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Modelo para codificação de narrativas clínicas para uma ontologia de domínio utilizando SNOMED CT Priscilla Koppe Edson José Pacheco Percy Nohama Stefan.

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1 Modelo para codificação de narrativas clínicas para uma ontologia de domínio utilizando SNOMED CT Priscilla Koppe Edson José Pacheco Percy Nohama Stefan Schulz Pontifícia Universidade Católica do Paraná Universidade de Freiburg, Alemanha

2 INTRODUÇÃO Crescente expansão de informações não estruturada em prontuários eletrônicos Crescente expansão de informações não estruturada em prontuários eletrônicos Necessidade de implementação de sistemas que lidam com terminologias clínicas Necessidade de implementação de sistemas que lidam com terminologias clínicas Importância da codificação na comunicação eletrônica Importância da codificação na comunicação eletrônica Criação de regras para codificação Criação de regras para codificação

3 OBJETIVO O objetivo da pesquisa é propor uma metodologia para o mapeamento de texto livre, especificamente de narrativas clínicas, para SNOMED CT, através de regras de codificação. O objetivo da pesquisa é propor uma metodologia para o mapeamento de texto livre, especificamente de narrativas clínicas, para SNOMED CT, através de regras de codificação. Finalidade é a criação de um padrão-ouro para permitir a avaliação de um sistema PLN Finalidade é a criação de um padrão-ouro para permitir a avaliação de um sistema PLN

4 SNOMED CT SNOMED CT é um vocabulário médico padronizado que define o significado dos termos médicos, visando melhorar a interoperabilidade entre sistemas. SNOMED CT é um vocabulário médico padronizado que define o significado dos termos médicos, visando melhorar a interoperabilidade entre sistemas. Inclui: sinais Inclui: sinais sintomas sintomas doenças doenças procedimentos procedimentos medicamentos medicamentos

5 SNOMED CT Os elementos básicos que compõem SNOMED CT são: Os elementos básicos que compõem SNOMED CT são: Conceito: unidade básica de SNOMED CT. Cada conceito é identificado por um código numérico único, tem um nome único (Fully Specified Name) e um conjunto de termos sinônimos (descriptions). Conceito: unidade básica de SNOMED CT. Cada conceito é identificado por um código numérico único, tem um nome único (Fully Specified Name) e um conjunto de termos sinônimos (descriptions). Hierarquias: são 19 as principais (ex: Disorder, Procedure, Substance, Clinical findings, etc.); Hierarquias: são 19 as principais (ex: Disorder, Procedure, Substance, Clinical findings, etc.); Relações: associações entre conceitos, usadas para formalmente definir e descrever um conceito Relações: associações entre conceitos, usadas para formalmente definir e descrever um conceito

6 SNOMED CT

7 METODOLOGIA 120 sumários de alta oriundos da área de cardiologia do Hospital de Clínicas de Porto Alegre (HCPA) foram selecionados para a efetuação da codificação do conteúdo 120 sumários de alta oriundos da área de cardiologia do Hospital de Clínicas de Porto Alegre (HCPA) foram selecionados para a efetuação da codificação do conteúdo Utilização do Virginia Tech Browser Utilização do Virginia Tech Browser Desenvolvimento de uma estrutura tabular para relacionar elementos do texto com conceitos SNOMED Desenvolvimento de uma estrutura tabular para relacionar elementos do texto com conceitos SNOMED

8 METODOLOGIA ChunkContextStructurePolarityCodeObservation Paciente com história de HAS eHISLIS Hipertensão Arterial Sistêmica DM tipo 2HISLIS Diabetes Mellitus Submetido a cat cateterismo que evidenciou lesão suboclusiva na coronária DA Descendente Anterior Realizado angioplastia Recomendação na alta: em caso de intercorrência,UNC vir àUNC emergência.UNC

9 METODOLOGIA O processo de codificação foi realizado por dois profissionais da área da saúde. O processo de codificação foi realizado por dois profissionais da área da saúde. A composição de um guideline foi necessária para dar suporte à criação de um padrão ouro de codificação objetivando a avaliação de um processo computadorizado de mapeamento usando tecnologias de processamento de linguagem natural. A composição de um guideline foi necessária para dar suporte à criação de um padrão ouro de codificação objetivando a avaliação de um processo computadorizado de mapeamento usando tecnologias de processamento de linguagem natural.

