Estrutura de Proteínas

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1 Estrutura de Proteínas

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3 Insulina

4 Aminoácidos: componentes das proteínas
O DNA é uma molécula informacional: cada códon (sequência de três nucleotídeos) codifica um único residuo de aminoácido na proteína. ala asn asp cys gln arg glu gly phe his ile leu met lys pro ser thr tyr val trp 4

5 Como as proteínas são construídas
Os aminoácidos são unidos por ligações peptídicas com a liberação de uma molécula de água e passam a ser denominados resíduos A cadeia polipeptídica se dobra devido aos graus de liberdade da ligação e dos resíduos originando uma estrutura tridimensional funcional phe ile ile tyr val val val φ ψ ala val ile tyr ile phe trp 5

6 Estrutura e função de proteínas
As proteínas são moléculas essenciais para a estrutura e função das células, desempenhando ampla variedade de funções biológicas A função das proteínas é totalmente dependente de sua estrutura tridimensional Enzimas são proteínas que catalizam reações químicas no metabolismo Anticorpo IgG1 Adenilato kinase Hemoglobina Insulina Colágeno 6

7 Estrutura Primaria

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11 Estruturas Secundarias
Pontes de Hidrogênio

12 a-Helice

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18 Estrutura Beta

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20 Estrutura Beta antiparalela

21 Estrutura Beta paralela

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26 Estrutura Volta

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28 Proporções Relativas dos diversos AA nas Estruturas 2as.

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30 Estrutura Terciaria

31 Mioglobina Grupo Heme Grupo Prostético

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33 Miniproteínas Nome Classificação PDB ID Nº de Resíduos Figura
Stable Mini-Protein A Domain, Z34C Ponte Dissulfeto 1ZDD 34 Avian Pancreatic Polypeptide Íon Complexante 1PPT 36 TRP-Zipper Empilhamento Aromático 1LE0 12 TRP-Cage Núcleo Hidrofóbico 1L2Y 20 Villin Headpiece Núcleo Hidrofóbico / D-Aminoácido 1VII 35

34 Instantâneos da simulação por dinâmica molecular do folding da miniproteína villin headpiece (Duan e Kollman, 1998)

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36 Diferentes “porções” tridimensionais dentro de
Domínios Diferentes “porções” tridimensionais dentro de uma mesma cadeia polipeptídica 2 domínios  cadeia única

37 Estrutura Quaternária
Arranjos de várias cadeias polipeptídicas com estruturas Terciárias definidas. Presente em proteínas Globulares e Fibrosas Dímero

38 Tetrâmero globular  Hemoglobina

39 Catálise de Reação Química: Enzima
+ substratos produtos 39

40 Vírus

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42 Enovelamento ( Pentapeptideo )

43 Resíduos de Aminoácidos modificados

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45 Banco de Dados PDB A Resource for Studying Biological Macromolecules
The PDB archive contains information about experimentally-determined structures of proteins, nucleic acids, and complex assemblies. As a member of the wwPDB, the RCSB PDB curates and annotates PDB data according to agreed upon standards. The RCSB PDB also provides a variety of tools and resources. Users can perform simple and advanced searches based on annotations relating to sequence, structure and function. These molecules are visualized, downloaded, and analyzed by users who range from students to specialized scientists.

46 FIM

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