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PublicouIsaque Martins de Lacerda Alterado mais de 8 anos atrás
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Estatística: Aplicação ao Sensoriamento Remoto SER 202 - ANO 2016 Análise de Variância (ANOVA) Camilo Daleles Rennó camilo@dpi.inpe.br http://www.dpi.inpe.br/~camilo/estatistica/
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Comparando-se médias de duas populações 11 22 n1n1 n2n2 Hipóteses H 0 : 1 - 2 = 0 ( 1 = 2 ) H 1 : 1 - 2 0 Teste z ou teste t 2
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Comparando-se médias de várias populações 11 22 n1n1 n2n2 rr nrnr Comparando-se as médias de r populações ou tratamentos... Mesmo não se conhecendo as médias i, seria possível verificar se elas são iguais a partir de seus valores amostrais? Análise de Variância (ANOVA) (ANOVA de 1 fator) 3 H 0 : 1 = 2 =... = r
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Análise de Variância (ANOVA) 11 22 rr Pressuposições: Todas r v.a. ( X 1,..., X r ) são normalmente distribuídas e têm a mesma variância!!! -- 11 ++ 22 rr X 1 ~ N( 1, 2 ) X 2 ~ N( 2, 2 ) X r ~ N( r, 2 ) Comparando-se as médias de r populações ou tratamentos... 4
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1 = X 1 - 1 2 = X 2 - 2 r = X r - r j ~ N(0, 2 ) Desvio, resíduo ou erro X 1 ~ N( 1, 2 ) X 2 ~ N( 2, 2 ) X r ~ N( r, 2 ) Análise de Variância (ANOVA) Comparando-se as médias de r populações ou tratamentos... N(0, 2)N(0, 2) -- 0 ++ 5 11 22 rr
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Análise de Variância (ANOVA) Comparando-se as médias de r populações ou tratamentos... -- 11 ++ 22 rr X j = j + j j = T + j X j = T + j + j T = média global j = efeito do tratamento j j = efeito aleatório TT erro em torno de cada média erro de cada média em torno da média global 6 11 22 rr
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Análise de Variância (ANOVA) n1n1 n2n2 nrnr Comparando-se as médias de r populações ou tratamentos... X ij é o i -ésimo elemento da amostra retirada do tratamento j j é a média populacional do tratamento j, estimado por i = 1,..., n j j = 1,..., r 7 11 22 rr
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T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Total 30395754180 T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Total 30395754180 Média 1513192718 T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Total 30395754180 Média 1513192718 njnj 233210 T1T2T3T4 X 11 X 12 X 13 X 14 X 21 X 22 X 23 X 24 X 32 X 33 Total X *1 X *2 X *3 X *4 X ** Média njnj n1n1 n2n2 n3n3 n4n4 nTnT Análise de Variância (ANOVA) 8
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Particionamento do Erro T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Total 30395754180 Média 1513192718 njnj 233210 T1T2T3T4 10 20 30 15 25 erro em relação à média global 9
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Particionamento do Erro T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Total 30395754180 Média 1513192718 njnj 233210 T1T2T3T4 10 20 30 15 25 erro em relação à média do tratamento 10
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Particionamento do Erro T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Total 30395754180 Média 1513192718 njnj 233210 T1T2T3T4 10 20 30 15 25 erro da média de cada tratamento em relação à média global 11
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Particionamento do Erro T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Total 30395754180 Média 1513192718 njnj 233210 SQTOSQTSQE = + SQTO = Soma dos Quadrados Total SQT = Soma dos Quadrados dos Tratamentos SQE = Soma dos Quadrados dos Erros ou dos Resíduos 12
