-se entre nucleotídeos Microinserções e microdeleções Radiação Ultravioleta Formação de dímeros de Reparos podem levar pirimidina erros ou deleções Radiação ionizante (ex. raios X) Formação de radicais livres que quebram o DNA
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AGENTES MUTAGÊNICOS Agentes químicos: análogos de bases
Radiações: raios-X, luz ultra-violeta Transposons
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Mutagênese por elementos transponíveis
* transposase * repetições invertidas * baixa frequência: 10-5 a 10-7 por geração (1/10,000,000)
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DADOS SOBRE MUTAÇÃO Frequência de mutação:
10-7 (1/10,000,000) a ( 1/100,000,000,000) por par de nucleotídeo Gene típico possui pb, haveria 10-4 a 10-8 erros por geração Algumas mutações são mais frequentes que outras
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RECOMBINAÇÃO GENÉTICA
Formação de um novo genótipo Trocas de material genético entre dois cromossomos homólogos (crossing over) eucariotos: MEIOSE procariotos: TRANSFERÊNCIA/RECOMBINAÇÃO
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RECOMBINAÇÃO GENÉTICA
Transformação Avery, MacLeod & McCarthy (1944) Conjugação Ledeberg & Tatum (1946) Transdução Zinder & Ledeberg (1952)
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RECOMBINAÇÃO GENÉTICA
Transformação Grifith (1928) Avery, MacLeod & McCarthy (1944) Watson & Crick (1953)
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Recombinação genética
Transformação
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Recombinação genética
Experimento de Griffith (1928)
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RECOMBINAÇÃO GENÉTICA
Conjugação Ledeberg & Tatum (1946) Natureza: contato entre células plasmídeo ou cromossomo
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Conjugação
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Conjugação
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RECOMBINAÇÃO GENÉTICA
Transdução Lederberg & Zinder (1952): Salmonella typhimurium Natureza: vírus como vetor (bacteriófagos ou fagos) generalizada e especializada
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Transdução generalizada
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