Coleção de Bactérias Instituto Oswaldo Cruz – IOC/FIOCRUZ Joseli Maria da Rocha Nogueira Departamento de Bacteriologia

Coleções de Pesquisa Instituto Oswaldo Cruz IOC/FIOCRUZ Coleção Entomológica Coleção Helmintológica Coleção de Culturas de Fungos Coleção de Febre Amarela Coleção de Bactérias Setembro, 2000 Set-00 Coleção Malacológica Coleção de Culturas do Gênero Bacillus e Gêneros Correlatos Coleção de Leishmania spp. e Endotrypanum spp. Coleção de Tripanossomatídeos

Coleções de Pesquisa Instituto Oswaldo Cruz IOC/FIOCRUZ Acervo Marco Inicial Ano/Década Tamanho Atual Localização Coleção Entomológica 1905 1.200.000 espécimens Pav. Mourisco e Pav. C. Chagas Coleção Helmintológica 1907 39.520 espécimens Pav. Cardoso Fontes Coleção de Cultura de Fungos 1922 1700 linhagens Pav. Rocha Lima Coleção de Febre Amarela 1931 500.000 amostras Pav. Lauro Travassos Coleção de Culturas de Bactérias 1930/1940 840 linhagens de referência 47.000 isolados Coleção de Culturas do Gênero Bacillus e Gêneros correlatos 1979 1181 linhagens Coleção de Malacologia 1948 4300 lotes de partes moles e conchas de gastrópodes neotropicais Pav. Adolfo Lutz Coleção de Leishmania spp. e Endotrypanum 1980 2500 / 100 cepas de referência Pav. Carlos Chagas Coleção de Tripanossomatídeos 1995 400 amostras

Coleção de Bactérias Composição do acervo IOC/FIOCRUZ Microbiologia Bacteriologia Bacillus Staphylococcus Streptococcus Salmonella Vibrio Shigella Yersinia Aeromonas Pseudomonas Listeria Leptospira Neisseria Corynebacterium Bordetella Helicobacter Campylobacter Brucella Escherichia 840 cepas padrão 47.000 isolados

Coleção de Bactérias IOC/FIOCRUZ Equipe executora Joseli Maria da Rocha Nogueira – Informatização da coleção de cultura Ronaldo Mendes Alves – Isolamento e caracterização de bactérias Wagner Thadeu Cardoso Esteves - Isolamento e caracterização de bactérias 06 pessoas a serem contratados – Apoio técnico 03 pessoas a serem contratadas - Apoio administrativo

Coleção de Bactérias Objetivos Específicos Garantir a preservação do acervo bacteriano acumulado em 70 anos (conseqüência das atividades de pesquisa e dos serviços prestados pelos CRN) Criar a infra-estrutura necessária para a disponibilizar o acervo bacteriano e prestar serviços (guarda, autenticação e fornecimento de cepas) Treinar pessoal para as atividades das coleções Elaborar um catálogo dos isolados bacterianos identificados e cepas de referência.

Coleção de Bactérias Abrangência e Aplicações Expressiva representatividade da micro-biodiversidade nativa em relação aos principais patógenos humanos e animais; Acervo referencial para produção de imunobiológicos (soros, anticorpos monoclonais, vacinas e produtos derivados de engenharia genética); Linhagens utilizadas em controle biológico e produtos farmacêuticos; Prestação de serviços de tipagem por métodos fenotípicos e baseados na análise do DNA.

Coleção de Bactérias Serviços Tipagem de novos isolados através de técnicas convencionais e/ou utilizando métodos moleculares; Depósito de culturas de microrganismos*; Fornecimento de cepas padrão e isolados clínicos ou de meio ambiente; Treinamento de pessoal*. * Integrado as atividades dos Laboratórios de Pesquisa e Centros de Referência.

Coleção de Bactérias Características principais Vinculada às atividades dos Laboratórios de Pesquisa e Centros de Referência; Ocupa o espaço físico corresponde a ocupação dos laboratórios do departamento*; Pesquisadores são os responsáveis diretos pelas atividades da coleção (bactérias utilizadas nas próprias linhas de pesquisa e atividades de prestação de serviços dos Centros de Referência); Principal demanda é da comunidade científica nacional e internacional; O crescimento decorre das atividades de pesquisa e serviços, principalmente no intercâmbio a nível nacional e internacional; Concentração nas áreas de Saúde Humana, Animal com interfaces nas questões ligadas ao Meio Ambiente; A coleção não foi estabelecida pelo valor comercial; Orientação ou tendência no sentido daquilo que é considerado relevante pelos pesquisadores responsáveis, relaciona-se com a demanda nacional no setor Saúde e linhas de pesquisa aprovadas por agências de fomento.

Coleção de Bactérias Vantagens e Limitações do Modelo Principais vantagens: Possibilidade de implementar um sistema integrado de boas práticas laboratoriais; Equipe altamente especializada no local, que pode contribuir com a caracterização de cepas, cultivo e técnicas de preservação e outras pesquisas correlatas; Principais limitações: Prestação de serviços e produtos limitada as condições operacionais e orçamento dos laboratórios de pesquisa; Não atende a demanda crescente por materiais autenticados (dificuldade de alcançar regulamentos internacionais/ gerenciamento de questões relativas a propriedade dos recursos e distribuição); A responsabilidade institucional não é explícita; Não atende a demanda de depósito para fins de obtenção de patente.

Coleção de Bactérias Grau de Informatização/Objetivos Elaborar um único banco de dados capaz de associar as diferentes ferramentas utilizadas pelos diferentes laboratórios que vão compor a coleção; Definição de “campos comuns” para agregar informações pertinentes a todos os gêneros bacterianos da coleção; Padronização do sistema de informatização.