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Taxonomia Visa classificar em grupos de acordo com propriedades físicas e químicas comuns Vírus no mesmo grupo frequentemente tem propriedades biológicas semelhantes: Replicação Doença não! (cuidado!) Transmissão

Classificação definida pelo: Comitê Internacional de Taxonomia de Vírus (ICTV) ICTVdB - The Universal Virus Database (acesso fácil na Internet) International Committee on Taxonomy of Viruses

Classificação viral Estrutura (morfologia): Propriedades físicas : Forma Tamanho Simetria Envelope Estrutura do genoma Propriedades físicas : Sensibilidade a agentes físicos e químicos Relações antigênicas Propriedades biológicas Estratégias de replicação Gama de hospedeiros Modo de transmissão Patogenicidade

Taxonomia Ordem: ... virales Família ... viridae Subfamília ... virinae Espécie/Gênero: ... virus

Ordens Seis ordens estabelecidas até o presente (ICTV): Caudovirales bacteriófagos com cauda Herpesvirales vírus herpes de eucariotos Mononegavirales RNA não segmentado polaridade negativa - plantas e animais . Nidovirales RNA polaridade positiva de vertebrados. Picornavirales pequenos vírus RNA que infectam plantas, insetos e animais. Tymovirales RNA de fita simples; infectam plantas.

Vírus com genoma RNA de fita simples não segmentados, polaridade positiva: Arteriviridae Astroviridae Caliciviridae Coronaviridae Flaviviridae Hepeviridae Picornaviridae Togaviridae

Ordem: Nidovirales Família: ARTERIVIRIDAE Grupo IV: RNA (+) fs Ordem: Nidovirales Família: ARTERIVIRIDAE Vírus da arterite equina Vírus da PRRS Vírus elevador da lactato dehidrogenase

Astrovírus Família Astroviridae 28-35 nm, aparência de estrêla com 5 - 6 pontas RNA fs+ ~7 kb, poli-A em 3’ , sem cap em 5’ 3 ORFs (overlap 70 nt entre ORF1a (protease) e ORF1b (RdRP) Dois gêneros: Mamastrovirus: gatos, suinos, ovelhas, etc Aviastrovirus: aves

Família ASTROVIRIDAE Gênero: Astrovírus RNA fs, nús 20-30 nm encontrados em fezes associados a diarréias

Família Caliciviridae RNA fita simples, nús, polaridade positiva Gêneros: Sapovírus Norovírus São as mais importantes causas de gastroenterite viral em humanos. Geralmente causam gastroenterites leves em animais jovens de várias espécies.

Ordem Nidovirales Família Coronaviridae Pleomórficos, envelopados peplômeros espaçados RNA fs positiva (+) Gêneros: Coronavírus; Torovírus Coronavírus humano (resfriados) Bronquite Infecciosa das Aves Peritonite Infecciosa dos felinos

Bronquite infecciosa das galinhas

FAMÍLIA FLAVIVIRIDAE - Flavi = amarelo - globulares (50 nm) - RNA fs positiva nucleocapsídeo icosaédrico envelopados Gêneros: Flavivírus Febre Amarela, Dengue 1,2,3,4, Zika Pestivírus Peste Suína Clássica, BVD, BDO Hepacivirus: Hepatite C (!!!)

Vírus Zika

Hepeviridae Gênero Hepevírus=> Vírus da hepatite E - RNA, não envelopado, fs, +, 7200 nt, - Com cap, poliadenilado Genoma: 5´ UTR- três ORFs - 3´UTR

Família Picornaviridae - Pico = pequeno - simetria icosaédrica (20-30 nm) - RNA (+) fs, não envelopados Gêneros: Hepatovirus (Hepatite A) Enterovírus (Polio, Coxsackie, Entero) Rinovírus (resfriados) Aftovírus (Febre Aftosa)

Vacina Sabin

Vírus da Febre Aftosa

Vírus do vale Seneca (Senecavírus) - Doença emergente em suínos !!!

Família Togaviridae envelopados pleomórficos (70 nm) RNA fs positiva Grupo IV : RNA fs (+) envelopados pleomórficos (70 nm) RNA fs positiva Gêneros: Alfavirus (n= 27): infectam várias espécies Causam diversas arboviroses: Ex: Encefalites equinas este, oeste, venezuelana, Ex: Chikungunya Rubivirus: Vírus da Rubéola (não é arbovirose!)