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Análise de Variância (ANOVA) Fonte de Variação Soma dos Quadrados Graus de Liberdade Quadrado Médio Tratamentos Erro Total n T - 1 n T - r r - 1 QME é um estimador não-tendencioso de 2 QMT é um estimador tendencioso de 2 a menos que todos j = T, ou seja, j = 0 13
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Análise de Variância (ANOVA) Fonte de Variação Soma dos Quadrados Graus de Liberdade Quadrado Médio Tratamentos Erro Total n T - 1 n T - r r - 1 H 0 : 1 = 2 =... = r H 1 : nem todos j são iguais H 0 : j = 0 H 1 : nem todos j = 0 Se H 0 for verdadeiro: H 0 verd. H 0 falso 0 ++ 1 1 14 Se H 0 for falso:
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Análise de Variância (ANOVA) Fonte de Variação Soma dos Quadrados Graus de Liberdade Quadrado Médio Tratamentos Erro Total n T - 1 n T - r r - 1 H 0 : 1 = 2 =... = r H 1 : nem todos j são iguais H 0 : j = 0 H 1 : nem todos j = 0 Se H 0 for verdadeiro: 0 ++ 15 Se H 0 for falso: ac. H 0 rej. H 0 ANOVA é sempre um teste unilateral a direita 1
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Fórmulas Alternativas 16
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Fonte de Variação Soma dos Quadrados Graus de Liberdade Quadrado Médio F calculadoValor - P Tratamentos Erro Total 304 Análise de Variância (ANOVA) T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Total 30395754180 Média 1513192718 njnj 233210 SQTO 17
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Fonte de Variação Soma dos Quadrados Graus de Liberdade Quadrado Médio F calculadoValor - P Tratamentos 258 Erro Total 304 Análise de Variância (ANOVA) T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Total 30395754180 Média 1513192718 njnj 233210 SQT 18
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Fonte de Variação Soma dos Quadrados Graus de Liberdade Quadrado Médio F calculadoValor - P Tratamentos 258 Erro 46 Total 304 Análise de Variância (ANOVA) T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Total 30395754180 Média 1513192718 njnj 233210 SQE = SQTO - SQT 19
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Fonte de Variação Soma dos Quadrados Graus de Liberdade Quadrado Médio F calculadoValor - P Tratamentos 258 Erro 46 Total 304 Análise de Variância (ANOVA) 9 T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Total 30395754180 Média 1513192718 njnj 233210 20 GL Total = n T - 1
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Fonte de Variação Soma dos Quadrados Graus de Liberdade Quadrado Médio F calculadoValor - P Tratamentos 258 Erro 46 Total 304 Análise de Variância (ANOVA) 9 3 T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Total 30395754180 Média 1513192718 njnj 233210 21 GL Total = n T - 1 GL Trat = r - 1
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Fonte de Variação Soma dos Quadrados Graus de Liberdade Quadrado Médio F calculadoValor - P Tratamentos 258 Erro 46 Total 304 Análise de Variância (ANOVA) 9 6 3 T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Total 30395754180 Média 1513192718 njnj 233210 22 GL erro = GL Total - GL Trat GL Total = n T - 1 GL Trat = r - 1
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Fonte de Variação Soma dos Quadrados Graus de Liberdade Quadrado Médio F calculadoValor-P Tratamentos 258 Erro 46 Total 304 Análise de Variância (ANOVA) 9 6 3 7,67 86 11,20,0071 23
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Fonte de Variação Soma dos Quadrados Graus de Liberdade Quadrado Médio F calculadoValor-P Tratamentos 258 Erro 46 Total 304 Análise de Variância (ANOVA) 9 6 3 7,67 86 11,20,0071 Adotando = 5%, o que se pode concluir? Rejeito H 0, ou seja, pelo menos uma das médias é diferente das demais 0 ++ Valor-P = 0,71% 24 H 0 : 1 = 2 =... = r H 1 : nem todos j são iguais
