Priscilla Koppe Edson José Pacheco Percy Nohama Stefan Schulz

Apresentação em tema: "Priscilla Koppe Edson José Pacheco Percy Nohama Stefan Schulz"— Transcrição da apresentação:

1 Priscilla Koppe Edson José Pacheco Percy Nohama Stefan Schulz
Modelo para codificação de narrativas clínicas para uma ontologia de domínio utilizando SNOMED CT Priscilla Koppe Edson José Pacheco Percy Nohama Stefan Schulz Pontifícia Universidade Católica do Paraná Universidade de Freiburg, Alemanha

2 INTRODUÇÃO Crescente expansão de informações não estruturada em prontuários eletrônicos Necessidade de implementação de sistemas que lidam com terminologias clínicas Importância da codificação na comunicação eletrônica Criação de regras para codificação

3 OBJETIVO O objetivo da pesquisa é propor uma metodologia para o mapeamento de texto livre, especificamente de narrativas clínicas, para SNOMED CT, através de regras de codificação. Finalidade é a criação de um padrão-ouro para permitir a avaliação de um sistema PLN

4 SNOMED CT SNOMED CT é um vocabulário médico padronizado que define o significado dos termos médicos, visando melhorar a interoperabilidade entre sistemas. Inclui: sinais sintomas doenças procedimentos medicamentos

5 SNOMED CT Os elementos básicos que compõem SNOMED CT são:
Conceito: unidade básica de SNOMED CT. Cada conceito é identificado por um código numérico único, tem um nome único (Fully Specified Name) e um conjunto de termos sinônimos (descriptions). Hierarquias: são 19 as principais (ex: Disorder, Procedure, Substance, Clinical findings, etc.); Relações: associações entre conceitos, usadas para formalmente definir e descrever um conceito

6 SNOMED CT

7 METODOLOGIA 120 sumários de alta oriundos da área de cardiologia do Hospital de Clínicas de Porto Alegre (HCPA) foram selecionados para a efetuação da codificação do conteúdo Utilização do Virginia Tech Browser Desenvolvimento de uma estrutura tabular para relacionar elementos do texto com conceitos SNOMED

8 Hipertensão Arterial Sistêmica
METODOLOGIA Chunk Context Structure Polarity Code Observation Paciente com história de HAS e HIS LIS Hipertensão Arterial Sistêmica DM tipo 2 Diabetes Mellitus Submetido a cat cateterismo que evidenciou lesão suboclusiva na coronária DA. Descendente Anterior Realizado angioplastia. Recomendação na alta: em caso de intercorrência, UNC vir à emergência.

9 METODOLOGIA O processo de codificação foi realizado por dois profissionais da área da saúde. A composição de um guideline foi necessária para dar suporte à criação de um padrão ouro de codificação objetivando a avaliação de um processo computadorizado de mapeamento usando tecnologias de processamento de linguagem natural.

10 GUIDELINE As principais regras implantadas foram:
Somente use a hierarquia “Morphologies” se não houver código correspondente nas hierarquias preferidas: “Clinical Findings” ou “Procedure”; Para codificar resultados de laboratório, utilize a categoria “Observable concepts”; Para codificar um medicamento, utilize o código SNOMED CT referente a Substance ao invés de Product. Ex: digoxin (substance) preferencialmente a digoxin (product)

11 GUIDELINE Para conceitos anatômicos, a SNOMED CT apresenta sempre dois conceitos: “Entire X” e “ X structure ”. Nesses casos, codifique o último, termo mais geral. Ex.: “Right coronary artery structure” ao invés de “Entire right coronary artery”; Utilize conceitos SNOMED CT da categoria “Qualifier value” apenas quando esta referir-se a características importantes de outros conceitos. Ex.: “laterality, episodicity, severity”; Se um termo estiver presente na hierarquia SNOMED CT “Anatomical concepts” e o mesmo conceito estiver nas hierarquias “Clinical Findings” ou “ Procedure”, codifique o termo obtido na “ Clinical Findings”;

12 RESULTADOS Efetividade do Guideline através da avaliação da concordância do trabalho de codificação realizado pelos profissionais 12 sumários de alta foram aleatoriamente selecionados e submetidos ao processo de codificação pelos dois especialistas envolvidos nesta atividade 89% de concordância (Cohen’s Kappa)

13 DISCUSSÕES Avaliação das discordâncias existentes: Termo: “TABAGISTA”

14 Termo: “ELETROCARDIOGRAMA”
DISCUSSÕES Termo: “ELETROCARDIOGRAMA”

15 Termo: “SATURAÇÃO DE OXIGÊNIO”
DISCUSSÕES Termo: “SATURAÇÃO DE OXIGÊNIO”

16 Termo: “PARADA RESPIRATÓRIA”
DISCUSSÕES Termo: “PARADA RESPIRATÓRIA”

17 DISCUSSÕES Termo: “HEMATÚRIA”

18 DISCUSSÕES Avaliação das concordâncias existentes:
Medicamentos (Hierarquia Substance): Aspirina, Sinvastatina, Metoprolol, Captopril, Furosemida, etc. Doenças (Hierarquia Disorder): Hipertensão arterial sistêmica, Diabetes mellitus, Cardiopatia isquêmica, etc. Procedimentos (Hierarquia Procedure): Angioplastia transluminal percutânea, Cateterismo, Rx de tórax, Ecocardiograma, etc. Estruturas anatômicas (Hierarquia Body Structure): Ventrículo direito, Septo cardíaco, Artéria coronária direita, etc.

19 CONCLUSÃO O Guideline desenvolvido abordou tópicos importantes para a obtenção de um resultado satisfatório de codificação manual. Com base no resultado alcançado com o mapeamento manual, uma rotina automatizada de mapeamento está sendo desenvolvida, com base em ferramentas de processamento de linguagem natural (PLN).