Vírus com genoma RNA de fita simples não segmentado, com polaridade negativa Filoviridae Paramixoviridae Rhabdoviridae

Família Filoviridae filamentosos (80-14 000 nm) envelopados RNA fs negativa Marburg Ebola

Ebola

Família Paramyxoviridae Duas sub-famílias: Paramyxovirinae: Respirovirus: Parainfluenza PI-1, PI-3, Rubulavirus: PI-2,Cachumba Morbillivirus: Cinomose, Sarampo, Morbilivírus das focas Pneumovirinae: Pneumovirus: HRSV, BRSV, Metapneumovirus humano Metapneumovírus aviário Henipavirus: Hendra, Nipah

Cinomose

Rinotraqueíte dos perús

Família Rhabdoviridae forma de bala Simetria helicoidal RNA fs negativa Gêneros: Lyssavirus: Raiva, Lagos Bat, Mokola, Obodhiang, Kotonkan Vesiculovírus: Estomatite Vesicular Efemerovirus:

Vírus com genoma RNA de fita simples, segmentado, polaridade negativa (Baltimore Grupo V) Arenaviridae Bornaviridae Bunyaviridae Orthomyxoviridae

LCMV-Lassa virus (Old World) complex: Gbagroube virus Ippy virus Kodoko virus Lassa virus Lujo virus Luna virus Lunk virus Lymphocytic choriomeningitis virus Merino Walk virus Menekre virus Mobala virus Mopeia virus Tacaribe virus (New World) complex: Amapari virus Chapare virus Flexal virus Guanarito virus Junin virus Latino virus Machupo virus Oliveros virus Paraná virus Pichinde virus Pirital virus Sabiá virus Tacaribe virus Tamiami virus Whitewater Arroyo virus

Arenavírus: genoma de RNA segmentado, polaridade negativa (mas ambisenso!) Os dois segmentos são denominados “S” (Small) e “L” (Large), Codificam 4 proteínas em sentido ambisenso, muito particular: Duas fitas de RNA sentido “ambíguo”, ou seja, parte do RNA codifica uma proteína (2), outra parte gera uma cópia de sentido positivo (mRNA) para produzir proteína viral.

Orthomyxoviridae - myxo = muco - pleomórficos - RNA fs (-) nucleocapsídeo helicoidal, segmentado (C=7; A & B= 8) - envelopados Gênero: Influenza A,B,C > importante: A

Vírus com genoma RNA de fita dupla segmentado (Baltimore grupo III) Birnaviridae Reoviridae

Família Birnaviridae sem envelope, icosaédricos RNA bisegmentado Gêneros: Aquabirnavirus; type species: Infectious pancreatic necrosis virus Avibirnavirus; type species: Infectious bursal disease virus Blosnavirus; type species: Blotched snakehead virus Entomobirnavirus; type species: Drosophila X virus

Família Reoviridae dois capsídeos com simetria icosaédrica (20-30 nm) - RNA fita dupla - não envelopados Gêneros: Orthoreovírus Orbivírus Rotavírus

Rotavirus

Reoviridae: duas subfamílias: Sedoreovirinae: contém seis gêneros: Cardoreovirus Mimoreovirus Orbivirus Phytoreovirus Rotavirus Seadornavirus Spinareovirinae: contém nove gêneros: Aquareovirus Coltivirus Cypovirus Dinovernavirus Fijivirus Idnoreovirus Mycoreovirus Orthoreovirus Oryzavirus Outro gênero não classificado: Crabreovirus[9]

Referência sobre reovírus e terapia anti-cancer: Gene Therapy of Cancer Methods in Molecular Biology™ Volume 542, 2009, pp 607-634 Oncolytic Viral Therapy Using Reovirus Chandini Thirukkumaran & Don G. Morris

Vírus RNA (+), com transcriptase reversa vírus da leucemia felina Retroviridae imunodeficiencia humana, bovina, felina, dos símios Leucose dos bovinos e das aves Visna/maedi, Artrite-encefalite caprina

Família Retroviridae nucleocapsídeo icosaédrico genoma diplóide, RNA fita simples, polaridade positiva envelopados, frágeis contém transcriptase reversa Três Gêneros: 1- Oncovírus Leucose bovina (bovine leukemia virus) HTLV (Human adult T cell leukemia virus) 2- Lentivirus: Vírus da imunodeficiência humana (HIV), Vírus da imunodeficiencia bovina (BIV), vírus da imunodeficiencia dos símios (SIV), vírus da artrite-encefalite caprina (CAEV), vírus da anemia infecciosa equina (EIAV) 3- Spumavírus

