Coleção Brasileira de Microrganismos de Ambiente e Indústria

Apresentação em tema: "Coleção Brasileira de Microrganismos de Ambiente e Indústria"— Transcrição da apresentação:

1 Coleção Brasileira de Microrganismos de Ambiente e Indústria
CBMAI Divisão de Recursos Microbianos CPQBA/UNICAMP

2 Locação Institucional
Divisão de Recursos Microbianos (DRM) CPQBA/UNICAMP Coord.: Gilson P. Manfio suporte financeiro UNICAMP FINEP/MCT FAPESP

3 Equipe Gilson P. Manfio, Ph.D Valéria Maia de Oliveira, Dr.
sistemática microbiana Valéria Maia de Oliveira, Dr. biologia molecular, filogenia, caracterização molecular de bactérias Mônica M. de Sillos Castro, Ms. taxonomia e preservação de leveduras Ana Paula M. Zibordi, Bióloga taxonomia e preservação de fungos filamentosos Patrícia M. Zachelo, Técnica caracterização e preservação de microrganismos

4 Escopo Acervo Grupo de risco arqueas bactérias
fungos filamentosos e leveduras plasmídios OGMs (certificação em andamento) Grupo de risco P1 e P2

5 Atividades preservação depósito base de dados distribuição
público segurança base de dados distribuição identificação taxonomia polifásica caracterização convencional e molecular tipagem treinamento pesquisa assessoria

6 Infra-estrutura Preservação Identificação/autenticação
ultracongelador -80oC liofilizador centrífugo refrigeração 4oC (Castellani) N2 líquido (no projeto) Identificação/autenticação microscopia kits rápidos sistema de fotodocumentação digital PCR grupo-específico (termocicladores) sequenciador automático sistema de eletroforese de DNA

7 Infra-estrutura Sistemas de Informação Informática
acesso à rede do CPQBA/UNICAMP servidor de rede do CBMAI (no projeto) Sistemas de Informação Intranet gerenciamento de solicitações e serviços BIS (Biodiversity Information System) dados de catálogo gerenciamento e manutenção do acervo informação associada

8 Intranet CBMAI Sistema integrado para o gerenciamento de solicitações de serviços solicitação on-line de serviços, formulários cadastro de clientes andamento de serviços resultados e relatórios diário de bordo (avisos ligados à rotina) rastreabilidade

9 Coleção de Culturas

10 Acervo Bactérias: ~620 Fungos filamentosos: 19 Arqueas halofílicas: 6
Bacillus isolados de processos industriais: 200 Actinomicetos de biomas brasileiros: 426 Fungos filamentosos: 19 Arqueas halofílicas: 6 Culturas-referência para aplicação: 160 normas ASTM, BS, ABNT linhagens-tipo

11 Ampliação do acervo Biota/FAPESP CTPETRO Projetos Genoma Pesquisadores
Ecologia molecular de bactérias degradadores de xenobióticos Acidithiobacillus spp. bactérias endofíticas fixadores de nitrogênio Microrganismos endofíticos Microrganismos produtores de compostos bioativos CTPETRO Microrganismos associados a depósitos de petróleo Projetos Genoma Crinipellis perniciosa link para dados moleculares do Projeto Pesquisadores Indústrias Outras Coleções

12 BIS - Biodiversity Information System
dados básicos de catálogo identificação, origem, depositante... propriedades e aplicações propriedades específicas ambiente e indústria aplicação em testes, ensaios e ensino utilização em processos industriais caracterização molecular fingerprinting, seqüências dados quimiotaxonômicos informações confidenciais

13 BIS - Tabelas básicas Espécies Linhagens Lotes de preservação
Referências Meios de cultivo

14 Tabela de espécies - campos
Código da espécie Tipo de organismo Gênero Espécie Variedade Descrição da variedade Autor Ano Referências bibliográficas Regulations Harzard group Observação Observações Taxonomia código da espécie referência Estado alternativo morfologia Sinônimos nomenclatura

15 Tabelas de linhagens - campos
Meio Crescimento Temperatura Observações Substrato Original Localização Geográfica Local e GPS Patogenicidade Referência Hospedeiro Nome Popular Gênero / Espécie / Variedade Ecologia Referências Propriedades Produção de Metabólitos Degradação Dados Quimiotaxonômicos Dados Moleculares Dados Confidenciais Código da Linhagem Acesso (público ou restrito) Código da Espécie Patente Observações Depositada como – cód. espécie Data do depósito Status (ativo, inativo) Preservação Histórico (outras coleções) Depositante Nome e Código Data/Endereço Coletor Identificador

