SNOMED CT Padrão Terminológico e Ontológico Internacional

Slides:



Advertisements
Apresentações semelhantes
PubMed/MeSH - Medical Subject Headings (módulo 4.3)
Advertisements

O que é U.E? É uma organização internacional constituída actualmente por 27 estados membros.
O Mundo em Desenvolvimento
DeCS/MeSH Descritores em Ciências da Saúde
ISO/IEC (SPICE): Resumo, Situação Atual e Participação do Brasil
“Europa para todos” Com o apoio da Comissão Europeia
Um guia para usar os recursos das editoras parceiras (módulo 3)
IX Congresso dos ROC – 26 e 27 de Outubro Expansão da Profissão - Novas Áreas de Intervenção Expansão da Profissão Novas Áreas de Intervenção Carlos.
Enterprise Knowledge Development
Projeto de Geografia.
TC – DEI, 2005/2006 » THE BEST WAY TO PREDICT THE FUTURE IS TO INVENT IT « Alan Kay.
Ensaios clínicos e a comunicação científica latino-americana
Desenvolvimento de Ontologia 101
ISKO (International Society for Knowledge Organization
Felipe Dias Maria Fernanda
Alunos: Benedito Jr, Douglas Bertol, Robson Costa
BLOCOS ECONÔMICOS E ACORDOS
(Organização dos tratados do Atlântico Norte)
University of Minho, Portugal
União Europeia Ângela Lourenço 8ºA.
Blocos econômicos mundiais
Priscilla Koppe Edson José Pacheco Percy Nohama Stefan Schulz
Ontologias Biológicas
Wilton Carlos Souza Barros Junior
Banco de Dados para classificação de produtos químicos segundo o GHS Seminário SINDIQUIM 31 de agosto de 2010 – Porto Alegre André Fenner
Pesquisa em bases de dados na área da saúde
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa Ontology Building Process: The Wine Domain João Graça, Márcio.
O que é U.E? É uma organização internacional constituída actualmente por 27 estados membros.
SNOMED CT o maior projecto de ontologias na área de saúde Stefan Schulz Institut für Medizinische Biometrie und Medizinische Informatik Universitätsklinikum.
FIPA THE FOUNDATION FOR INTELLIGENT PHYSICAL AGENTS
From digital repository to knowledge management system: the theses and dissertations database of PPGEP/UFSC Roberto Carlos dos Santos Pacheco, Vinícius.
Atuação do Terceiro Setor: Relações Sustentáveis? Sustentabilidade da Sociedade Civil & Sustentabilidade das Organizações da Sociedade Civil Mário Aquino.
Associação iiSBE Portugal “Para que o meio construído seja cada vez mais compatível com o Desenvolvimento Sustentável”
Codificação automatizada de documentos clínicos
Ontologias Biológicas para Endemias Stefan Schulz Grupo de Informática Médica Universidade de Freiburg (Alemanha) Recife 1 / 11 / 07 Freiburg Recife.
Tesauro Marilda Lopes Ginez de Lara
Renato M.E. Sabbatini, PhD
Ontologias Biológicas Filipe Santana RECIFE UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO - UFPE CENTRO DE INFORMÁTICA - CIN Tópicos Avançados em Inteligência.
A participação do Brasil no Projeto InterPARES XV Congresso Brasileiro de Arquivologia II Seminário de Documentos Eletrônicos 4 de julho de 2008.
Elementos para Blog Inteligência colaborativa Saúde Health collaborative intelligence.
Dados abertos interligados
Rafael Polo UNIRIO/PPGI.  Os seres humanos, como criadores e consumidores de conhecimento, criaram um espaço de conhecimento global. A World Wide Web.
DCMI Dublin Core Metadata Initiative por Pablo Lopes Alenquer curso Tópicos Especiais em BD2 data Março de 2000 Mestrado IM / NCE.
A Lexicon-Enhanced Method for Sentiment Classification: An Experiment on Online Product Reviews Bruno Andrade.
MCommerce Seminário GS1 Instituto Politécnico de Leiria
Campos et al. Factors associated with death from dengue in the state of Minas Gerais, Brazil: historical cohort study Objectives: To analyse the clinical.
Resultados preliminares
EPIDEMIOLOGIA (ARTIGOS) <-> CLÍNICA
UNIÃO EUROPÉIA.
EU PORTUGAL E O MUNDO.
Linguagem de programação. Histórico  Concebida em 1993 por Yukihiro Matsumoto  Primeiro livro em inglês saiu em setembro de 2000  Ruby on Rails é lançado.
 Qualidade de Vida no Ambiente de Trabalho Agosto, 2008 Working Towards Wellness.
Ambientes Virtuais de Aprendizagem O que é? ”Ambientes Virtuais de Aprendizagem são softwares que auxiliam na montagem de cursos acessíveis pela Internet.”
Ferramentas de Manipulação de Ontologias (Protégé)
Energia Eólica Wind Energy Maio / May, 2015.
Uso de Ontologias em Data Warehousing
Manuela Barreto Nunes Serviços virtuais de bibliotecas.
Dinâmica dos investimentos produtivos internacionais Aula 10_ “um mundo dominado por CGV”: a visão da OCDE profa. Maria Caramez Carlotto SCB 2° quadrimestre.
Criando Otologias em OWL com o Protégé 4.0
Elcio O. Vianna Faculdade de Medicina de Rib. Preto USP
Business Unit - Marketing Research. The Marketing Evolution Co. 2 Marketing Research with Strategic View Using its expertise in management, SMG applies.
Strategic dimensions of brazilian development Seminário internacional: Papel do Estado no Século XXI ENAP - Brasília, 3 de setembro de 2015 Mariano Francisco.
Plataforma Mundial de E-commerce local
Climate Monitoring of Grape and Wine in Brazil Maria Emília Borges Alves Researcher Brazilian Agricultural Research Corporation – Embrapa/Ministry of Agriculture,
Aspergillosis Aspergillosis is a spectrum of diseases of humans and animals caused by members of the genus Aspergillus. These include (1) mycotoxicosis.
Introduction to the Practice of Medicine - II Examination of the Abdomen Tuesday, January 28, 2003 Michael J., M.D.
Diagnostic Imaging in Child Abuse Non Accidental Trauma.
SNOMED CT o maior projeto de ontologias na área de saúde
USING AUTOMATIC ITEM GENERATION FOR ASSESSMENT IN MEDICAL EDUCATION
ISO REQUIREMENTS OVERVIEW, GOALS, CORE ELEMENTS QSE ACADEMY.
Transcrição da apresentação:

