Use of species and specimen data … or advantages in sharing data Dora Canhos

Some assumptions... Scientific progress depends on open access to data and information Information and communication technology are provoking an evolution on scientific thinking and organization

Data sharing data Analysis / Synthesis Publications

What happens to the data? data Analysis / Synthesis Publication Time

The data pathway... data Publications Reports Thesis Web Pages Storage

Scientific publications Are vital for scientific progress They reflect the vision of the authors Facts interpreted at a certain time If the data is to be reinterpreted by the author or by future generations it has to be available

data Internet Interface A Interface B

More beliefs... Data and information that is freely and openly accessible promotes a greater return of the public investment, stimulates innovation and informed decisions The integration of data from different disciplines, geographic spaces, analyzed by researchers also from different fields of knowledge and of different cultural origin, opens the way to new questions and to innovation

Building the knowlege base on biodiversity Collective, multi and inter-disciplinary Requires an environment for global cooperation Depends on a comparative base of data and knowledge

How to promote data sharing? Cultural barriers (internet, informatics, …) Technological limitations (interoperability, archiving, …) Legal impediments (biosafety, access to biodiversity, …) It doesnt only depend on the will to share data.... Must be organized: data models, standards, protocols... Must be feasible (doable) Must be planned: adequate resources, expertise, infrastructure

Use of data Indicators: use, content Identifying data / information gaps Data cleaning Analysis

BIOTA/FAPESP The Biodiversity Virtual Institute Overall aim: inventory and characterize the biodiversity of the State of São Paulo, and define the mechanisms for its conservation and sustainable use.

Atlas SinBiota

The main goal of speciesLink was to build a distributed system integrating several biological collections and making their primary data available on the Internet. speciesLink Distributed Information System for Biological Collections

DiGIR Portal virtual catalog users queries Collections (data providers) HTTP / XML SOAP DiGIR Provider DiGIR Provider DiGIR Provider HTTP / XML Regional Server DiGIR Provider

occurrence data temperature rainfall …. Potential distribution modeling

Byrsonima subterranea Brad. & Mark. (Malpighiaceae) Espécie considerada extinta pela lista da flora ameaçada de extinção no estado de São Paulo (SMA-SP 1997)

Byrsonima subterranea Somente um registro de ocorrência Inclusão na lista de espécies ameaçadas do Estado de São Paulo Novo registro de ocorrência na Estação Ecológica de Assis Uso da modelagem para auxiliar na localização da espécie

Modelagem de nicho fundamental para espécies com distribuição restrita ou com poucos pontos de amostragem Estação Ecológica de Assis – SP Dra Giselda Durigan Cerrado e Floresta Estacional

Precipitação Média Anual Temperatura Média Anual Ponto original da espécie Ponto próximo ao ponto original Medida da distância no espaço ambiental Tomar a medida da distância ambiental (D) para todos os pontos da região de estudo Ponto de orígem: Floresta Estadual de Asssis – IF São Paulo Modelagem de nicho fundamental para espécies com distribuição restrita ou com poucos pontos de amostragem Espécie considerada provavelmente extinta - lista da flora ameaçada de exitnção no estado de São Paulo (SMA-SP 1997) Byrsonima subterranea Brad. & Mark. (Malpighiaceae)

Área cinza = baixa similaridade ambiental Área azul = alta similaridade ambiental Fragmentos de Cerrado

Corte do Modelo utilizando dados de solo Facilitar o trabalho de campo diminuindo a área de busca Registro de mais quatro ocorrência da espécie

Possíveis Projeções Geografia Ecologia Pontos de Ocorrência Algoritmo Precipitação Temperatura Modelo do Nicho Ecológico Previsão da Distribuição Nativa Projeção sobre Clima Modificado Projeção sobre clima alterado Previsão de Invasão Projeção sobre outra região

Distribuição potencial no presente no 1% aumento anual de CO 2 0.5% aumento anual de CO 2 Modelagem para espécies arbóreas do cerrado: presente e 2 cenários futuros considerando mudanças climáticas hotspot

Crotalaria pallida (FABACEAE) Região Nativa

Crotalaria pallida (FABACEAE) Área de Invasão

Scenario involving the use of standards and protocols descriptive data nomenclature taxonomy modeling Data quality maps primary data education research Decision making Biological collection

Building data infrastructure Is a collective effort.....

Obrigada Dora Ann Lange Canhos