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Reação de Polimerização em Cadeia - PCR
1-Introdução 2-Automatização da PCR 3-Sistema de reação 4-Iniciadores – primers
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A PCR é um sistema para a replicação do DNA in vitro, que permite que uma seqüência “alvo” de DNA seja amplificada em milhares de cópias em apenas algumas horas.
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Introdução 1985 – Primeira Publicação - Science
Cetus Corporation – R. Saiki; F. Faloona; G. Horn; K. Mullis; H. Erlichand; N. Arhneim. Descreveu a PCR: Fragmento específico de DNA multiplicado milhares de vezes – amplificação 1993 – Prêmio Nobel em Química Kary Mullis
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Ciclos da PCR - Gráfico 1˚ Ciclo 2˚ Ciclo
Etapa 1: DESNATURAÇÃO 94-96˚C por 30’ Etapa 2: ANELAMENTO ˚C por 1min Etapa 3: POLIMERIZAÇÃO 72˚C por 1min 1˚ Ciclo 2˚ Ciclo Número de ciclos numa reação: 30 a 35
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Taq DNA Polimerase Bactéria termoestável Thermus aquaticus
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Automatização da PCR Ciclos com oscilações entre altas e baixas temperaturas, controladas por computador Termociclador
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Componentes da PCR Mg 2+ Taq Polimerase Tampão 10x dCTP H20 Milli-Q
dGTP dNTP dATP Iniciadores: Forward/Reverse dTTP
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4-Iniciadores - primers
Tamanho – entre 10 a 30 bases Composição de bases - ~50% de G/C Seqüências – não devem ter complementaridades intra ou inter molecular Cálculo da Tm
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4-Iniciadores - primers
Cálculo da Tm - temperatura de anelamento dos iniciadores Do inglês: melting temperature Temperatura na qual se tenta obter o equilíbrio entre a formação e a dissociação dos híbridos gerados pelo estabelecimento de pontes de hidrogênio Para o cálculo: Tm= 2(A+T) + 4(G+C)
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Aplicações: Medicina forense;
identificação de patógenos (diagnóstico molecular); Genótipos (identificação de vírus, p. ex.)
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