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Análise de Variância (ANOVA) OBSERVAÇÕES: A ANOVA não considera que os tratamentos tenham algum ordenamento específico Para agregar esta informação, usa-se a Análise de Regressão ANOVA com 2 tratamentos ( r = 2 ) não deve ser realizada, uma vez que corresponde a um teste t homocedástico bilateral ANOVA pode ter mais do que 2 fatores avaliados (ANOVA multivariada) TA1TA2TA3TA4 109914 TB1 1191510 151013 TB2 20 21 18 23 21 22 29 28 25
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Análise de Variância (ANOVA) PRESSUPOSIÇÕES: Cada observação deve ser independente das demais; condição garantida pelo processo de amostragem Cada tratamento deve ter distribuição normal; o teste F para ANOVA de 1 fator é pouco afetado pela falta de normalidade dos dados (neste caso, em geral, o nível de significância real é ligeiramente diferente que o especificado) Todos os tratamentos devem ter a mesma variância; se todos tratamentos possuírem o mesmo tamanho de amostra ( n j = n ), o teste F será pouco afetado pelo fato das variâncias dos tratamentos não serem iguais (também, neste caso, o nível de significância real é apenas ligeiramente diferente que o especificado) Teste alternativo: Kruskal-Wallis (teste não paramétrico) 26
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Testes de Normalidade D’Agostino K 2, Jarque-Bera e Shapiro-Wilk testam se a curtose e a assimetria amostral podem ser obtidas a partir de uma distribuição normal Anderson Darling, Cramér-von Mises, Lilliefors, Kolmogorov-Smirnov comparam a distribuição acumulada empírica (obtida a partir de uma amostra) com uma distribuição acumulada teórica qualquer 2 de Pearson (teste de aderência) compara a distribuição empírica e uma distribuição teórica qualquer divididas em um número determinada de classes 27 Para a ANOVA, verifica-se se através dos erros amostrais estatística não-paramétrica
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Testes de Igualdade de Variâncias Bartlett baseia-se na comparação entre a média ponderada e a média geométrica das variâncias amostrais Hartley baseia-se na comparação entre os valores máximo e mínimo das variâncias amostrais Cochran baseia-se na comparação entre o máximo e a soma das variâncias amostrais Levene modificado compara os desvios médios absolutos entre e dentro de cada grupo 28
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Teste de Bartlett Se,..., são as variâncias amostrais de r populações com distribuição normal, então representa a média aritmética ponderada onde representa a média geométrica ponderada GQME QME ( GQME = QME se todas variâncias amostrais são idênticas) 29
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Teste de Bartlett onde 0 ++ H 0 verd. H 0 falso H 0 : H 1 : nem todas são iguais Se H 0 for verdadeiro: (idealmente n j 5 ) 30
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Teste de Bartlett onde 0 ++ ac. H 0 rej. H 0 H 0 : H 1 : nem todas são iguais Se H 0 for verdadeiro: (sempre teste unilateral a direita) 31
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Teste de Bartlett Usando-se o exemplo da ANOVA: T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Total s2s2 1814 njnj 233210 H 0 : H 1 : nem todas são iguais 0 ++ 0,05 Conclusão: aceito H 0 a 5%, ou seja, as variâncias dos tratamentos podem ser as mesmas 7,81 32
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T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 ANOVA: fator único Análise de Variância / EXCEL 33