SNOMED CT Padrão Terminológico e Ontológico Internacional Stefan Schulz Institute of Medical Informatics, Statistics and Documentation (Medical University of Graz - Austria)

SNOMED CT Standardized Nomenclature of Medicine – Clinical Terms: Sistema de codificação para todo o conteúdo do prontuário eletrônico Padrão terminológico global Manutenção / desenvolvimento: IHTSDO (International Health Terminology Standards Development Organisation): Membros: Austrália, Canadá, Chipre, Dinamarca, Estônia, Islândia, Israel, Lituânia, Malta, Nova Zelândia, Polônia, Cingapura, República Eslovaca, Eslovenia, Espanha, Suécia, Holanda, Reino Unido, Estados Unidos

SNOMED: Descenvolvimento Princípios ontológicos Fusão com CTV3 (Reino Unido) Context Model Descrições lógicas SNOMED em UMLS Nomenclatura multiaxial para toda a medicina Nomenclatura Patologia IHTSDO 1965 1970 1975 1980 1985 1990 1995 2000 2005 SNOP SNOMED SNOMED II SNOMED 3.0 SNOMED 3.5 SNOMED RT SNOMED CT

SNOMED CT: SNOMED CT como vocabulário controlado SNOMED CT como sistema formal SNOMED CT como ontologia

