Genômica É a caracterização de genomas inteiros. Tenta compreender a organização molecular e as informações que ela traz.

Apresentação em tema: "Genômica É a caracterização de genomas inteiros. Tenta compreender a organização molecular e as informações que ela traz."— Transcrição da apresentação:

1 Genômica É a caracterização de genomas inteiros. Tenta compreender a organização molecular e as informações que ela traz

2 Genômica Genômica estrutural: caracteriza a natureza física dos genomas. É o sequenciamento de DNA. Genômica funcional: caracteriza o transcriptoma, ou seja toda a gama de transcritos produzidos por um determinado organismo (compara cDNA com o DNA). Proteoma: caracteriza toda a gama de proteínas codificadas

3 Projetos genômicos: aplicações práticas
Compreensão dos princípios do design dos organismos Descoberta de novos genes Descoberta do controle gênico de doenças Elucidação dos processos evolutivos Elaboração de técnicas de diagnósticos de doenças

4 Visão geral da genômica estrutural
Mapa cromossômico em níveis crescentes de resolução

5 Marcadores genéticos e como são obtidos

6 Fazendo uma biblioteca de DNA
Animação do CD

7 Avaliando polimorfismos
A coleta do DNA A coleta e a extração do DNA Fazendo gel de eletroforese DNA figerprint

8 Fazendo cópias de uma sequencia de DNA
Clonagem em plasmídeo PCR - síntese enzimática in vitro de milhões de cópias de um segmento específico de DNA, através de amplificação em ciclos, na presença da enzima DNA polimerase E para se divertir aprendendo...

9 Avaliação de polimorfismos
DNA figerprint RAPD (Random Amplification of Polymorphic DNA = DNA polimórfico amplificado aleatoriamente) é basicamente uma variação do protocolo da PCR com duas características distintas: utiliza uma sequência iniciadora única e pequena ao invés de um par de “primers” e esta tem seqüência arbitrária, portanto sua seqüência alvo é aleatória SSLP (Simple Sequence Length Polymorphism = polimorfismos de comprimento de sequencias curtas) Minisatélites (repetições em tendem (VNTR) de ~25pb) Microsatélites (repetições de 1 a 4pb sendo a mais comum CA e seu complemento GT) RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) - Envolve a clivagem do DNA por enzimas de restrição, a separação por eletroforese, em gel de agarose ou poliacrilamida, dos fragmentos gerados na clivagem e sua visualização em forma de bandas. PCR e RFLP são muito utilizados nas pesquisas de variabilidade genética de populações

10 SSLP - Minisatélites (repetições em tendem (VNTR) de ~25pb)

11 Aplicação forense de polimorfismo como minisatélites

12 SSLP – Microsatélites (repetições de 1 a 4pb sendo a mais comum CA e seu complemento GT)

13 RAPD (utiliza uma sequência iniciadora única e pequena ao invés de um par de “primers” e esta tem seqüência arbitrária, portanto sua seqüência alvo é aleatória)

14 Sequenciamento do DNA O método Dideoxi
Sequenciamento automático com corantes fluorescentes

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