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Análise de Variância / EXCEL T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Adotando = 5%, o que se pode concluir? ANOVA: fator único RESUMO GrupoContagemSomaMédiaVariância T12301518 T2339131 T3357194 T42542718 ANOVA Fonte da variaçãoSQglMQFvalor-P Entre grupos25838611,217390,007135 Dentro dos grupos4667,667 Total3049 Rejeito H 0, ou seja, pelo menos uma das médias é diferente das demais 34 H 0 : 1 = 2 =... = r H 1 : nem todos j são iguais
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H 0 : 1 = 2 =... = r H 1 : nem todos j são iguais Análise de Variância / R T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Adotando = 5%, o que se pode concluir? ANOVA: fator único Rejeito H 0, ou seja, pelo menos uma das médias é diferente das demais Analysis of Variance Table Response: dados Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F) trat 3 258 86.000 11.217 0.007135 ** Residuals 6 46 7.667 --- Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1 >dados<-c(12,18,14,12,13,19,17,21,24,30) >trat<-factor(c("t1","t1","t2","t2","t2","t3","t3","t3","t4","t4")) >resultado<-aov(dados~trat) #analise de variancia >anova(resultado) # tabela ANOVA 35
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Teste de Shapiro-Wilk / R T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Adotando = 5%, o que se pode concluir? ANOVA: fator único Aceito H 0, ou seja, os erros provém de uma distribuição normal Shapiro-Wilk normality test data: residuals(resultado) W = 0.92388, p-value = 0.3905 >dados<-c(12,18,14,12,13,19,17,21,24,30) >trat<-factor(c("t1","t1","t2","t2","t2","t3","t3","t3","t4","t4")) >resultado<-aov(dados~trat) #analise de variancia >shapiro.test(residuals(resultado)) #teste de Shapiro-Wilk 36 H0:H1:H0:H1:
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Teste de Bartlett / R T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Adotando = 5%, o que se pode concluir? ANOVA: fator único Aceito H 0, ou seja, as variâncias dos tratamentos podem ser as mesmas Bartlett test of homogeneity of variances data: dados by trat Bartlett's K-squared = 2.7897, df = 3, p-value = 0.4252 >dados<-c(12,18,14,12,13,19,17,21,24,30) >trat<-factor(c("t1","t1","t2","t2","t2","t3","t3","t3","t4","t4")) >bartlett.test(dados~trat) #teste de Bartlett 37 H 0 : H 1 : nem todas são iguais
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Análise de Variância Quando a ANOVA indica a aceitação de H 0, conclui-se que todas as médias dos tratamentos são iguais entre si, ou melhor, que não há diferenças significativas entre as médias dos tratamentos. Neste caso, encerra-se a análise. No entanto, quando H 0 é rejeitada, a ANOVA não é capaz de identificar quais as médias são diferentes entre si. Basta que apenas uma média seja diferente para que a ANOVA indique a rejeição da H 0. Como descobrir quais médias são diferentes? Através de um Teste de Comparação Múltipla Exemplos: 38 Teste de Tukey Teste de Duncan Teste de Dunnet Teste de Scheffe Teste de Bonferroni Teste de Fisher
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O teste consiste em calcular um valor ( D crít ), acima do qual, a diferença entre duas médias amostrais (em absoluto) é significativamente diferente de zero. Teste de Tukey (teste de comparação múltipla) Utilizado quando se deseja comparar todos os pares de médias de r populações, adotando-se um único nível de significância. H 0 : H 1 : onde representa o valor tabelado (vindo de uma distribuição da amplitude studentizada – "studentized range") associado ao nível de significância adotado. 39