SNOMED CT como vocabulário controlado

SNOMED CT como vocabulário controlado z.Zt. 311 000 conceitos z.Zt. 732 000 termos em Inglês Termos médicos (inclusive sinônimos e traduções) são conectados com conceitos (portadores de significado)

Déficit de versões anteriores da SNOMED D5-46210 Acute appendicitis, NOS D5-46100 Appendicitis, NOS G-A231 Acute M-41000 Acute inflammation, NOS G-C006 In T-59200 Appendix, NOS M-40000 Inflammation SNOMED INTERNATIONAL

SNOMED CT como sistema formal

SNOMED CT como sistema formal taxonomias: especialização (is-a)

SNOMED CT como sistema formal Relações (Attributos): Associated morphology Finding site (50 tipos) Restrições: lógica de descrição C1 – Rel – C2 significa: x: instanceOf(x, C1)  y: instanceOf(C2)  Rel(x,y) ou C1 ⊑  Rel.C2

Lógica descritiva

SNOMED CT como sistema formal conceitos definidos  conceitos primitivos ⊑ definierte vs. primitive Konzepte

SNOMED CT como Ontologia

SNOMED CT como Ontologia Ordem de um domínio de acordo com propriedades genéricas e invariáveis Ontologia: categorias disjuntas com critérios estritos (process, object, substance, quality) Número restrito de relações (z.B. part-of, has-location, …) „Ontological commitment“: quais são as instâncias? objetos no mundo (“minha dor de estômago”) objetos de documentação (o que está documentado sobre minha dor de cabeza conhecimento (o que o médico atualmente sabe sobre minha dor de cabeça)

SNOMED CT Top Body structure (10) Acquired body structure Anatomical organizational pattern (…) Clinical finding (22) Administrative statuses Adverse incident outcome categories (…) Environment or geographical location Environment Geogr. and/or political region of the world Event (19) Abuse Accidental event Bioterrorism related event (…) Linkage concept Attribute Link assertion Observable entity Age AND/OR growth period Body product observable (…) Clin. history / examination observable (21) Device observable Drug therapy observable Feature of Entity (…) Organism (11) Animal Chromista Infectious agent (…) Pharmaceutical / biologic product (58) Alcohol products Alopecia preparation Alternative medicines (…) Physical force (21) Altitude Electricity (…) Physical object (8) Device Domestic, office and garden artefact Fastening (…) Procedure (23) Administrative procedure Community health procedure (…) Qualifier value (52) Action Additional dosage instructions Record artifact Record organizer Record type Situation with explicit context (17) A/N risk factors Critical incident factors (…) Social context (10) Community Family Group (…) Special concept Namespace concept Navigational concept Non-current concept Specimen (45) Biopsy sample Body substance sample Cardiovascular sample Staging and scales (6) Assessment scales Endometriosis classification of American Fertility Society Substance (11) Allergen class Biological substance Body substance (…)

SNOMED CT: Relações Access (attribute) Associated finding (attribute) Associated morphology (attribute) Associated procedure (attribute) Associated with (attribute) Clinical course (attribute) Component (attribute) Direct substance (attribute) Episodicity (attribute) Finding context (attribute) Finding informer (attribute) Finding method (attribute) Finding site (attribute) Has active ingredient (attribute) Has definitional manifestation (attribute) Has dose form (attribute) Has focus (attribute) Has intent (attribute) Has interpretation (attribute) Has specimen (attribute) Interprets (attribute) Laterality (attribute) Measurement method (attribute) Method (attribute) Occurrence (attribute) Part of (attribute) Pathological process (attribute) Priority (attribute) Procedure context (attribute) Procedure device (attribute) Procedure morphology (attribute) Procedure site (attribute) Property (attribute) Recipient category (attribute) Revision status (attribute) Route of administration (attribute) Scale type (attribute) Severity (attribute) Specimen procedure (attribute) Specimen source identity (attribute) Specimen source morphology (attribute) Specimen source topography (attribute) Specimen substance (attribute) Subject of information (attribute) Subject relationship context (attribute) Surgical approach (attribute) Temporal context (attribute) Time aspect (attribute) Using energy (attribute) Using substance (attribute)

