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Genômica É a caracterização de genomas inteiros. Tenta compreender a organização molecular e as informações que ela traz.

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1 Genômica É a caracterização de genomas inteiros. Tenta compreender a organização molecular e as informações que ela traz

2 Genômica Genômica estrutural: caracteriza a natureza física dos genomas. É o sequenciamento de DNA. Genômica estrutural: caracteriza a natureza física dos genomas. É o sequenciamento de DNA. Genômica funcional: caracteriza o transcriptoma, ou seja toda a gama de transcritos produzidos por um determinado organismo (compara cDNA com o DNA). Genômica funcional: caracteriza o transcriptoma, ou seja toda a gama de transcritos produzidos por um determinado organismo (compara cDNA com o DNA). Proteoma: caracteriza toda a gama de proteínas codificadas Proteoma: caracteriza toda a gama de proteínas codificadas

3 Projetos genômicos: aplicações práticas Compreensão dos princípios do design dos organismos Compreensão dos princípios do design dos organismos Descoberta de novos genes Descoberta de novos genes Descoberta do controle gênico de doenças Descoberta do controle gênico de doenças Elucidação dos processos evolutivos Elucidação dos processos evolutivos Elaboração de técnicas de diagnósticos de doenças Elaboração de técnicas de diagnósticos de doenças

4 Visão geral da genômica estrutural Mapa cromossômico em níveis crescentes de resolução

5 Marcadores genéticos e como são obtidos

6 Fazendo uma biblioteca de DNA Animação do CD Animação do CD

7 Avaliando polimorfismos A coleta do DNA A coleta e a extração do DNA Fazendo gel de eletroforese 65qYDk&feature=related 65qYDk&feature=related DNA figerprint

8 Fazendo cópias de uma sequencia de DNA Clonagem em plasmídeo PCR - PCR - síntese enzimática in vitro de milhões de cópias de um segmento específico de DNA, através de amplificação em ciclos, na presença da enzima DNA polimerase kQ&feature=related kQ&feature=related E para se divertir aprendendo...

9 Avaliação de polimorfismos DNA figerprint DNA figerprint RAPD (Random Amplification of Polymorphic DNA = DNA polimórfico amplificado aleatoriamente) é basicamente uma variação do protocolo da PCR com duas características distintas: utiliza uma sequência iniciadora única e pequena ao invés de um par de primers e esta tem seqüência arbitrária, portanto sua seqüência alvo é aleatória RAPD (Random Amplification of Polymorphic DNA = DNA polimórfico amplificado aleatoriamente) é basicamente uma variação do protocolo da PCR com duas características distintas: utiliza uma sequência iniciadora única e pequena ao invés de um par de primers e esta tem seqüência arbitrária, portanto sua seqüência alvo é aleatória SSLP (Simple Sequence Length Polymorphism = polimorfismos de comprimento de sequencias curtas) SSLP (Simple Sequence Length Polymorphism = polimorfismos de comprimento de sequencias curtas) –Minisatélites (repetições em tendem (VNTR) de ~25pb) –Microsatélites (repetições de 1 a 4pb sendo a mais comum CA e seu complemento GT) RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) - RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) - Envolve a clivagem do DNA por enzimas de restrição, a separação por eletroforese, em gel de agarose ou poliacrilamida, dos fragmentos gerados na clivagem e sua visualização em forma de bandas. PCR e RFLP são muito utilizados nas pesquisas de variabilidade genética de populações

10 SSLP - Minisatélites (repetições em tendem (VNTR) de ~25pb)

11 Aplicação forense de polimorfismo como minisatélites

12 SSLP – Microsatélites (repetições de 1 a 4pb sendo a mais comum CA e seu complemento GT)

13 RAPD (utiliza uma sequência iniciadora única e pequena ao invés de um par de primers e esta tem seqüência arbitrária, portanto sua seqüência alvo é aleatória)

14 Sequenciamento do DNA O método Dideoxi Sequenciamento automático com corantes fluorescentes ure=related ure=related ure=related ure=related

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