Retrovírus - Classificação

Leucose bovina

Caprine arthritis encephalitis virus (CAEV) Equine infectious anemia virus (EIAV)

Retrovírus – Retrovírus endógenos Sequências inseridas nos genomas, derivadas de infecções virais antigas => paleovirologia. Provírus integrados são passados de geração em geração. Não patogênicos => Não são mais capazes de formar uma partícula viral infecciosa. Cerca de 8% dos genomas contém retrovírus endógenos (ERVs), além de outros “elementos virais endógenos” (EVEs), derivado dos vírus Ebola, Borna e outros Sincitina: derivada de envelope de retrovírus

FIV / FeLV – Sinais Clínicos

Vírus com genoma DNA

VÍRUS DNA ANELLOVIRIDAE CIRCOVIRIDAE PARVOVIRIDAE ADENOVIRIDAE PAPILLOMAVIRIDAE PAPOVAVIRIDAE VÍRUS DNA HERPESVIRIDAE HEPADNAVIRIDAE IRIDOVIRIDAE POXVIRIDAE

Famílias de vírus com genoma DNA de fita simples Anelloviridae Vírus Torque Teno (TTV) e muitos outros Circoviridae circovírus suínos (e outros) parvovírus canino Parvoviridae vírus da panleucopenia felina parvovírus suíno parvovírus humano (B19)

Anelloviridae Vírus com genoma de DNA. 1,7 – 3KB Fita simples Não envelopados Muito ubíquos Associação como doenças? Ex: vírus Torque teno de diversas espécies

- DNA fs 1,76 a 3,7 kilobases (TTV, TTMV, TTMDV) simetria icosaédrica Família Circoviridae - DNA fs 1,76 a 3,7 kilobases (TTV, TTMV, TTMDV) simetria icosaédrica Ex: Circovírus dos suínos, Chicken Anemia, Vírus Torque teno (TTV) (humanos e muitos outros similares em diversas espécies)

Circovirose Suína (porcine circovirus type 2; PCV2)

Porcine circovirus (PCV2) detection in cytoplasm and nucleus of infected cells. Fontes: Pigsite e The Merck Vet Manual

PARVOVIRIDAE - DNA fita simples - não envelopados (15-25 nm) 3 gêneros: Parvovirus (MVM) Erythrovirus (B19) Dependovirus Eritema infeccioso Parvovirose canina, suína

Famílias de vírus com genoma de DNA de fita dupla Papilomaviridae Poliomaviridae papilomavírus > 70 adenovírus >40 Adenoviridae Herpes simples Herpesviridae Varicela-zoster Epstein-Barr Poxviridae poxvírus (em quase todas as espécies)

PAPILOMAVIRIDAE - DNA fita dupla circular - Sem envelope - Vários associados a cânceres Papilomavírus: - verrugas (>70) - condiloma acuminado - NIC - epidermodisplasia verruciforme

PAPILLOMAVIRIDAE 17 Gêneros ( pelo menos!!): Alphapapillomavirus Betapapillomavirus Gammapapillomavirus Deltapapillomavirus Epsilonpapillomavirus Etapapillomavirus Iotapapillomavirus Kappapapillomavirus Lambdapapillomavirus Mupapillomavirus Nupapillomavirus Omikronpapillomavirus Pipapillomavirus Thetapapillomavirus Xipapillomavirus Zetapapillomavirus

Hematúria enzoótica, câncer de bexiga em bovinos e papilomavírus (BPV2) A hematúria enzoótica (HE) bovina é de ocorrência mundial e apresenta caráter endêmico em regiões com pastagens infestadas com samambaia (Pteridium aquilinum). Wosiacki et al.: Semina: Ciências Agrárias, Londrina, v. 23, n. 1, p. 121-130, jan./jun. 2002 A HE é uma doença crônica caracterizada por sinais clínicos de hematúria intermitente, anemia e emagrecimento progressivo e por lesões hemorrágicas, hiperplásicas e neoplásicas da mucosa da bexiga. A ingestão de samambaia parece ativar o papilomavírus bovino tipo 2 (BPV2), talvez por supressão da resposta imune. BPV2 pode ser detectado em tumores de bexiga de bovinos e búfalos. BPV2 promove a indução da proteína viral denominada E5, uma oncoproteína que promove a divisão celular. Em búfalos, a oncoproteína E5 foi somente localizada nos tecidos tumorais da bexiga e parece estar co-localizada com o super-expresso fator de crescimento beta (β) derivado de plaquetas (“platelet derived growth factor”, ou PDGF-β.) . Roperto S et al. J Gen Virol. 2013 Feb;94(Pt 2):403-8. doi: 10.1099/vir.0.047662-0. Epub 2012 Oct 24. Bovine papillomavirus type 2 infects the urinary bladder of water buffalo (Bubalus bubalis) and plays a crucial role in bubaline urothelial carcinogenesis

