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Emanuel Teixeira Nº24924 Bioengenharia KEGG Bioinformática 2011-2012.

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1 Emanuel Teixeira Nº24924 Bioengenharia KEGG Bioinformática 2011-2012

2 2 KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes. Enciclopédia de genes e genomas de Kyoto Fundação devida ao programa genoma humano japonês em 1995 Colecção online de bases de dados de genómica para a análise das funções dos genes: genomas, vias enzimáticas, produtos químicos biológicos e redes de interacções moleculares nas células e variantes específicas a determinados organismos…

3 3 http://www.kegg.jp/ http://www.genome.jp/kegg/ Contem genomas completamente sequenciados e outros parcialmente, porem estes contêm anotações actualizadas a respeito das funções dos genes Contem representações gráficas (processos celulares i. e. metabolismo, transporte membranar, transdução de sinal e ciclo celular) E ainda, aplicações principalmente em JAVA que permitem navegar em mapas de genomas e ferramentas de comparação de sequências genéticas

4 KEGG Bases de Dados principais KEGG Pathway (vias e complexos) KEGG BRITE KEGG Module KEGG Mapper KEGG Atlas 4

5 5 http://www.genome.jp/kegg/kegg2.html

6 Relaciona a informação conhecida sobre redes de interacção molecular, genes e proteínas geradas por projectos de genoma, compostos bioquímicos e as suas reacções, dividindo-as pelas bases de dados respectivas. 6

7 KEGG Pathway Metabolismo; Processamento de informação genética; Processamento de informação ambiental; Processos celulares; Doenças Humanas; Desenvolvimento de medicamentos… (Trabalhos em curso: adicionar bases de dados ortológicas i.e. arvores genealógicas) 7

8 8 http://www.genome.jp/kegg/pathway.html

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10 Outras bases de dados relacionam Compostos (moleculares, celulares…); Medicamentos; Reacções (celulares, dos medicamentos…); Enzimas; … http://www.genome.jp/kegg/kegg2.html 10

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13 13 drosophila melanogaster

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