EVOLUÇÃO unesp Disciplina: Prof. : Mario Luiz Teixeira de Moraes Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira Departamento de Fitotecnia, Tecnologia de Alimentos e Sócio-Economia Agronomia unesp Disciplina: EVOLUÇÃO Prof. : Mario Luiz Teixeira de Moraes COLABORADORES: Alexandre Marques da Silva Marcela Aparecida de Moraes Selma Maria Bozzite Moraes Ilha Solteira, SP 2º Semestre/2010
Aula: 29/10/2009 DISTÂNCIAS GENÉTICAS
FATORES EVOLUTIVOS DERIVA BASE GENÉTICA POPULAÇÃO FLUXO GÊNICO SELEÇÃO MUTAÇÃO
ATRIBUTOS DA DISTÂNCIA GENÉTICA ser métrica; utilizar frequências alélicas para seu cálculo; refletir predomínio dos fatores de NATUREZA GENÉTICA sobre os fatores ambientais que estão sendo avaliados.
ATRIBUTOS DA DISTÂNCIA GENÉTICA Medida de distância calculada a partir de dados fenotípicos pode ser de NATUREZA GENÉTICA Magnitude dos coeficientes de herdabilidade ou repetibilidade poderá ser utilizada para inferir sobre a NATUREZA GENÉTICA ou não da medida de distância empregada
ATRIBUTOS DA DISTÂNCIA GENÉTICA Natureza Genética depende: Do tipo de dado empregado em seu cálculo (se fenotípico, isoenzimático ou de DNA); Do modo como foram gerados esses dados (Distância Generalizada de Mahalanobis).
DISTÂNCIAS GENÉTICAS LOCO: LAP ALELOS POP N 1 2 A 33 0,47 0,53 = ? B 42 0,78 0,22 75 GST = DST/HT em que: em que: em que:
DISTÂNCIA GENÉTICA de Nei, 1973 (GST = DST/HT)
DISTÂNCIA GENÉTICA de Hedrick, 2005
DISTÂNCIA GENÉTICA de Nei, 1972 (D = -lnI) LOCO: LAP ALELOS POP N 1 2 A 33 0,47 0,53 B 42 0,78 0,22 75 em que:
DISTÂNCIA GENÉTICA de Nei, 1972 (D = -lnI) _____________________ ALELOS POP N 1 2 A 33 0,47 0,53 B 42 0,78 0,22 75
PROBABILIDADE DE ESCOLHA DE DOIS GENES IDÊNTICOS EM UMA POPULAÇÃO
DISTÂNCIA GENÉTICA de Nei, 1972 (D = -lnI) JA = (0,47)2 + (0,53)2 JA = 0,5018 JB = (0,78)2 + (0,22)2 JB = 0,6568 JAB = (0,47).(0,78) + (0,53).(0,22) JAB = 0,4832 I = JAB/√(JA.JB) I = 0,8417 D = -ln 0,8417 D = -(-0,1724) D = 0,1724
DISTÂNCIAS GENÉTICAS LOCO: LAP ALELOS POP N 1 2 A 33 0,47 0,53 = ? B 42 0,78 0,22 75 em que: em que:
DISTÂNCIA GENÉTICA de Wright, 1978 em que:
Média Ponderada do quadrado da frequência alélica _______________ ALELOS POP N 1 2 A 33 0,47 0,53 B 42 0,78 0,22 75
Média Ponderada do quadrado da frequência alélica _______________ ALELOS POP N 1 2 A 33 0,47 0,53 B 42 0,78 0,22 75
Variância de cada alelo entre as populações
Variância de cada alelo entre as populações
Soma das Variâncias de todos os alelos
Cálculo de
DISTÂNCIA GENÉTICA de Wright, 1978
DISTÂNCIA GENÉTICA WEIR (1990) - ANOVA AA = 26 Aa = 14 aa = 2 AA = 5 Aa = 21 aa= 7 Pop A Pop B
DISTÂNCIA GENÉTICA WEIR (1990) - ANOVA FV QM E(QM) POPULAÇÕES (POP) Q1 FAMÍLIAS(FAM)/POP Q2 INDIVÍDUOS(IND)/FAM/POP Q3 GEN/IND/FAM/POP Q4
DISTÂNCIA GENÉTICA WEIR (1990) - ANOVA
DISTÂNCIA GENÉTICA WEIR (1990) - ANOVA
REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS CRUZ, C.D.; VIANA, J.M.S.; CARNEIRO, P.C.S. Genética Volume II GBOL – Software para ensino e aprendizagem de genética. Viçosa: UFV, 2001. 475p. DIAS, L.A.S. Análises multidimensionais. In: ALFENAS, A.C. Eletroforese de isoenzimas e proteínas afins: fundamentos e aplicações em plantas e microrganismos. Viçosa: UFV, p.405-512, 1998. DIAS, L.A.S. Variância de freqüências alélicas. In: ALFENAS, A.C. Eletroforese de isoenzimas e proteínas afins: fundamentos e aplicações em plantas e microrganismos. Viçosa: UFV, p.381-404, 1998. FREIRE-MAIA, N. Genética de populações humanas. São Paulo: Editora da Universidade de São Paulo, 1974. 216p. FUTUYMA, D.J. Biologia evolutiva. Trad. VIVO, M. e Coord. SENE, F.M. Sociedade Brasileira de Genética/CNPq, Ribeirão Preto, 1992. 631p. HAMRICK, J.L. The distribution of genetic variation within and among natural plant populations. In: SCHONEWALD-COX, C.M.; CHAMBERS, S.M.; MACBRYDE, B.; THOMAS, W.L. (Ed.) Genetic and conservation. Menlo Park, The Benjamin/Cummings, 1983. p.335-48. HEDRICK, P.W. A standardized genetic differentiation measure. Evolution, Lancaster, v.59, n.8, p.1633-1638, 2005. LYNCH, M. & WALSH, B. Genetics and analysis of quantitative traits. Sunderland: Sinauer Associates, Inc. Publishers, 1998. 980p. HARTL, D.L. & CLARK, A.G. Principles of population genetics. Sunderland: Sinauer Associates. 1989. 682p. MORAES, M.L.T. Variabilidade genética por isoenzimas e caracteres quantitativos em duas populações naturais de aroeira Myracrodruon urundeuva F.F. & M.F. Allemão – Anacardiaceae (Syn: Astronium urundeuva (Fr. Allemão) Engler). Piracicaba, 1992. 139p. (Doutorado – ESALQ/USP). NEI, M. Analysis of gene diversity in subdivided populations. PROCEEDING OF THE NATIONAL ACADEMIC OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, Washington, 70:3321-23, 1973. NEI, M. Genetic distance between populations. American Naturalist, Lancaster, 106:283-92, 1972. VENCOVSKY, R. Análise da avariância de frequências alélicas. In: CONGRESSO LATINO AMERICANO DE GENÉTICA, 10 Rio de Janeiro, 1992. Proceedings, Revista Brasileira de Genética. Suplemento 1; Ribeirão Preto, v.15, n.1, p.53-60, 1992. WEIR, B.S. Genetic data analysis: Methods for discrete population genetic data. Sunderland, Sinauer Associates, Inc. Publishers, 1990. 377p. WRIGHT, S. Variability within and among natural populations. Chicago, University of Chicago Press, 1978. v.4, 579p. (Evolution and genetics of populations).