A apresentação está carregando. Por favor, espere

A apresentação está carregando. Por favor, espere

2011/2012. “Drug2Gene reports relations (i.e. binding) between genes/proteins and drugs/compounds including bioactivity data where available.” É uma base.

Apresentações semelhantes


Apresentação em tema: "2011/2012. “Drug2Gene reports relations (i.e. binding) between genes/proteins and drugs/compounds including bioactivity data where available.” É uma base."— Transcrição da apresentação:

1 2011/2012

2 “Drug2Gene reports relations (i.e. binding) between genes/proteins and drugs/compounds including bioactivity data where available.” É uma base de dados que fornece informação sobre as relações entre genes/proteínas e drogas(fármacos)/compostos, e se disponível sobre a bioactividade.

3 A informação desta base de dados é proveniente de 18 bases de dados públicas: CGDCP ChEBI ChEMBL CTD Drugbank HGNC IUPHAR Ligand Expo MICAD NCBI Gene Orthology Calculated PDBsum PDSP_Ki PharmGKB PubChem Compound PubChem Substance TTD Uniprot

4 Permite ao utilizador: Marcar Comentar Actualizar as relações (entre o gene/proteína e droga/composto). Permite num único serviço, juntar 18 bases de dados.

5 Genes OrganismNumber of Genes Danio rerio33326 Drosophila melanogaster22265 Homo sapiens29829 Mus musculus46968 Rattus norvegicus30362 Saccharomyces cerevisiae6308 Other7687217 Number of Compounds 23808596 Interactions Genes in Relations 92 190 8556 1567 1113 643 43394 Compounds in Relations 715745

6 Segundo Webstatsdomain, este tem um “alexa traffic rank” de 19 443 815, que é baixo. Significando então que o site recebe poucos utilizadores/visitas. Comparando por exemplo com o ChEBI (http://www.ebi.ac.uk/chebi/), este tem um “alexa traffic rank” de 93 306, significando então que tem muitas visitas. Concluímos então que os investigadores/utilizadores continuam a preferir usar diretamente as bases de dados, em vez de utilizarem a Drug2Gene.

7 http://www.drug2gene.com/ http://biowww.net/forums/viewthread.php?tid=1177 http://www.biotechnologyforums.com/thread-41.html http://www.webstatsdomain.com/domains/drug2gene.com/ http://www.webstatsdomain.com/domains/www.ebi.ac.uk/ http://www.metalife.com/products/metalife_trinity/drug2gene.html


Carregar ppt "2011/2012. “Drug2Gene reports relations (i.e. binding) between genes/proteins and drugs/compounds including bioactivity data where available.” É uma base."

Apresentações semelhantes


Anúncios Google