CLASSIFICAÇÃO E NOMENCLATURA DOS VÍRUS Universidade Federal do Rio Grande do Sul Instituto de Ciências Básicas da Saúde Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia Disciplina de Virologia Básica LABVIR CLASSIFICAÇÃO E NOMENCLATURA DOS VÍRUS Equipe de Virologia ICBS/UFRGS

CLASSIFICAÇÃO E NOMENCLATURA DOS VÍRUS 3186 espécies de vírus ICTV, 2016 40.000 cepas virais

http://www.ictvonline.org/index.asp

Classificação definida pelo: Comitê Internacional de Taxonomia de Vírus (ICTV) ICTVdB - The Universal Virus Database International Committee on Taxonomy of Viruses

vírus da cinomose canina Taxonomia ...virales Ordem Mononegavirales ...viridae Família Paramyxoviridae ...virinae Paramyxovirinae Subfamília ...virus Gênero Morbillivirus vírus da cinomose canina Espécie

Como se escreve? Exemplos: 1. Família Poxviridae, sub-família Chordopoxvirinae, gênero Orthopoxvirus, vírus vaccínia. 2.      Família Herpesviridae, sub-família Alphaherpesvirinae, gênero Simplexvirus, herpes vírus humano 2 (vírus do herpes simples 2).   No uso vernacular informal, deve-se substituir o uso de "ph" por "f" e o do "y" por "i", e deve-se usar assento quando apropriado. Por exemplo: alfaherpesvírus, paramixovírus, aftovírus. Fonte: Cornelia Büchen- Osmond, ICTV

Família Características estruturais; Morfológicas; Genéticas; Biológicas em comum. Família Família Herpesviridae Possuem vírions grandes; Com envelope contendo várias glicoproteínas; Capsídeo icosaédrico; Uma camada protéica – denominada tegumento – entre o capsídeo e o envelope; DNA de fita dupla linear; Capazes de estabelecer latência.

Família Herpesviridae Subfamília Alphaherpesvirinae Betaherpesvirinae Gammaherpesvirinae Gêneros Simplexvirus Varicellovirus Espécies BoHV-1 BoHV-5 SuHV-1

“Espécie de vírus é uma de vírus que constitui uma linhagem replicativa e ocupa um nicho ecológico particular” “A classificação em subespécies, cepas, variantes e isolados não existe de forma oficial, embora sua importância seja reconhecida para o diagnóstico, para estudos biológicos e moleculares e também para a produção de vacinas.”

O termo isolado (ou amostra) refere-se a um vírus que foi obtido por isolamento de uma determinada fonte de infecção (animal infectado). O termo cepa é utilizado para designar amostras de vírus que já foram bem caracterizadas e sobre as quais já se possui certo conhecimento.

Classificação viral Estrutura (morfologia): Propriedades físicas : Forma Tamanho Simetria Envelope Estrutura do genoma Propriedades físicas : Sensibilidade a agentes físicos e químicos Relações antigênicas Propriedades biológicas Estratégias de replicação Gama de hospedeiros Modo de transmissão Patogenicidade

Uma outra classificação prática, não oficial: Respiratórios: vírus que penetram no hospedeiro por inalação e produzem infecção e doença primariamente no trato respiratório. Ex: rinovírus, calicivírus; Entéricos: vírus que penetram pela via oral e replicam no trato intestinal. Ex: coronavírus, rotavírus; Arbovírus: vírus que replicam e são transmitidos por vetores artrópodos. Ex: vírus da encefalites eqüinas leste e oeste; Vírus oncogênicos: vírus com potencial para induzir transformação celular e tumores nos hospedeiros. Ex: retrovírus, papilomavírus.

Famílias virais Vírus com genoma RNA de sentido positivo Vírus com genoma RNA de sentido negativo não-segmentado Vírus com genoma RNA de sentido negativo segmentado Vírus com genoma RNA de cadeia dupla Vírus com genoma RNA que realizam transcrição reversa Vírus com genoma DNA fita simples Vírus com genoma DNA fita dupla

Vírus com genoma RNA de fita simples não segmentados, polaridade positiva: Arteriviridae Astroviridae Caliciviridae Hepeviridae Coronaviridae Picornaviridae Flaviviridae Togaviridae

