Coleção Brasileira de Microrganismos de Ambiente e Indústria CBMAI Divisão de Recursos Microbianos CPQBA/UNICAMP drm@cpqba.unicamp.br

Locação Institucional Divisão de Recursos Microbianos (DRM) CPQBA/UNICAMP Coord.: Gilson P. Manfio suporte financeiro UNICAMP FINEP/MCT FAPESP http://www.cpqba.unicamp.br

Equipe Gilson P. Manfio, Ph.D Valéria Maia de Oliveira, Dr. sistemática microbiana Valéria Maia de Oliveira, Dr. biologia molecular, filogenia, caracterização molecular de bactérias Mônica M. de Sillos Castro, Ms. taxonomia e preservação de leveduras Ana Paula M. Zibordi, Bióloga taxonomia e preservação de fungos filamentosos Patrícia M. Zachelo, Técnica caracterização e preservação de microrganismos

Escopo Acervo Grupo de risco arqueas bactérias fungos filamentosos e leveduras plasmídios OGMs (certificação em andamento) Grupo de risco P1 e P2

Atividades preservação depósito base de dados distribuição público segurança base de dados distribuição identificação taxonomia polifásica caracterização convencional e molecular tipagem treinamento pesquisa assessoria

Infra-estrutura Preservação Identificação/autenticação ultracongelador -80oC liofilizador centrífugo refrigeração 4oC (Castellani) N2 líquido (no projeto) Identificação/autenticação microscopia kits rápidos sistema de fotodocumentação digital PCR grupo-específico (termocicladores) sequenciador automático sistema de eletroforese de DNA

Infra-estrutura Sistemas de Informação Informática acesso à rede do CPQBA/UNICAMP servidor de rede do CBMAI (no projeto) Sistemas de Informação Intranet gerenciamento de solicitações e serviços BIS (Biodiversity Information System) dados de catálogo gerenciamento e manutenção do acervo informação associada

Intranet CBMAI Sistema integrado para o gerenciamento de solicitações de serviços solicitação on-line de serviços, formulários cadastro de clientes andamento de serviços resultados e relatórios diário de bordo (avisos ligados à rotina) rastreabilidade

Coleção de Culturas

Acervo Bactérias: ~620 Fungos filamentosos: 19 Arqueas halofílicas: 6 Bacillus isolados de processos industriais: 200 Actinomicetos de biomas brasileiros: 426 Fungos filamentosos: 19 Arqueas halofílicas: 6 Culturas-referência para aplicação: 160 normas ASTM, BS, ABNT linhagens-tipo

Ampliação do acervo Biota/FAPESP CTPETRO Projetos Genoma Pesquisadores Ecologia molecular de bactérias degradadores de xenobióticos Acidithiobacillus spp. bactérias endofíticas fixadores de nitrogênio Microrganismos endofíticos Microrganismos produtores de compostos bioativos CTPETRO Microrganismos associados a depósitos de petróleo Projetos Genoma Crinipellis perniciosa link para dados moleculares do Projeto Pesquisadores Indústrias Outras Coleções

BIS - Biodiversity Information System dados básicos de catálogo identificação, origem, depositante... propriedades e aplicações propriedades específicas ambiente e indústria aplicação em testes, ensaios e ensino utilização em processos industriais caracterização molecular fingerprinting, seqüências dados quimiotaxonômicos informações confidenciais

BIS - Tabelas básicas Espécies Linhagens Lotes de preservação Referências Meios de cultivo

Tabela de espécies - campos Código da espécie Tipo de organismo Gênero Espécie Variedade Descrição da variedade Autor Ano Referências bibliográficas Regulations Harzard group Observação Observações Taxonomia código da espécie referência Estado alternativo morfologia Sinônimos nomenclatura

Tabelas de linhagens - campos Meio Crescimento Temperatura Observações Substrato Original Localização Geográfica Local e GPS Patogenicidade Referência Hospedeiro Nome Popular Gênero / Espécie / Variedade Ecologia Referências Propriedades Produção de Metabólitos Degradação Dados Quimiotaxonômicos Dados Moleculares Dados Confidenciais Código da Linhagem Acesso (público ou restrito) Código da Espécie Patente Observações Depositada como – cód. espécie Data do depósito Status (ativo, inativo) Preservação Histórico (outras coleções) Depositante Nome e Código Data/Endereço Coletor Identificador