16 Exemplo de registro no BIS
Bacillus sporothermodurans Petterson et al. 0087 Roza, C.R. (158-1) =CCT Milk UHT. GO, Brazil. Fing: BOX-PCR data. Tax: [023, 024, 025] Medium BHI; 37oC - FR

17 BOX-PCR fingerprint. Lanes: 1, DNA marker 100 bp ladder (Amersham Biosciences); 2, strain CBMAI 0087
1 2

18 Exemplo de registro no BIS
Cyclothyrium Petrak syn. Cytoplea Bizz. & Sacc. alt. Thyridaria Sacc. 0041 Silva, M. (FB41-6), 03/99 =CCT 6596 =CBS Estuary sediment [058]. Cubatão SP, Brazil. Degr: Degradation of pyrene, phenanthrene, anthracene, benzo[a]pyrene and bifenil [059]. Tolerant to pyrene [058]. Tax: [060] Medium MA2; 28oC - FR

19 Exemplo de registro no BIS
Streptomyces Waksman & Henrici 0207 Sette, L.D. (LS182), 03/98. Soil contaminated with herbicide [130]. Campinas SP, Brazil. Morphology: photo [130]. Seq: rDNA 16S. Degr: Degradation of alachlor herbicide [131]. Tax: [133, 134] Medium ISP3; 30oC - FR

20 Optical microscopy 400X. Mycelium. Streptomyces sp. CBMAI 0207.
Bennet’s Agar. 7 days, 30oC

21 >CBMAI 0207 Streptomyces sp. rDNA 16S partial sequence
1 TAACAmskGGGGmAATTGcCCCTTCATTyTGGGACAAGCCCTgGaAAACG 51 GGGTCTAATACCGGATAACACTCTGTCCTGCATGGGACGGGGTTGAAAGC 101 TCCGGCGGTGAAGGATGAGCCCGCGGCCTATCAGCTTGTTGGTGGGGTAA 151 TGGCCTACCAAGGCGACGACGGGTAGCCgGCCTGAGAGGGCGACCGGCCA 201 CACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGA 251 ATATTGCACAATGGGCGAAAGCCTGATGCAGCGACGCCGCGTGAGGGATG 301 ACGGCCTTCGGGTTGTAAACCTCTTTCAGCAGGGAAGAAGCGCAAGTGAC 351 GGTACCTGCAGAAGAAGCGCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAA 401 TACGTAGGGCGCAAGCGTTGTCCGGAATTATTGGGCGTAAAGAGCTCGTA 451 GGCGGCTTGTCACGTCGGATGTGAAAGCCCGGGGCTTAACCCCGGGTCTG 501 CATTCGATACGGGCTAGCTAGAGTGTGGTAGGGGAGATCGGAATTCCTGG 551 TGTAGCGGTGAAATGCGCAGATATCAGGAGGAACACCGGTGGCGAAGGCG 601 GATCTCTGGCCATTACTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGTkGGGAGCGAACA 651 GGrwTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGTTGGGaACTAGGTGTT 701 GCGACATTCCACGTCGTCGTGCCGCAGCTAACGCATTAAGTTCCCCGCCT 751 GGGAGTACGCCGCAAGGCTAAACTCAAAGGAATTGACgGGGGCCCGCACA 801 AGCAGCGGAGCATGTGGCTTAATTCGACGCAACGCGAAGAACCTTACCAA 851 GGCTTGACATATACCGGAAAGCATCAGAGATGGTGcCCCCCCTTGTGGTC 901 GGTATACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGhvmGATGTTGG 951 GTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTTCTGTGTTGCCAGCATGCCT 1001 TCGGGGTGATGGGGACTCACAGGAGACTGCCGGGGTCAACTCGGAGGAAG 1051 GTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGCCCCTTATGTCTTGGGCTGCACACG 1101 TGCTACAATGGCCGGTACAATGAGCTGCGAyGCCGCGAGGCGGAGCGAAT 1151 CTCAAAAAGCCGGTCTCAGTTCGGATTgGGGTCTGCAACTCGACCCCATG 1201 AAGTCGGAGTTGCTAGTAATCGCAGATCAGCATTGCT