CORONAVIRIDAE Coronavirus: Torovirus: ssRNA(+) CORONAVIRIDAE Envelope lipídico com peplômeros que projetam externamente (aspecto de coroa). Entre os vírus RNA é o que apresenta o maior genoma (27 a 32kb). Em humanos está relacionado a resfriados comuns. Coronavirus: Vírus da bronquite infecciosa das galinhas (IBV) Coronavírus humano (HuCoV) Vírus da pneumonia asiática (SarsCoV) Torovirus: Torovirus: EToV; BToV; SToV e HToV

Bronquite infecciosa das galinhas

Infecção respiratória Coronavírus Infecção respiratória Vírus da pneumonia asiática (SarsCoV): doença respiratória severa na Ásia.

Astrovírus Família Astroviridae 28-35 nm, aparência de estrêla com 5 - 6 pontas RNA fs+ ~7 kb, poli-A em 3’ , sem cap em 5’ 3 ORFs (overlap 70 nt entre ORF1a (protease) e ORF1b (RdRP) Mamastrovirus: gatos, suinos, ovelhas, etc Aviastrovirus: aves

Família ASTROVIRIDAE Gênero: Astrovírus RNA fs, nús 20-30 nm encontrados em fezes associados a diarréias

PICORNAVIRIDAE Gêneros: Hepatovirus (Hepatite A) ssRNA(+) PICORNAVIRIDAE Gêneros: Hepatovirus (Hepatite A) Enterovirus (poliomielite, enterovírus bovino, suíno B e humanos A, B, C e D) Rinovirus (resfriados) Aphtovirus (Febre Aftosa)

Família Picornaviridae Aphtovirus (febre aftosa)

FEBRE AFTOSA – efeitos indiretos no meio ambiente

Vacina Sabin

Família Caliciviridae RNA fita simples, nús, polaridade positiva Gêneros: Sapovírus Norovírus São as mais importantes causas de gastroenterite viral em humanos. Geralmente causam gastroenterites leves em animais jovens de várias espécies.

FLAVIVIRIDAE Gêneros: Flavivirus : vírus da febre amarela (YFV), ssRNA(+) FLAVIVIRIDAE Estão classificados vários agentes de doenças hemorrágicas e encefalites transmitidas por mosquitos. Gêneros: Flavivirus : vírus da febre amarela (YFV), vírus da dengue 1,2,3,4 vírus zika Pestivius: Vírus da diarreia viral bovina tipos 1 e 2 (BVDV1 e BVDV2) Vírus da peste suína clássica (CSFV) Hepacivirus: Hepatite C

Família Togaviridae envelopados pleomórficos (70 nm) RNA fs positiva Grupo IV : RNA fs (+) envelopados pleomórficos (70 nm) RNA fs positiva Gêneros: Alfavírus (n= 27): infectam várias espécies Causam arboviroses: ex: Encefalites equinas este, oeste, venezuelana, Chikungunya Rubivírus: Vírus da Rubéola (não é arbovirose!)

Filoviridae Paramyxoviridae Rhabdoviridae Vírus com genoma RNA de fita simples não segmentado, com polaridade negativa Filoviridae Paramyxoviridae Rhabdoviridae

FILOVIRIDAE Gêneros: – Ebolavirus: vírus Ebola. ssRNA(-) Os vírus dessa família causam doenças hemorrágicas em humanos.

ssRNA(+) - Associados principalmente a doenças respiratórias identificadas em mamíferos e aves. Paramyxoviridae Paramyxovirinae: Respirovirus: parainfluenza bovina tipo 3. Morbillivirus: cinomose, sarampo. Rubulavirus: vírus da caxumba. Pneumovirinae: Pneumovirus: Vírus sincicial respiratório bovino (BRSV) Metapneumovirus humano Metapneumovírus aviário

ssRNA(-) Rhabdoviridae - Característica morfológica lembrando um projétil de arma de fogo. Gêneros: Lyssavirus: Raiva (RV) Vesiculovirus: vírus da estomatite vesicular (VSV)

Arenaviridae Orthomyxoviridae Bunyaviridae Vírus com genoma RNA de fita simples segmentado Arenaviridae Orthomyxoviridae Bunyaviridae