10 GUIDELINE As principais regras implantadas foram: As principais regras implantadas foram: Somente use a hierarquia Morphologies se não houver código correspondente nas hierarquias preferidas:Clinical Findings ou Procedure; Somente use a hierarquia Morphologies se não houver código correspondente nas hierarquias preferidas:Clinical Findings ou Procedure; Para codificar resultados de laboratório, utilize a categoria Observable concepts; Para codificar resultados de laboratório, utilize a categoria Observable concepts; Para codificar um medicamento, utilize o código SNOMED CT referente a Substance ao invés de Product. Ex: digoxin (substance) preferencialmente a digoxin (product) Para codificar um medicamento, utilize o código SNOMED CT referente a Substance ao invés de Product. Ex: digoxin (substance) preferencialmente a digoxin (product)

11 GUIDELINE Para conceitos anatômicos, a SNOMED CT apresenta sempre dois conceitos: Entire X e X structure. Nesses casos, codifique o último, termo mais geral. Ex.: Right coronary artery structure ao invés de Entire right coronary artery; Para conceitos anatômicos, a SNOMED CT apresenta sempre dois conceitos: Entire X e X structure. Nesses casos, codifique o último, termo mais geral. Ex.: Right coronary artery structure ao invés de Entire right coronary artery; Utilize conceitos SNOMED CT da categoria Qualifier value apenas quando esta referir-se a características importantes de outros conceitos. Ex.: laterality, episodicity, severity; Utilize conceitos SNOMED CT da categoria Qualifier value apenas quando esta referir-se a características importantes de outros conceitos. Ex.: laterality, episodicity, severity; Se um termo estiver presente na hierarquia SNOMED CT Anatomical concepts e o mesmo conceito estiver nas hierarquias Clinical Findings ou Procedure, codifique o termo obtido na Clinical Findings; Se um termo estiver presente na hierarquia SNOMED CT Anatomical concepts e o mesmo conceito estiver nas hierarquias Clinical Findings ou Procedure, codifique o termo obtido na Clinical Findings;

12 RESULTADOS Efetividade do Guideline através da avaliação da concordância do trabalho de codificação realizado pelos profissionais Efetividade do Guideline através da avaliação da concordância do trabalho de codificação realizado pelos profissionais 12 sumários de alta foram aleatoriamente selecionados e submetidos ao processo de codificação pelos dois especialistas envolvidos nesta atividade 12 sumários de alta foram aleatoriamente selecionados e submetidos ao processo de codificação pelos dois especialistas envolvidos nesta atividade 89% de concordância (Cohens Kappa) 89% de concordância (Cohens Kappa)

13 DISCUSSÕES Avaliação das discordâncias existentes: Avaliação das discordâncias existentes: Termo: TABAGISTA

14 DISCUSSÕES Termo: ELETROCARDIOGRAMA

15 DISCUSSÕES Termo: SATURAÇÃO DE OXIGÊNIO

16 DISCUSSÕES Termo: PARADA RESPIRATÓRIA

17 DISCUSSÕES Termo: HEMATÚRIA

18 DISCUSSÕES Avaliação das concordâncias existentes: Avaliação das concordâncias existentes: Medicamentos (Hierarquia Substance): Aspirina, Sinvastatina, Metoprolol, Captopril, Furosemida, etc. Medicamentos (Hierarquia Substance): Aspirina, Sinvastatina, Metoprolol, Captopril, Furosemida, etc. Doenças (Hierarquia Disorder): Hipertensão arterial sistêmica, Diabetes mellitus, Cardiopatia isquêmica, etc. Doenças (Hierarquia Disorder): Hipertensão arterial sistêmica, Diabetes mellitus, Cardiopatia isquêmica, etc. Procedimentos (Hierarquia Procedure): Angioplastia transluminal percutânea, Cateterismo, Rx de tórax, Ecocardiograma, etc. Procedimentos (Hierarquia Procedure): Angioplastia transluminal percutânea, Cateterismo, Rx de tórax, Ecocardiograma, etc. Estruturas anatômicas (Hierarquia Body Structure): Ventrículo direito, Septo cardíaco, Artéria coronária direita, etc. Estruturas anatômicas (Hierarquia Body Structure): Ventrículo direito, Septo cardíaco, Artéria coronária direita, etc.

19 CONCLUSÃO O Guideline desenvolvido abordou tópicos importantes para a obtenção de um resultado satisfatório de codificação manual. O Guideline desenvolvido abordou tópicos importantes para a obtenção de um resultado satisfatório de codificação manual. Com base no resultado alcançado com o mapeamento manual, uma rotina automatizada de mapeamento está sendo desenvolvida, com base em ferramentas de processamento de linguagem natural (PLN). Com base no resultado alcançado com o mapeamento manual, uma rotina automatizada de mapeamento está sendo desenvolvida, com base em ferramentas de processamento de linguagem natural (PLN).


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