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Distribuição da Amplitude Studentizada r g234567891011121314151617181920 190,024135,041164,258185,575202,210215,769227,166236,966245,542253,151259,979266,165271,812277,003281,803286,263290,426294,328297,997 214,03619,01922,29424,71726,62928,20129,53030,67931,68932,58933,39834,13434,80635,42636,00036,53437,03437,50237,943 38,26010,61912,17013,32414,24114,99815,64116,19916,69117,13017,52617,88718,21718,52218,80519,06819,31519,54619,765 46,5118,1209,1739,95810,58311,10111,54211,92512,26412,56712,84013,09013,31813,53013,72613,90914,08114,24214,394 55,7026,9767,8048,4218,9139,3219,6699,97110,23910,47910,69610,89411,07611,24411,40011,54511,68211,81111,932 65,2436,3317,0337,5567,9728,3188,6128,8699,0979,3009,4859,6539,8089,95110,08410,20810,32510,43410,538 74,9495,9196,5427,0057,3737,6787,9398,1668,3678,5488,7118,8608,9979,1249,2429,3539,4569,5539,645 84,7455,6356,2046,6256,9597,2377,4747,6807,8638,0278,1768,3118,4368,5528,6598,7608,8548,9439,027 94,5965,4285,9576,3476,6576,9157,1347,3257,4947,6467,7847,9108,0258,1328,2328,3258,4128,4958,573 104,4825,2705,7696,1366,4286,6696,8757,0547,2137,3567,4857,6037,7127,8127,9067,9938,0758,1538,226 114,3925,1465,6215,9706,2476,4766,6716,8416,9927,1277,2507,3627,4647,5607,6487,7317,8097,8837,952 124,3205,0465,5025,8366,1016,3206,5076,6706,8146,9437,0607,1667,2657,3567,4417,5207,5947,6647,730 134,2604,9645,4045,7265,9816,1926,3726,5286,6666,7916,9037,0067,1007,1887,2697,3457,4177,4847,548 144,2104,8955,3225,6345,8816,0856,2586,4096,5436,6636,7726,8716,9627,0477,1257,1997,2687,3337,394 154,1674,8365,2525,5565,7965,9946,1626,3096,4386,5556,6606,7566,8456,9277,0037,0747,1417,2047,264 164,1314,7865,1925,4895,7225,9156,0796,2226,3486,4616,5646,6586,7446,8236,8976,9677,0327,0937,151 174,0994,7425,1405,4305,6595,8476,0076,1476,2706,3806,4806,5726,6566,7336,8066,8736,9376,9977,053 184,0714,7035,0945,3795,6035,7875,9446,0816,2016,3096,4076,4966,5796,6556,7256,7916,8546,9126,967 194,0464,6695,0545,3345,5535,7355,8896,0226,1416,2466,3426,4306,5106,5856,6546,7196,7806,8376,891 204,0244,6395,0185,2935,5105,6885,8395,9706,0866,1906,2856,3706,4496,5236,5916,6546,7146,7706,823 253,9424,5274,8855,1445,3475,5135,6555,7785,8865,9836,0706,1506,2246,2926,3556,4146,4696,5226,571 303,8894,4554,7995,0485,2425,4015,5365,6535,7565,8485,9326,0086,0786,1426,2026,2586,3116,3616,407 403,8254,3674,6954,9315,1145,2655,3925,5025,5995,6855,7645,8355,9005,9616,0176,0696,1186,1656,208 603,7624,2824,5944,8184,9915,1335,2535,3565,4475,5285,6015,6675,7285,7845,8375,8865,9315,9746,015 1203,7024,2004,4974,7094,8725,0055,1185,2145,2995,3755,4435,5055,5615,6145,6625,7085,7505,7905,827 3,6434,1204,4034,6034,7574,8824,9875,0785,1575,2275,2905,3485,4005,4485,4935,5355,5745,6115,645 40
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Distribuição da Amplitude Studentizada r g234567891011121314151617181920 117,96926,97632,81937,08240,40843,11945,39747,35749,07150,59251,95753,19454,32355,36156,32057,21258,04458,82459,558 26,0858,3319,79810,88111,73412,43513,02713,53913,98814,38914,74915,07615,37515,65015,90516,14316,36516,57316,769 34,5015,9106,8257,5028,0378,4788,8529,1779,4629,7179,94610,15510,34610,52210,68610,83810,98011,11411,240 43,9265,0405,7576,2876,7067,0537,3477,6027,8268,0278,2088,3738,5248,6648,7938,9149,0279,1339,233 53,6354,6025,2185,6736,0336,3306,5826,8016,9957,1677,3237,4667,5967,7167,8287,9328,0308,1228,208 63,4604,3394,8965,3055,6285,8956,1226,3196,4936,6496,7896,9177,0347,1437,2447,3387,4267,5087,586 73,3444,1654,6815,0605,3595,6065,8155,9976,1586,3026,4316,5506,6586,7596,8526,9397,0207,0977,169 83,2614,0414,5294,8865,1675,3995,5965,7675,9186,0536,1756,2876,3896,4836,5716,6536,7296,8016,869 