LCMV-Lassa virus (Old World) complex: Gbagroube virus Ippy virus Kodoko virus Lassa virus Lujo virus Luna virus Lunk virus Lymphocytic choriomeningitis virus Merino Walk virus Menekre virus Mobala virus Mopeia virus Tacaribe virus (New World) complex: Amapari virus Chapare virus Flexal virus Guanarito virus Junin virus Latino virus Machupo virus Oliveros virus Paraná virus Pichinde virus Pirital virus Sabiá virus Tacaribe virus Tamiami virus Whitewater Arroyo virus

ORTHOMYXOVIRIDAE - myxo = muco Glicoproteínas hemaglutinina (HA) e neuraminidase (NE) Gêneros: Influenzavirus A (FluAV) Influenzavirus B (FluBV) Influenzavirus C (FluCV) Genoma segmentado : FluAV – 8 seg. FluBV – 7 seg. FluCV – 6 seg.

Vírus com genoma RNA de fita dupla Reoviridae Birnaviridae

REOVIRIDAE Gêneros: Orthoreovirus Orbivirus (língua Azul) dsRNA REOVIRIDAE - Dois capsídeos com simetria icosaédrica (20-30 nm) Gêneros: Orthoreovirus Orbivirus (língua Azul) Rotavirus

Fonte: Simone Guadagnucci Morillo PATOGÊNESE * * Os rotavírus aderem ao epitélio do trato GI (mucosa jejunal)‏ Danos da região apical das vilosidades Os rotavírus aderem ao epitélio do trato gastrointestinal (GI), infectando a superfície das células das vilosidades nas partes superiores do intestino delgado. Após a replicação viral, a infecção se dissemina pelo intestino, produzindo lesões na mucosa, com a destruição seletiva das extremidades das vilosidades do intestino e excreção viral nas fezes. Embora a infecção seja superficial, é suficiente para acionar respostas imunológicas locais e sistêmicas. Os dados são reversíveis, mas a diarréia continua até que as vilosidades se regenerem. Portanto, a gravidade das lesões determina a duração dos sintomas. A diarréia resulta da perda da área de absorção e do fluxo de água e eletrólitos pela superfície danificada. A infecção por rotavírus também tem maior probabilidade de produzir vômitos, desidratação e febre do que outros agentes patogênicos virais que causam diarréia. Há três tipos amplos de características de virulência encontradas nos agentes patogênicos da diarréia, que permitem que o organismo: (ii) possa aderir às células que revestem o intestino (ii) penetre nas células do revestimento do intestino (vírus)‏ (iii) produza toxinas. Há comprovações de que uma das proteínas do rotavírus atua com uma exotoxina que causa perda de fluido das células infectadas, de forma semelhante à shigella e ao cólera. Contudo, é a primeira vez que uma exotoxina é associada a um vírus1. Outro estudo recente sugere que o vírus ativa o sistema nervoso entérico, acionando nervos que controlam o movimento peristáltico dos intestinos e a extensão em que eles podem absorver fluidos2. Kapikian A e Chanock R. Rotaviruses. In: Fields B et al, editors. Fields Virology, 3rd ed; 1996: p. 1657–1708 1Carnell, BMJ 1996 312 927 2WHO Int J Pub Health, 2000 Aumento da Motilidade e Diminuição da Absorção Enterotoxina viral NSP4 Zuckerman A et al, eds. Principles and Practice of Clinical Virology. 2nd ed. Londres: John Wiley & Sons; 990:182. 45

Vírus com genoma RNA de fita dupla segmentado Retroviridae

ssRNA (RT) Retroviridae - Replicação viral complexa; integra seu provírus ao DNA da célula: infectam o hospedeiro para o resto da vida. - Associados a doenças tumorais e imunossupressivas. Orthoretrovirinae Alpharetrovirus: leucose aviária (ALV) Gammaretrovirus: leucose felina (FeLV) Deltateretrovirus: leucose bovina (VLB) Lentivirus: anemia infecciosa equina (EIAV) imunodeficiência felina (FIV) imunodeficiência humana (HIV)

Imunodeficiência humana (HIV)

Imunodeficiência felina (FIV)

Anelloviridae Circoviridae Parvoviridae Vírus com genoma DNA fita simples Anelloviridae Circoviridae Parvoviridae

Anelloviridae Vírus com genoma de DNA. 1,7 – 3KB Fita simples Não envelopados Muito ubíquos Associação como doenças? Ex: vírus Torque teno de diversas espécies