Exemplo de registro no BIS Bacillus sporothermodurans Petterson et al. 0087 Roza, C.R. (158-1) =CCT 7094. Milk UHT. GO, Brazil. Fing: BOX-PCR data. Tax: [023, 024, 025] Medium BHI; 37oC - FR

BOX-PCR fingerprint. Lanes: 1, DNA marker 100 bp ladder (Amersham Biosciences); 2, strain CBMAI 0087 1 2

Exemplo de registro no BIS Cyclothyrium Petrak syn. Cytoplea Bizz. & Sacc. alt. Thyridaria Sacc. 0041 Silva, M. (FB41-6), 03/99 =CCT 6596 =CBS 109850. Estuary sediment [058]. Cubatão SP, Brazil. Degr: Degradation of pyrene, phenanthrene, anthracene, benzo[a]pyrene and bifenil [059]. Tolerant to pyrene [058]. Tax: [060] Medium MA2; 28oC - FR

Exemplo de registro no BIS Streptomyces Waksman & Henrici 0207 Sette, L.D. (LS182), 03/98. Soil contaminated with herbicide [130]. Campinas SP, Brazil. Morphology: photo [130]. Seq: rDNA 16S. Degr: Degradation of alachlor herbicide [131]. Tax: [133, 134] Medium ISP3; 30oC - FR

Optical microscopy 400X. Mycelium. Streptomyces sp. CBMAI 0207. Bennet’s Agar. 7 days, 30oC

>CBMAI 0207 Streptomyces sp. rDNA 16S partial sequence 1 TAACAmskGGGGmAATTGcCCCTTCATTyTGGGACAAGCCCTgGaAAACG 51 GGGTCTAATACCGGATAACACTCTGTCCTGCATGGGACGGGGTTGAAAGC 101 TCCGGCGGTGAAGGATGAGCCCGCGGCCTATCAGCTTGTTGGTGGGGTAA 151 TGGCCTACCAAGGCGACGACGGGTAGCCgGCCTGAGAGGGCGACCGGCCA 201 CACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGA 251 ATATTGCACAATGGGCGAAAGCCTGATGCAGCGACGCCGCGTGAGGGATG 301 ACGGCCTTCGGGTTGTAAACCTCTTTCAGCAGGGAAGAAGCGCAAGTGAC 351 GGTACCTGCAGAAGAAGCGCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAA 401 TACGTAGGGCGCAAGCGTTGTCCGGAATTATTGGGCGTAAAGAGCTCGTA 451 GGCGGCTTGTCACGTCGGATGTGAAAGCCCGGGGCTTAACCCCGGGTCTG 501 CATTCGATACGGGCTAGCTAGAGTGTGGTAGGGGAGATCGGAATTCCTGG 551 TGTAGCGGTGAAATGCGCAGATATCAGGAGGAACACCGGTGGCGAAGGCG 601 GATCTCTGGCCATTACTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGTkGGGAGCGAACA 651 GGrwTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGTTGGGaACTAGGTGTT 701 GCGACATTCCACGTCGTCGTGCCGCAGCTAACGCATTAAGTTCCCCGCCT 751 GGGAGTACGCCGCAAGGCTAAACTCAAAGGAATTGACgGGGGCCCGCACA 801 AGCAGCGGAGCATGTGGCTTAATTCGACGCAACGCGAAGAACCTTACCAA 851 GGCTTGACATATACCGGAAAGCATCAGAGATGGTGcCCCCCCTTGTGGTC 901 GGTATACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGhvmGATGTTGG 951 GTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTTCTGTGTTGCCAGCATGCCT 1001 TCGGGGTGATGGGGACTCACAGGAGACTGCCGGGGTCAACTCGGAGGAAG 1051 GTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGCCCCTTATGTCTTGGGCTGCACACG 1101 TGCTACAATGGCCGGTACAATGAGCTGCGAyGCCGCGAGGCGGAGCGAAT 1151 CTCAAAAAGCCGGTCTCAGTTCGGATTgGGGTCTGCAACTCGACCCCATG 1201 AAGTCGGAGTTGCTAGTAATCGCAGATCAGCATTGCT