BPV1, BPV2 e sarcóide equino O Sarcóide Equino (SE) é o tumor de pele mais comum em equídeos Wobeser et al. 2010. Epidemiology of equine sarcoids in horses in western Canada. Can Vet J. 2010 October; 51(10): 1103–1108. BPV1 ou BPV2 podem estar envolvidos, dependendo de outras variáveis. No RS não há estudos sobre esse tema. . Known locations of sarcoidsa Known locations of sarcoids on the body of horses and donkeys in western Canada aSome horses had sarcoids in more than 1 location on the body. Can Vet J. 2010 October; 51(10): 1103–1108 Localização no corpo Número (%) de animais com pelo menos 1 sarcóide Cabeça 307 (41.1%) Membros 149 (20.0%) Pescoço/ombro 116 (15.5%) Abdomen 81 (10.9%) Axila/ Peito 59 (7.9%) Paragenital 34 (4.6%) Total 746 (100%)

Sarcóide equino

Sarcóide equino e BPV

Papilomatose Bovina (causada por 13 tipos de Papilomavírus Bovino (BPV)

POLIOMAVIRIDAE - DNA fita dupla circular - Sem envelope - Importância em imunocomprometidos Poliomavirus: BK, JC (leucoencefalopatia multifocal progressiva)

ADENOVIRIDAE - icosaédricos - não envelopados - DNA dupla fita linear - potencial oncogênico (inativam p53 e pRb) Gêneros: - Mastadenovírus (em mamíferos) - Aviadenovírus (em aves)

Published: March 17, 2016 DOI: 10.1371/journal.pone.0151921 Metagenomic Survey of Viral Diversity Obtained from Feces of Subantarctic and South American Fur Seals Mariana Kluge , Fabrício Souza Campos , Maurício Tavares , Derek Blaese de Amorim , Fernanda Pedone Valdez , Adriana Giongo , Paulo Michel Roehe , Ana Claudia Franco 

HEPADNAVIRIDAE - fita dupla parcial de DNA - envelopado, pleomórfico - transcrição reversa 2 gêneros: - Ortohepadnavirus: Hepatite B (humanos) - Avihepadnavirus (aves)

Ordem Herpesvirales Família Herpesviridae Subfamílias: Alfaherpesvirinae (vírus do Herpes simples, vírus da Varicela/Zoster) Betaherpesvirinae (Citomegalovírus; CMV) Gamaherpesvirinae (vírus Epstein Barr; EBV)

Herpesvírus bovino tipo 1 Sinais clínicos Secreções nasais Secreções oculares Salivação excessiva Tosse Febre Abortos Foto: Fernando Spilki

Herpesvírus bovino tipo 1 IPB: balanopostite pustular infecciosa Sinais clínicos: Vesículas no pênis Pústulas Dificuldade de urinar Evita a cobertura

Herpesvírus bovino tipo 5 Encefalite herpética bovina: animal apoiando a cabeça contra objetos e cegueira Foto: Fernando Spilki Foto: Fernando Spilki

Fibropapilloma-associated turtle herpesvirus (FPTHV)

Koi herpesvírus

Família Herpesviridae Subfamília: Betaherpesvirinae Cytomegalovirus HHV-5 Muromegalovirus MCMV-1 Roseolovirus HHV-6

Família Herpesviridae Subfamília: Gammaherpesvirinae

Febre catarral maligna associada a gnús (causada pelo Herpesvírus alcelafino tipo 1, um gamaherpesvírus) Gnú

FCM transmitida por ovinos  Herpesvírus ovino tipo 2 (um gamaherpesvírus)  

POXVIRIDAE - os maiores vírus conhecidos (~ 300 nm) - simetria complexa - DNA duplo (codifica > 100 prots) - multiplicação intracitoplásmica Varíola Molusco contagioso Ectima dos ovinos Vários outros poxvírus

Família Asfarviridae Gênero: Asfivírus: Vírus da peste suína Africana Somente infecta suídeos Interesse veterinário