Circovirus Gyrovirus Ciclovirus Gêneros: CIRCOVIRIDAE ssDNA CIRCOVIRIDAE Menores vírus com genoma DNA Gêneros: Circovirus Gyrovirus Ciclovirus

CIRCOVIRIDAE Swan circovirus Goose circovirus Porcine circovirus 1 Max. divergence 309, Clustal V (PAM250) Goose circovirus Porcine circovirus 1 Porcine circovirus 2 Bat cyclovirus Cyclovirusa Cyclovirus TN18 Chicken anemia virusa Chicken anemia virusb Chicken anemia virusc Chicken gyrovirus 2 Swan circovirus genus Circovirus genus Gyrovirus genus ´Cyclovirus´ Avian gyrovirus 2

Descoberta de um novo agente : Girovírus das aves tipo 2 Discovery of a genome of a distant relative of chicken anemia virus reveals a new member of the genus Gyrovirus. Franciscus A. M. Rijsewijk, Helton F. dos Santos, Thais F. Teixeira, Samuel P. Cibulski, Ana Paula M. Varela, Diogenes Dezen, Ana Cláudia Franco, Paulo M. Roehe. Publicado em: Archives of Virology, 2011 DOI 10.1007/s00705-011-0971-6

Girovírus Circovírus

PARVOVIRIDAE Parvovirus: parvovírus canino tipos 1 e 2 (CPV-1; CPV-2), ssDNA PARVOVIRIDAE Parvovirus: parvovírus canino tipos 1 e 2 (CPV-1; CPV-2), vírus da panleucopenia felina (FPLV), parvovírus suíno (PPV), parvovírus bovino (BPV); Erythrovirus: vírus B19 humano (aborto) Dependovirus: vírus adeno-associado 2 (AAV).

Papillomaviridae Polyomaviridae Adenoviridae Hepadnaviridae Vírus com genoma DNA fita dupla Papillomaviridae Polyomaviridae Adenoviridae Hepadnaviridae Herpesviridae Poxviridae Asfarviridae

PAPILOMAVIRIDAE - Vários associados a cânceres dsDNA PAPILOMAVIRIDAE - Vários associados a cânceres Papilomavírus: - Verrugas - Epidermodisplasia verruciforme Alphapapillomavirus: vários papilomavírus humanos (protótipo: HPV-32); Betapapillomavirus: vários papilomavírus humanos (protótipo: HPV-5); Gammapapillomavirus: vários papilomavírus humanos (protótipo: HPV-4) Epsilonpapillomavirus: papilomavírus bovino tipo 5 (BPV-5);

PAPILLOMAVIRIDAE 17 Gêneros ( pelo menos!!): Alphapapillomavirus Betapapillomavirus Gammapapillomavirus Deltapapillomavirus Epsilonpapillomavirus Etapapillomavirus Iotapapillomavirus Kappapapillomavirus Lambdapapillomavirus Mupapillomavirus Nupapillomavirus Omikronpapillomavirus Pipapillomavirus Thetapapillomavirus Xipapillomavirus Zetapapillomavirus

HEPADNAVIRIDAE - Transcrição reversa 2 gêneros: dsDNA (RT) HEPADNAVIRIDAE - Transcrição reversa 2 gêneros: - Ortohepadnavirus: hepatite B (HBV) - Humano - Avihepadnavirus: vírus da hepatite B dos marrecos (DHBV)

HERPESVIRIDAE Alfaherpesvirinae Simplexvirus: Varicellovirus: dsDNA Alfaherpesvirinae Simplexvirus: Herpesvírus bovino tipo 2 Vírus do herpes simplex humano tipo 1 e 2 (HSV-1 e HSV-2) Varicellovirus: Vírus da rinotraqueíte bovina (BoHV-1) BoHV-5 SuHV-1 Mardivirus: Vírus da doença de Marek Iltovirus: Vírus da laringotraqueíte infecciosa das galinhas (ILTV)

POXVIRIDAE - Um dos maiores vírus conhecidos (~ 300 nm) dsDNA POXVIRIDAE - Um dos maiores vírus conhecidos (~ 300 nm) - simetria complexa (retangular ou ovoide) Avipoxvirus: bouba aviária Orthopoxvirus: Varíola Parapoxvirus: ectima contagioso dos ovinos (ORFV) Vários outros poxvírus

Varíola Humana (VARV)

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