93,1993,9484,4154,7555,0245,2445,4325,5955,7385,8675,9836,0896,1866,2766,3596,4376,5106,5796,643 103,1513,8774,3274,6544,9125,1245,3045,4605,5985,7225,8335,9356,0286,1146,1946,2696,3396,4056,467 113,1133,8204,2564,5744,8235,0285,2025,3535,4865,6055,7135,8115,9015,9846,0626,1346,2026,2656,325 123,0813,7734,1994,5084,7504,9505,1195,2655,3955,5105,6155,7105,7975,8785,9536,0236,0896,1516,209 133,0553,7344,1514,4534,6904,8845,0495,1925,3185,4315,5335,6255,7115,7895,8625,9315,9956,0556,112 143,0333,7014,1114,4074,6394,8294,9905,1305,2535,3645,4635,5545,6375,7145,7855,8525,9155,9736,029 153,0143,6734,0764,3674,5954,7824,9405,0775,1985,3065,4035,4925,5745,6495,7195,7855,8465,9045,958 162,9983,6494,0464,3334,5574,7414,8965,0315,1505,2565,3525,4395,5195,5935,6625,7265,7865,8435,896 172,9843,6284,0204,3034,5244,7054,8584,9915,1085,2125,3065,3925,4715,5445,6125,6755,7345,7905,842 182,9713,6093,9974,2764,4944,6734,8244,9555,0715,1735,2665,3515,4295,5015,5675,6295,6885,7435,794 192,9603,5933,9774,2534,4684,6454,7944,9245,0375,1395,2315,3145,3915,4625,5285,5895,6475,7015,752 202,9503,5783,9584,2324,4454,6204,7684,8955,0085,1085,1995,2825,3575,4275,4925,5535,6105,6635,714 252,9133,5233,8904,1534,3584,5264,6674,7894,8974,9935,0795,1585,2305,2975,3595,4175,4715,5225,570 302,8883,4863,8454,1024,3014,4644,6014,7204,8244,9175,0015,0775,1475,2115,2715,3275,3795,4295,475 402,8583,4423,7914,0394,2324,3884,5214,6344,7354,8244,9044,9775,0445,1065,1635,2165,2665,3135,358 602,8293,3993,7373,9774,1634,3144,4414,5504,6464,7324,8084,8784,9425,0015,0565,1075,1545,1995,241 1202,8003,3563,6853,9174,0964,2414,3634,4684,5604,6414,7144,7814,8424,8984,9504,9985,0435,0865,126 2,7723,3143,6333,8584,0304,1704,2864,3874,4744,5524,6224,6854,7434,7964,8454,8914,9344,9745,012 41
42
Teste de Tukey (teste de comparação múltipla) T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Total 30395754180 Média 1513192718 njnj 233210 Usando-se o exemplo da ANOVA: 13 15 19 27 42
43
Teste de Tukey (teste de comparação múltipla) T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Total 30395754180 Média 1513192718 njnj 233210 Usando-se o exemplo da ANOVA: 13 15 19 27 aaaa 43
44
Teste de Tukey (teste de comparação múltipla) T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Total 30395754180 Média 1513192718 njnj 233210 Usando-se o exemplo da ANOVA: 13 15 19 27 aaaaaa 44
45
Teste de Tukey (teste de comparação múltipla) T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Total 30395754180 Média 1513192718 njnj 233210 Usando-se o exemplo da ANOVA: 13 15 19 27 aaabaaab (mesma letra – não precisa testar) 45
46
Teste de Tukey (teste de comparação múltipla) T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Total 30395754180 Média 1513192718 njnj 233210 Usando-se o exemplo da ANOVA: 13 15 19 27 aaabaaab 46
47
Teste de Tukey (teste de comparação múltipla) T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Total 30395754180 Média 1513192718 njnj 233210 Usando-se o exemplo da ANOVA: 13 15 19 27 aaabaaab ab 47
48
Teste de Tukey (teste de comparação múltipla) T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 Total 30395754180 Média 1513192718 njnj 233210 Usando-se o exemplo da ANOVA: 13 15 19 27 a ab b T2T1T3T4 102030 T2T1T3T4 T2 T1 T3 T4 48
49
Teste de Tukey / R T1T2T3T4 12141924 18121730 1321 ANOVA: fator único >dados<-c(12,18,14,12,13,19,17,21,24,30) >trat<-factor(c("t1","t1","t2","t2","t2","t3","t3","t3","t4","t4")) >resultado<-aov(dados~trat) #analise de variancia >tukey<-TukeyHSD(resultado,ordered=TRUE, conf.level=0.95) >plot(tukey) 49 13 15 19 27 T2 T1 T3 T4 aaaa a b ab
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