SNOMED CT : Hierarquias taxonômicas

SNOMED CT : Hierarquias taxonômicas

SNOMED CT : Hierarquias taxonômicas Root Concept: Acute appendicitis (disorder) The following 36 "Is a" antecedents are present in the SNOMED hierarchy: SNOMED CT : Hierarquias taxonômicas Root Concept: Acute appendicitis (disorder) The following 36 "Is a" antecedents are present in the SNOMED hierarchy: Disorder of appendix (disorder) Disorder of digestive system (disorder) Disease (disorder) Appendicitis (disorder) Disorder of digestive organ (disorder) Disorder of lower gastrointestinal tract (disorder) Disorder of digestive tract (disorder) Disorder of intestine (disorder) Finding by site (finding) Finding of large intestine (finding) Disorder of abdomen (disorder) Disorder of gastrointestinal tract (disorder) General finding of abdomen (finding) Disorder of large intestine (disorder) Disorder by body site (disorder) Disorder of trunk (disorder) Inflammatory disorder (disorder) Acute inflammatory disease (disorder) Inflammatory disorder of digestive tract (disorder) SNOMED CT Concept (SNOMED RT+CTV3) Abdominal organ finding (finding) Bowel finding (finding) Finding of appendix (finding) Finding of body region (finding) Inflammation of large intestine (disorder) Finding of trunk structure (finding) Disorder of body system (disorder) Inflammation of specific body organs (disorder) Inflammation of specific body structures or tissue (disorder) Inflammation of specific body systems (disorder) Inflammatory disorder of digestive system (disorder) Digestive system finding (finding) Gastrointestinal tract finding (finding) Disorder of body cavity (disorder) Clinical finding (finding) Viscus structure finding (finding)

Pre- e Póscoordinação SNOMED CT proporciona síntaxe composicional para gerar expressões complexas 413350009 | finding with explicit context | : { 246090004 | associated finding | = ( 284196006 | burn of skin | : 246112005 | severity | = 24484000 | severe | , 363698007 | finding site | = 321472003 | structure of dermatoglyphic patterns of palm |) , 408729009 | finding context | = 410515003 | known present | , 408731000 | temporal context | = 410512000 | current or specified | , 408732007 | subject relationship context | = 410604004 | subject of record | }

O que SNOMED não é Um modelo de informação (que especifica o tipo de dados a ser coletados) para um determinado conceito clinico Uma base de conhecimento a ser consumida por sistemas de apóio a decisão Necessariamente um sistema de codificação para uso médico

Futuro de SNOMED CT SNOMED CT usado como base ontológica para CID-11 (a partir de 2015) Ampliação do grupo de paises-membros (Brasil ? China?, Alemanha? França...?) Projetos de mapeamento (ICD-0, ICF, ICPC...) Casos de uso conexão com modelos de informação (HL7-CDA, openEHR, EN13606) codificação automatizada utilizando PLN

Recursos Home Page IHTSDO: www.ihtsdo.org IHTSDO em Wikipedia: http://en.wikipedia.org/wiki/IHTSDO SNOMED CT em Wikipedia: http://en.wikipedia.org/wiki/SNOMED_CT Cliniclue navegador livre: http://www.cliniclue.com/ VetMed navegador web: http://viw2.vetmed.vt.edu/sct/menu.cfm Outros navegadores: http://www.nlm.nih.gov/research/umls/Snomed/snomed_browsers.html SNOMED e Modelos de Informação: SemanticHealthNet: http://www.semantichealthnet.eu/ SNOMED via UMLS: https://uts.nlm.nih.gov/home.html Mais perguntas? Contato: Stefan Schulz: stefan.schulz@medunigraz.at